外周血B细胞mRNA表达在IgA肾病发病及Gd-IgA1产生中的初步研究

发布时间：2024-05-07 03:02

　　目的IgA肾病是我国最常见的原发性肾小球疾病,也是导致青壮年病人进入尿毒症期的最主要病因,给国家和患者家庭带来了沉重的负担,因此明确IgA肾病的发病机制,提出针对性治疗方法尤为重要。目前基因芯片技术已被广泛应用于生物医学研究,为明确各种疾病的基因调控机制、研制针对性治疗方案提供了重要的技术支持。已有的多个大型研究利用基因芯片技术证实在IgA肾病患者中存在多种差异表达的基因,但各研究所提出的差异表达的基因和通路各有不同。本研究旨在从高通量基因表达数据库中提取、综合关于IgA肾病中mRNA差异表达基因的芯片数据,并利用深度测序技术,在IgA肾病患者外周血B细胞中验证mRNA差异表达的基因,并进一步分析这些基因与血清半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子水平的相关性。方法从高通量基因表达库(GEO)中检索符合纳入标准的IgA肾病患者mRNA微阵列数据集,使用鲁棒多芯片平均算法(RMA)将原始数据标准化,合并不同套(different series)数据后,使用ComBat法去除批次效应,最后使用R语言v3.2.2分析处理数据。利用基因本体集(Gene Ontology,GO)、基因组百科...

【文章页数】：43 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
Abstract
缩略语/符号说明
前言
    研究现状、成果
    研究目的、方法
对象和方法
    1.1 试验对象
        1.1.1 验证试验的研究对象
        1.1.2 单个基因芯片研究的纳入标准
    1.2 数据分析方法
        1.2.1 基因芯片数据处理方法
        1.2.2 基因差异性表达的分析
        1.2.3 差异表达基因的功能分析
    1.3 试验方法
        1.3.1 分离B淋巴细胞
        1.3.2 RNA提取与逆转录PCR(RT-PCR)
        1.3.3 深度测序
        1.3.4 定量检测半乳糖缺乏的IgA1(Gd-IgA1)分子
        1.3.5 mRNA基因深度测序的数据统计分析
结果
    2.1 微阵列数据分析的结果
        2.1.1 纳入研究的特征
        2.1.2 IgA肾病患者中基因的差异性表达
        2.1.3 差异表达的mRNA基因的功能分析
    2.2 差异表达基因的临床验证结果
        2.2.1 验证试验中出现的差异表达的mRNA基因
        2.2.2 差异基因与Gd-IgA1分子水平之间的关系
讨论
结论
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
综述 半乳糖缺乏的IgA1分子及其与IgA肾病发病机制关系的研究进展
    综述参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3966725