Prohibitin在缺血性脑损伤中的神经保护作用及机制研究

发布时间：2022-12-10 21:57

　　研究目的:通过生物信息学方法分析缺血性脑卒中后的差异表达基因,探究该基因在缺血性脑卒中的作用靶点以及具体的机制。研究方法:从GEO数据库中下载GSE1357数据集的原始数据,利用R语言对数据进行预处理后筛选出差异表达基因。利用DAVID数据库和蛋白互作网络分析,筛选出关键的靶基因。随后在大鼠脑组织、原代神经元以及SH-SY5Y细胞上进行验证其表达量的变化。最后通过TTC染色、FJC染色、CCK8和水肿测量等验证该靶点对缺血性脑卒中的作用。结果:通过生物信息学分析,我们从2个正常海马组织样本和6个缺氧后海马组织样本得到了82个差异基因,包括66个下调的差异基因和16个上调的差异基因。GO分析显示这些差异主要参与基因表达的正性调节、中枢神经系统的发育、参与对脂多糖的应答反应、病毒迁入宿主细胞内、参与对乙醇的应答反应等过程。KEGG通路富集分析显示这些差异基因参与氧化磷酸化、帕金森的生成和可卡因的成瘾等。通过PPI网络分析,发现了6个关键基因:JUN、ATF3、HSPA1A、IMMT、PHB和TIMM44。最终进行后续实验的差异基因:PHB1。经过验证,发现PHB1在脑组织的白质和灰质区域,... 

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
引言
实验材料与方法
    1 实验材料
    2 实验项目、分组及方法
        2.1 实验项目与分组
        2.2 生物信息学分析
        2.3 细胞实验
        2.4 动物实验
    3 统计学分析
结果
    1 差异基因的筛选
    2 差异基因的GO功能注释和KEGG富集分析
    3 PPI网路分析和关键基因的筛选
    4 细胞OGD模型中PHB1的表达变化情况
    5 动物MCAO模型中PHB1的表达情况
    6 构建过表达PHB1的慢病毒
    7 PHB1可以减少大鼠的脑梗死体积
    8 PHB1可以改善神经元受损的情况
    9 PHB1降低脑水肿含量
    10 PHB1降低OGD后SH-SY5Y细胞的死亡情况
讨论
结论
参考文献
综述
    综述参考文献
攻读学位期间的研究成果
附录或缩略词表
致谢



本文编号：3717588