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基于Python的儿童脑图谱工具箱的设计与实现

发布时间:2021-08-28 22:53
  在完成了儿童功能性脑图谱的构建后,需要考虑的问题就是如何将它直观地呈现出来。目前,已经有适用于打开和呈现NIFTI图像文件的Python模块或是MATLAB工具包。但是,他们对于不熟悉脚本操作和编程的研究者来说不是很方便,需要经过专门的学习才能运用自如。我们考虑开发一个基于Python的工具箱来适配儿童功能性脑图谱的呈现和后续的分析,用户可以直接在GUI界面上进行点击即可完成自己的研究操作,避免直接与脚本进行交互,方便了没有编程基础的用户的使用。 

【文章来源】:软件. 2020,41(07)

【文章页数】:7 页

【部分图文】:

基于Python的儿童脑图谱工具箱的设计与实现


FWE:0.005图谱呈现

图谱


FDR:0.005图谱呈现

流程图,工具箱,系统功能,流程图


DBFA工具箱是作为儿童功能性脑发育图谱的可视化工具而开发的,但是它不应只具有可视化这么一个功能,这样开发成本太高而可使用性又太低。我们考虑,DBFA工具箱应该具有能够可视化.nii(标准NIFTI图像的扩展名是.nii,包含了头文件及图像资料)的文件功能,它不仅仅只用于开发的脑图谱的文件,用户自己的.nii文件也可以使用该工具箱来打开并且可视化。用户有两种方式可以打开nii图谱文件,一种通过打开菜单在电脑磁盘中选择要处理的文件;另一种是根据工具箱提供的筛选功能,选择年龄,认知任务和状态来筛选出对应的nii文件来打开。打开后,对应的nii文件的可视化脑图将会显示在主界面上,用户可以根据自己的需求来直接将图片保存下来,或者是使用FDR、FPR、FWE矫正得到更加严格的脑图谱后再保存。同时也可以设置Voxels的数目来决定激活脑区的最小大小;设置Cut_coords的坐标来获得不同位置的脑切片图谱。完成后,用户可以将该处理完的脑图谱存储为一个新的nii文件,今后可以随时进行查看和再操作。DBFA工具箱的系统功能流程图如图1所示。2 核心部分

【参考文献】:
期刊论文
[1]基于Qt绘图系统的图形应用优化研究与实现[J]. 邓子强,王玉玫,邓红艳,张宇.  软件. 2016(12)
[2]基于Qt开源框架的跨平台图像修复系统设计与实现[J]. 兰林涛,桂彦,郑镇潮,柳邓一漫,罗京,王朦.  软件. 2016(08)



本文编号:3369380

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