肾乳头状细胞癌中差异表达的mRNA可作为肿瘤预后的潜在标志物

发布时间：2020-08-17 12:08

【摘要】：背景肾细胞癌中临床最常见的病理类型为透明细胞癌(ccRCC),在过去的一段时间中,国内外科研机构及医药公司对肾癌药物的研究及开发就主要集中在透明细胞癌。而肾乳头状细胞癌(pRCC)是第二大常见病理类型的肾癌,约占肾细胞癌的10%-15%。临床常用的各种靶向药物主要针对的是肾透明细胞癌而开发,没有专门针对肾乳头状细胞癌的靶向药物。目前,临床科研已经进入高通量测序时代,通过对癌组织及癌旁组织进行基因序列分析,对比发现癌组织中较正常组织中高表达或低表达的基因,通过筛选找到其有效的基因通路,寻找有效的药物通路靶点,从而进行药物的研发应用。因此,通过对肾乳头状细胞癌中差异表达mRNA的分析,从而进行有效差异基因的筛选,寻找其表达的有效通路,有利于后续靶向药的研究。目的通过对肾乳头状细胞癌中mRNA表达差异的变化,并筛选多种基因及其相关通路,探讨其与预后的关系。方法肾乳头状细胞癌的RNA序列及患者的临床信息从TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中下载,从中筛选出在癌组织和癌旁组织中差异表达的mRNA,并对其功能和富集的通路进行研究。然后根据筛选出的靶基因构建风险评分模型,通过ROC分析确定患者分类风险水平的最优值。通过单因素Cox回归模型来评估肾乳头状细胞癌中mRNA的表达与患者预后所存在的关系。最终,在全部数据集和检验数据集中进行再次的验证确认。结果1、CCNB2、IGF2BP3、KIF18A、PTTG1 和 BUB1 这五种差异标的 mRNA 与患者的生存预后显著相关。2、CCNB2、IGF2BP3、KIF18A、PTTG1 和 BUB1这五种 mRNA 所参与的通路调节,可为靶向药的研发提供新的靶点。3、CCNB2、IGF2BP3、KIF18A、PTTG1等基因高表达的患者预后较差。4、BUB1基因高表达的患者的预后较好。结论肾乳头状细胞癌中五种差异标的mRNA(CCNB2、IGF2BP3、KIF18A、PTTGl、BUB1)可作为患者预后判断的一种潜在标志物,并可对其所在的通路进行研究提供新的靶向药物研究方案。
【学位授予单位】：山东大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R737.11
【图文】：

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本文编号：2795301