核磁共振代谢组学数据处理新方法及应用.pdf 全文免费在线阅读

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厦门大学硕士学位论文核磁共振代谢组学数据处理新方法及应用姓名:徐乐申请学位级别:硕士专业:无线电物理指导教师:董继扬20090601摘要代谢组学是关于定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学,是系统生物学的有机组成部分。以核磁共振(icResonance,N慨1为主要分析手段的代谢组学通常称为NMR代谢组学,已经广泛地应用到了包括药物研发,分子生理学,分子病理学,基因功能组学,营养学,环境科学等重要领域。NMR代谢组学的数据具有非线性、高维性、小样本性等特点,开发符合这些特性、且具有一定普适性的数据分析方法是代谢组学发展的关键。本文从数据预处理和数据分析两个方面入手,提出基于数据统计差异性的自适应分段积分方法和基于非负矩阵分解算法的数据分析方法。本文的主要内容如下:一、简要综述了目前代谢组学研究中常用的模式分析方法,讨论了代谢组学数据分析的发展趋势。二、提出了基于统计差异性的自适应分段积分数据预处理方法。提出描述数据统计差异性的函数,并根据变量的统计差异性自适应地选择积分间隔,实现数据矩阵的自适应分段积分。采用模拟数据集和素食研究的真实数据集对算法有效性进行验证,结果表明,自适应分段积分有助于提高样品分类与... 内容来自转载请标明出处.

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