雌激素受体ERα的生物信息学分析及临床意义

发布时间：2017-04-18 08:06

  本文关键词：雌激素受体ERα的生物信息学分析及临床意义，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：雌激素受体(estrogen receptors, ER)属于类固醇受体超家族中的一员,分为两大类：经典的核受体与膜性受体。雌激素受体(estrogen receptor a, ERa)作为依赖配体活化转录因子的核受体家族成员之一,其活化的经典途径是与雌激素结合后直接作用于靶基因上游的雌激素受体反应元件(ERE),从而诱导靶基因转录,参与靶细胞的增殖和分化。这类受体与多种疾病,包括乳腺癌、子宫内膜癌、心血管疾病、骨质疏松症、阿尔茨海默氏病等疾病的发生、转归和预后密切相关。本论文利用生物信息学的方法,对研究序列ERα的筛选及下载,氨基酸序列理化性质、结构特征、功能及系统演化关系等进行了预测和分析；以期为今后开展雌激素受体的相关研究提供一定的理论依据。结果：不同物种的ERa的氨基酸序列具有很高的同源性；人ERα属于亲水蛋白；氨基酸序列中不存在信号肽；分子中不含有跨膜结构域,含有磷酸酶位点,可能受蛋白激酶的磷酸化；α-螺旋是人ERα蛋白二级结构的主要结构元件。
【关键词】：ERα 生物信息学分析 蛋白质结构
【学位授予单位】：中南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：Q811.4;R3416
【目录】：

• 摘要4-5
• ABSTRACT5-6
• 目录6-8
• 1 绪论8-13
• 1.1 研究背景8-11
• 1.1.1 雌激素受体α结构与功能8-9
• 1.1.2 雌激素受体α与疾病9-10
• 1.1.3 雌激素受体α作用机制10-11
• 1.2 研究内容与方法11-13
• 2 数据库检索13-23
• 2.1 人ERα基因的数据库检索13-14
• 2.2 人ERα MRNA序列的数据库检索14-20
• 2.3 人ERα蛋白氨基酸序列的数据库检索20-22
• 2.3.1 ERα在染色体上的位置20-21
• 2.3.2 ERα基因编码区信息21-22
• 2.4 小结22-23
• 3 蛋白质结构与功能23-67
• 3.1 蛋白质一级结构——氨基酸序列信息23
• 3.2 蛋白质理化性质分析23-28
• 3.2.1 使用ProtParam软件分析的结果24-25
• 3.2.2 使用SAPS软件分析的结果25-28
• 3.3 蛋白质亲疏水性分析28
• 3.4 蛋白质跨膜结构区分析28-37
• 3.4.1 使用TMHMM软件分析跨膜结构区结果29-30
• 3.4.2 使用SOSUI软件分析跨膜结构区结果30-31
• 3.4.3 使用HMMTOP软件分析跨膜结构区结果31-32
• 3.4.4 使用PredictProtein软件分析跨膜结构区结果32-33
• 3.4.5 使用DAS软件分析跨膜结构区结果33-34
• 3.4.6 使用TMAP软件分析跨膜结构区结果34-35
• 3.4.7 使用TopPred软件分析跨膜结构区结果35-37
• 3.5 蛋白质信号肽分析37-38
• 3.5.1 使用SignalP 4.1软件分析信号肽结果37-38
• 3.5.2 使用iPSORT Prediction软件分析信号肽结果38
• 3.6 蛋白质二级结构预测38-45
• 3.6.1 使用PredictProtein软件分析蛋白二级结构结果39-42
• 3.6.2 使用PSIpred软件分析蛋白二级结构结果42-44
• 3.6.3 使用SOPMA软件分析蛋白二级结构结果44-45
• 3.7 蛋白质三级结构预测45-48
• 3.8 蛋白质结构域分析48-59
• 3.8.1 使用NCBI分析蛋白结构域结果49-50
• 3.8.2 使用InterPro软件分析蛋白结构域结果50-51
• 3.8.3 使用InterProScan软件分析蛋白结构域结果51-52
• 3.8.4 使用HMMER软件分析蛋白结构域结果52-56
• 3.8.5 使用PDB软件分析蛋白结构域结果56-59
• 3.9 蛋白质翻译后修饰分析59-64
• 3.9.1 使用PredictProtein分析翻译后修饰59-60
• 3.9.2 使用NetPhosK 2.0 Server分析翻译后修饰60-64
• 3.10 蛋白质亚细胞定位分析64-65
• 3.11 小结65-67
• 4 系统进化生物信息学分析67-69
• 4.1 系统进化分析67-68
• 4.2 小结68-69
• 5 基因表达谱生物信息学分析69-72
• 5.1 基因表达谱分析69-71
• 5.2 小结71-72
• 讨论72-73
• 参考文献73-77
• 致谢77

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 杨华,武成斌,屈秋民;雌激素与阿尔茨海默病[J];中国临床康复;2004年01期

  本文关键词：雌激素受体ERα的生物信息学分析及临床意义，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：314402