膀胱癌免疫基因组学分型及其临床意义
发布时间:2021-09-01 16:17
目的通过基因组学分析建立膀胱癌免疫分型,并进一步探索其临床应用价值。方法从癌症基因组图谱研究网络(TCGA)数据库下载409例膀胱癌患者的基因表达谱及生存信息,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERSORT分别评估各样本中免疫微环境的组成及免疫细胞的分布;通过R软件进行富集分析;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验。结果将患者分为高、中、低免疫组,三组间预后具有统计学差异;高免疫组所包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,大部分人类白细胞抗原(HLA)基因及PD-L1的表达最高;且该组中CD8+T细胞含量最高,M0巨噬细胞和未活化的记忆性CD4+T细胞最低,基因主要富集在免疫相关功能及通路上。结论膀胱癌免疫分型能够判断患者的预后,高免疫组患者的预后最好,并且具有较高的免疫原性及抗肿瘤免疫活性。
【文章来源】:实用医学杂志. 2020,36(11)北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
膀胱癌各免疫分型的生存曲线
肿瘤的发生、发展过程与宿主的免疫系统密切相关,免疫系统具有识别和消灭肿瘤细胞的功能,但是肿瘤细胞能够通过免疫逃逸和免疫抑制躲避免疫系统的监控,目前免疫治疗主要包括克服肿瘤的免疫耐受以及激活效应细胞的杀伤作用。既往研究[15-18]发现,在三阴乳腺癌、结肠癌、头颈部鳞癌等多种肿瘤中通过对免疫特征进行评估而制定的免疫分型有助于指导治疗及改善患者的临床预后。本研究通过分析TCGA数据库获得的基因表达数据,对膀胱癌患者进行免疫分型,并进一步分析了各型的免疫特征与预后之间的关系。ICIs的疗效有赖于肿瘤的免疫原性,目前预测PD-1抗体疗效的标志物主要包括:肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes,TIL)、肿瘤细胞PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷、错配修复缺陷/微卫星高度不稳定等[19]。肿瘤微环境是指肿瘤在其发生、发展过程中所处的内环境,由肿瘤细胞本身、间质细胞、微血管、微淋巴管、组织液、众多细胞因子及少量浸润细胞等共同构成,肿瘤微环境在PD-L1的调节中起着重要作用,其构成与ICIs疗效密切相关[20]。本研究通过ESTIMATE分析肿瘤微环境发现高免疫组包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,并且大部分HLA基因高表达,与其他两组相比具有更强的免疫原性,同时单基因分析发现高免疫组的PD-L1表达明显高于其他两组,提示高免疫组更适合于免疫治疗。
ICIs的疗效有赖于肿瘤的免疫原性,目前预测PD-1抗体疗效的标志物主要包括:肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes,TIL)、肿瘤细胞PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷、错配修复缺陷/微卫星高度不稳定等[19]。肿瘤微环境是指肿瘤在其发生、发展过程中所处的内环境,由肿瘤细胞本身、间质细胞、微血管、微淋巴管、组织液、众多细胞因子及少量浸润细胞等共同构成,肿瘤微环境在PD-L1的调节中起着重要作用,其构成与ICIs疗效密切相关[20]。本研究通过ESTIMATE分析肿瘤微环境发现高免疫组包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,并且大部分HLA基因高表达,与其他两组相比具有更强的免疫原性,同时单基因分析发现高免疫组的PD-L1表达明显高于其他两组,提示高免疫组更适合于免疫治疗。图3 各免疫分型中HLA及PD-L1、CTLA-4的基因表达水平及组间差异
本文编号:3377296
【文章来源】:实用医学杂志. 2020,36(11)北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
膀胱癌各免疫分型的生存曲线
肿瘤的发生、发展过程与宿主的免疫系统密切相关,免疫系统具有识别和消灭肿瘤细胞的功能,但是肿瘤细胞能够通过免疫逃逸和免疫抑制躲避免疫系统的监控,目前免疫治疗主要包括克服肿瘤的免疫耐受以及激活效应细胞的杀伤作用。既往研究[15-18]发现,在三阴乳腺癌、结肠癌、头颈部鳞癌等多种肿瘤中通过对免疫特征进行评估而制定的免疫分型有助于指导治疗及改善患者的临床预后。本研究通过分析TCGA数据库获得的基因表达数据,对膀胱癌患者进行免疫分型,并进一步分析了各型的免疫特征与预后之间的关系。ICIs的疗效有赖于肿瘤的免疫原性,目前预测PD-1抗体疗效的标志物主要包括:肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes,TIL)、肿瘤细胞PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷、错配修复缺陷/微卫星高度不稳定等[19]。肿瘤微环境是指肿瘤在其发生、发展过程中所处的内环境,由肿瘤细胞本身、间质细胞、微血管、微淋巴管、组织液、众多细胞因子及少量浸润细胞等共同构成,肿瘤微环境在PD-L1的调节中起着重要作用,其构成与ICIs疗效密切相关[20]。本研究通过ESTIMATE分析肿瘤微环境发现高免疫组包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,并且大部分HLA基因高表达,与其他两组相比具有更强的免疫原性,同时单基因分析发现高免疫组的PD-L1表达明显高于其他两组,提示高免疫组更适合于免疫治疗。
ICIs的疗效有赖于肿瘤的免疫原性,目前预测PD-1抗体疗效的标志物主要包括:肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes,TIL)、肿瘤细胞PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷、错配修复缺陷/微卫星高度不稳定等[19]。肿瘤微环境是指肿瘤在其发生、发展过程中所处的内环境,由肿瘤细胞本身、间质细胞、微血管、微淋巴管、组织液、众多细胞因子及少量浸润细胞等共同构成,肿瘤微环境在PD-L1的调节中起着重要作用,其构成与ICIs疗效密切相关[20]。本研究通过ESTIMATE分析肿瘤微环境发现高免疫组包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,并且大部分HLA基因高表达,与其他两组相比具有更强的免疫原性,同时单基因分析发现高免疫组的PD-L1表达明显高于其他两组,提示高免疫组更适合于免疫治疗。图3 各免疫分型中HLA及PD-L1、CTLA-4的基因表达水平及组间差异
本文编号:3377296
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