基于异质数据的microRNA与疾病关联预测研究

发布时间：2024-01-25 12:39

　　microRNA(miRNA)是非编码RNA大家族中的一员,可以调控基因表达,这也就意味着它会影响细胞水平上的多种生物学过程,进而影响组织、器官、系统乃至生命体。所以,与miRNA相关的功能性障碍与包括癌症在内的众多人类疾病有着密切的联系。我们希望能较快地发现并了解更多的miRNA与人类疾病的关联,再通过miRNA检测从而帮助治疗疾病乃至于疾病预防。由于传统的“湿实验”耗时耗力,且在一定程度上缺乏方向性,所以利用已有相关数据去预测可能的miRNA-疾病关联,可以为下一步的“湿实验”提供有益的帮助。在前人相关工作的基础上,本文提出一种基于多网络的miRNA与疾病关系标签传播预测模型(Heterogeneous Label Propagation for MiRNA-Disease Association prediction,HLPMDA)。首先,收集整理有关miRNA、疾病和长非编码RNA的异质数据;其次,以已知人类miRNA-疾病相互关联、长链非编码RNA-疾病关联、长链非编码RNA-miRNA相互作用、miRNA功能相似性以及疾病语义相似性数据为基础,分别建立miRNA-疾病关联网...

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

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致谢
摘要
abstract
变量注释表
1 绪论
    1.1 本课题研究背景与意义
    1.2 研究现状及发展趋势
    1.3 本文的研究内容
    1.4 本文结构
2 miRNA及其功能相似性
    2.1 miRNA简介
    2.2 miRNA功能相似性
    2.3 长链非编码RNA及其与miRNA的相互作用
    2.4 本章小结
3 疾病及其相似性
    3.1 有向无环图
    3.2 疾病语义相似性
    3.3 本章小结
4 数据集与数据预处理
    4.1 人类miRNA与疾病关联
    4.2 长链非编码RNA与疾病关联
    4.3 长链非编码RNA-miRNA相互作用
    4.4 miRNA功能相似性
    4.5 高斯相互作用谱核相似性
    4.6 疾病和miRNA相似性的结合
    4.7 本章小结
5 预测模型
    5.1 投影
    5.2 标签传播
    5.3 迭代的收敛与极限
    5.4 网络在线服务
    5.5 本章小结
6 模型评估
    6.1 交叉验证评估
    6.2 案例评估
    6.3 本章小结
7 讨论
    7.1 总体讨论
    7.2 与随机游走算法的比较
    7.3 本章小结
8 结论
    8.1 本文工作总结
    8.2 展望
参考文献
作者简历
学位论文数据集



本文编号：3884835