前列腺癌相关氨基酸变异及SNP数据库构建及功能注释

发布时间：2021-10-16 12:00

　　前列腺癌是一种发生在男性生殖系统中的十分常见的恶性肿瘤，它的遗传机制尚未明确。最近几十年，大量文献报道了前列腺癌的分子遗传变异信息，包括突变、缺失、插入、重复、扩增、甲基化和多态性等，对于揭示前列腺癌的生物学机制具有重要的意义。然而，获取这些数据却是一个非常耗时的过程，目前还没有一个专注于搜集前列腺癌相关变异信息的数据库平台，因此这类数据库的建立就显得尤为迫切。为了使研究人员能够便捷的获取前列腺癌相关的变异数据，我们阅读了大量文献，搜集并整理了这些数据，最终创建了一个可在线访问的数据库PCaMDB（http://www.ibio-cn.org/PCAmutbase/home.php/）。该数据库基于目前公认的遗传变异数据平台LOVD系统，按照基因型到表型的模式，集合了文献中报道的前列腺癌病人信息和变异信息。这些数据可供用户在线查询及本地下载，同时用户还可以提交自己研究发现的新的变异信息。此外，我们还创建了一个SNP数据库，用于搜集前列腺癌相关的单核苷酸多态性数据。为了探究这些变异数据和前列腺癌之间的联系，我们选择了其中五个变异数据较多的蛋白，从蛋白质稳定性和保守性的角度对这些突变位点进... 

【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

本课题工作流程安排

OMIM#176807中和前列腺癌相关的基因位点

目前已经使用LOVD建立的数据库网址及基因和变异信息统计

【参考文献】：
博士论文
[1]广东、重庆、山东、南昌散发性乳腺癌易感基因多态性筛选及验证的研究[D]. 劳海苗.南方医科大学 2012
[2]PEITC抗前列腺癌作用机制的分析研究[D]. 殷平.天津医科大学 2010

硕士论文
[1]前列腺癌演变过程中的等位基因失衡[D]. 张海峰.山西医科大学 2010



本文编号：3439772