基于高通量转录组测序技术的无精子症患者睾丸组织比较转录组分析

发布时间：2025-01-15 10:49

　　 本研究探讨不同程度无精子症患者睾丸组织的转录组差异,了解差异表达基因(DEG)在功能、分类和代谢通路的不同,揭示无精子症患者精子发生分子机制,为促进男性不育研究的发展提供理论基础.选取1份非梗阻性无精子症和4份梗阻性无精子症患者睾丸组织样品(从无精子到有精子),进行RNA提取和文库构建,利用Illumina HiSeqTM2500高通量测序,构建无精子症患者睾丸组织转录组文库,并用生物信息学方法进行分析.结果发现,样品比对基因组数据库的平均比对率为94.38%,共检测2 242个属于预测新的蛋白质编码基因的转录本.得到差异表达基因统计结果为:NOA vs. OA1基因上调8 045,下调1 150;OA1 vs. OA2基因上调1 538,下调420;OA2 vs. OA3基因上调1 275,下调1 690;OA3 vs. OA4基因上调1 834,下调1 853.比较5例无精子症睾丸组织的差异基因KEGG,主要富集在RNA降解通路、基底细胞瘤通路、癌通路、黑色素生成通路和调节干细胞多能性等信号通路. PRM1、PRM2、TNP1、UBXN6、CXCL16、NUPR2、CCDC136和...

【文章页数】：13 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 睾丸组织
    1.2 RNA提取、文库构建及测序
    1.3 转录组数据分析
2 结果与分析
    2.1 测序质量评估及基本数据分析
    2.2 测序结果比对分析
    2.3 差异表达基因分析
    2.4 时间序列分析
    2.5 差异表达基因的GO富集与KEGG通路分析
    2.6 融合基因
3 讨论
    3.1 睾丸组织转录组特点
    3.2 差异表达基因的GO注释及KEGG分析
    3.3 融合基因分析



本文编号：4027290