鉴定中枢基因预测膀胱尿路上皮癌患者预后
发布时间:2023-10-28 16:19
目的:膀胱尿路上皮癌(BLCA)在全世界具有高的发病率和死亡率。确定其癌症发生和发展的确切机制至关重要。目前,没有一种基因被确定为BLCA的确切原因。因此,没有可接受的分子标志来预测BLCA的预后。这种知识的短缺也阻碍了针对BLCA的新疗法的开发。本研究旨在鉴定参与BLCA起始和进展的潜在基因。方法:我们构建了加权基因共表达网络(WGCNA),其中基因模块与BLCA中的临床特征相关(n=414)。在建立的25个模块中,发现了浅绿色模块与癌症风险之间的高度相关性。在这些浅绿色模块中,鉴定了23个用于转移风险的网络中枢基因,其中EGR2基因也是在WGCNA中鉴定的模块基因构建的蛋白质-蛋白质相互作用网络中的中枢节点。结果:EGR2与存活率呈负相关,基因集富集分析(GSEA)显示了四组ABC转运蛋白基因,ECM受体相互作用,粘着斑,白细胞跨内皮迁移参与了BLCA。结论:EGR2基因在膀胱癌基因调控网络中处于核心位置,且EGR2基因的表达在膀胱癌不同预后中有显著差异性,可以作为膀胱癌发生发展以及预后判断的重要指标,可能作为膀胱癌治疗的新靶点。这将有助于更好地预测BLCA的预后,这种研究也可用于...
【文章页数】:75 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
英汉缩略词对照表
前言
1 对象与方法
1.1 实验对象
1.2 表达谱数据的处理
1.3 差异基因的筛选
1.4 加权基因共表达网络分析
2 结果
2.1 表达谱数据预处理
2.2 BLCA差异表达基因
2.3 BLCA加权基因共表达网络分析
3 讨论
3.1 BLCA加权基因共表达网络分析的意义
3.2 EGR2 与膀胱尿路上皮癌
4 结论
参考文献
综述
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文目录
致谢
本文编号:3857343
【文章页数】:75 页
【学位级别】:硕士
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ABSTRACT
英汉缩略词对照表
前言
1 对象与方法
1.1 实验对象
1.2 表达谱数据的处理
1.3 差异基因的筛选
1.4 加权基因共表达网络分析
2 结果
2.1 表达谱数据预处理
2.2 BLCA差异表达基因
2.3 BLCA加权基因共表达网络分析
3 讨论
3.1 BLCA加权基因共表达网络分析的意义
3.2 EGR2 与膀胱尿路上皮癌
4 结论
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综述
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