肌层浸润性膀胱尿路上皮癌MDM2扩增与PD-1/PD-L1抑制剂耐药机制TCGA数据库资料分析
发布时间:2022-12-10 20:51
目的免疫检测点抑制剂能延长晚期膀胱尿路上皮癌患者的生存,但仍面临耐药问题,其机制是目前的研究热点。本研究通过分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肌层浸润性膀胱尿路上皮癌的鼠双微基因2(murine double minute 2,MDM2)扩增情况及相关基因表达,寻找免疫检查点抑制剂耐药的潜在机制。方法于2019-04-01从TCGA数据库下载自建库至2014-11-15肌层浸润性膀胱尿路上皮癌数据包"bladder cancer(TCGA,cell2017)",含临床信息、基因拷贝数变异与核糖核酸测序数据,共412例患者,其中408例患者有基因拷贝数信息。对比MDM2扩增(36例)和未扩增(372例)的2组患者间临床特征和预后差异;利用cBioportal和DAVID6.8在线分析mRNA表达与MDM2扩增相关基因,并进行功能富集分析;进一步采用cBioportal和GeneSpringGX软件筛选出MDM2扩增和未扩增组间表达有差异的基因。结果肌层浸润性膀胱尿路上皮癌中MDM2扩增发生率为8.8%(36/408)。MDM2基因扩增组...
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 数据来源
1.2 研究方法
1.2.1 临床资料分析
1.2.2 共表达基因功能富集分析
1.2.3 差异表达基因分析
1.3 统计学方法
2 结果
2.1 MDM2基因扩增发生率及临床病理特征
2.2 共表达基因分析及功能富集分析
2.3 差异表达基因鉴定
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]程序性细胞死亡受体1抗体耐药机制研究进展[J]. 辛道,王峰. 中华肿瘤杂志. 2018 (08)
本文编号:3717495
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【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 数据来源
1.2 研究方法
1.2.1 临床资料分析
1.2.2 共表达基因功能富集分析
1.2.3 差异表达基因分析
1.3 统计学方法
2 结果
2.1 MDM2基因扩增发生率及临床病理特征
2.2 共表达基因分析及功能富集分析
2.3 差异表达基因鉴定
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]程序性细胞死亡受体1抗体耐药机制研究进展[J]. 辛道,王峰. 中华肿瘤杂志. 2018 (08)
本文编号:3717495
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