糖尿病肾病关键ceRNA网络构建分析及H2k2-miR-449a/b-Trim11调控系膜细胞增殖的研究

发布时间：2020-12-29 23:22

　　第一部分:糖尿病肾病关键ce RNA网络构建分析及验证目的检测糖尿病肾病小鼠差异表达的m RNA与lncRNA,构建糖尿病肾病关键ce RNA相互作用网络;筛选可能参与糖尿病肾病系膜增生的关键ce RNA对。方法通过高通量测序技术,获得在糖尿病肾病小鼠肾脏组织中差异表达的m RNA及lncRNA;通过Bio Mart去除在ENSEMBLE数据库中未收录的RNA;通过Mi Randa及Star Base数据库预测糖尿病肾病lncRNA-miRNA-m RNA相互作用网络;利用hypergeometric test构建糖尿病肾病差异ce RNA网络、KEGG及GO分析差异ce RNA网络;分析中心性参数（Degree和betweenness）,构建糖尿病肾病关键ce RNA网络;应用q RT-PCR检测关键ce RNA网络在糖尿病肾病小鼠肾脏组织及高低糖培养系膜细胞中的表达。结果应用二代测序技术,得到差异表达m RNA及lncRNA,通过hypergeometric test保留了具有显著共享关系的相互作用对,在前15%的degree与betweenness的交集有中3个lncRNA和5个... 

【文章来源】：重庆医科大学重庆市

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

RNA-seq检测正常小鼠和糖尿病肾病模型小鼠肾脏组织差异mRNAs和lncRNAs

构建DN差异ceRNA网络Fig1.2ConstructionofceRNAnetworkofDN

图 1.3 DN ceRNA 核心网络构建Fig1.3 Construction of key ceRNAnetwork of DNAGO and KEGG pathway analysis of mRNAs in the DN-related ceRNAnetwork (adjusted q<0.05). B The centrality analysis of the DN-related ceRNAnetwork with the high topologicalfeatures-degree and betweenness. C The predicted interaction among with 5 both high degree andbetweenness RNAs and their shared miRNAs.3.4 验证糖尿病肾病关键 ceRNA 网络分子在 DN 肾脏组织与细胞中表达进一步，我们运用 qRT-PCR 验证核心网络 ceRNA 分子（H2k2, Gm10073,Gm19963, Trim11, Ormdl3）在 DN 及对照小鼠肾脏组织的表达情况。结果显示，H2k2, Gm10073, Trim11 和 Ormdl3 表达趋势与 RNA-seq 结果一致（图 1.4 和


本文编号：2946529