膀胱尿路上皮癌组织lincRNA差异表达及机制探讨

发布时间：2017-10-03 08:14

  本文关键词：膀胱尿路上皮癌组织lincRNA差异表达及机制探讨

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【摘要】：目的筛选膀胱尿路上皮癌与癌旁组织中差异表达长链基因间非编码RNA(long intergenic noncoding RNA,lincRNA),并探讨其可能作用机制。方法收集2011-01-04-2011-02-18中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科4例膀胱尿路上皮癌与癌旁组织标本并应用Trizol提取总RNA,应用基因芯片筛选差异表达的lincRNAs及mRNAs,应用生物信息学分析差异表达lincRNAs和mRNAs特征,应用EZH2抗体和SUZ12抗体进行RNA免疫沉淀筛选与多梳抑制复合物2(PRC2)相互作用的lincRNAs。结果基因芯片筛选发现,共376个lincRNAs及1 284个mRNAs在膀胱尿路上皮癌组织与癌旁组织中存在表达差异(差异倍数≥2.0倍,P0.05)。lincRNAs表达异常在第1、2、7号染色体最常见,mRNAs差异表达基因的信号通路分析显示,参与细胞间黏附、钙离子信号通路、MAPK信号通路和细胞因子间受体相互作用的基因改变最为明显。与非免疫血清IgG组相比,应用EZH2抗体和SUZ12抗体进行的RNA免疫沉淀提示,HOTAIR分别富集(11.2±1.7)和(9.6±1.1)倍,BX640973分别富集(36.3±2.1)和(14.7±0.8)倍,NR_024344分别富集(30.2±3.5)和(7.7±1.2)倍,LINC312分别富集(5.1±0.4)和(5.7±0.5)倍,NR_036444分别富集(29.5±1.8)和(11.2±0.6)倍,MALAT1分别富集(12.9±1.6)和(25.1±1.5)倍,MEG3分别富集(13.2±0.6)和(4.0±1.3)倍,差异均有统计学意义,P值均0.05。结论膀胱癌中大量lincRNAs和mRNAs表达发生改变,部分lincRNAs通过与PRC2复合物相互作用发挥功能。
【作者单位】： 中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科;
【关键词】： 膀胱肿瘤 长链基因间非编码RNA PRC复合物 RNA-蛋白质相互作用
【基金】：国家自然科学基金(81172431;81272808;U1301221;81472381;81472384)
【分类号】：R737.14
【正文快照】： 中华肿瘤防治杂志,2015,22(6):421-426Chin J Cancer Prev Treat,2015,22(6):421-426表观遗传修饰在膀胱癌的进展和转移中发挥重要作用[1]。长链基因间非编码RNA(long intergenicnoncoding RNA,lincRNA)是转录区域不与蛋白编码基因区域重叠的非编码RNA亚类,最近研究表明,lincR

【参考文献】

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【共引文献】

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7 张f蘳，

本文编号：964128