KDR基因多态性与TACE治疗肝细胞癌预后的关系
本文关键词:KDR基因多态性与TACE治疗肝细胞癌预后的关系
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【摘要】:背景和目的肝癌(Liver Cancer)是威胁人类生命健康的常见恶性肿瘤。2012年,全世界约有782500例新发肝癌、745500例肝癌死亡病例,而仅在中国地区,新发病例及死亡病人就占了其中50%,并且发病率、死亡率仍然逐年上升。肝细胞癌(HepatocellularCarcinoma, HCC)占肝癌约80-90%。新生血管、淋巴管参与肿瘤生长,肝细胞癌是一种富血供的恶性肿瘤,约90%的肝细胞癌由肝动脉供血,血管生成在肝细胞癌的发生发展中起重要作用。血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor)及其特异性酪氨酸激酶受体是最重要的血管内皮细胞调节因子之一。KDR (kinase insert domain receptor,激酶插入区受体)是血管内皮生长因子最重要的酪氨酸激酶受体,编码KDR蛋白的KDR基因位于第4号染色体q11-q12, KDR主要生物学作用有:1、调控内皮细胞增殖,2、调控内皮细胞的迁移,3、调控内皮细胞存活,4、调控内皮细胞通透性。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)作为新一代的遗传标记物,是指在DNA分子水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,SNP分布广泛,在人群中的发生频率大于1%,通常只有两种等位型,而且具有稳定的遗传特性,可以通过多种途径影响基因功能,为疾病发生提供遗传性病因。大量流行病学研究表明,遗传因素在肝细胞癌发病中亦起重要作用。目前有关肝细胞癌SNP的研究主要集中在易感性方面,关于KDR基因多态性与肝细胞癌治疗疗效、预后相关性的研究较少,本课题拟在前期工作的基础上,结合局部治疗在肝细胞癌治疗中的地位及目前遇到的问题,从基因分子水平上分析肝细胞癌的异质性,深入了解KDR基因多态性与肝细胞癌疗效的关系,寻找有意义的遗传标记物,为肝细胞癌的个体化治疗提供依据。材料与方法筛选2011年-2013年在广东省人民医院介入治疗科收治的肝细胞癌患者,要求入组患者符合肝细胞癌的临床诊断或病理诊断,就诊时一线接受经皮肝动脉化疗栓塞术治疗。所有患者在接受治疗前留取外周静脉血,使用EDTA抗凝管保存血液标本于-80℃,利用QIAamp DNA Blood mini kits (DNA提取试剂盒)提取人类基因组DNA,并用分光光度法检测DNA质量。肝动脉化疗栓塞术采用seldinger技术,数字减影血管造影(digital substraction angiography,DSA)下使用微导管超选择至肿瘤供血动脉,注入化疗药和碘化油的乳化剂,碘油栓塞后再予栓塞供血动脉。人类基因组单体型图计划(hapmap project)研究中构建了人类DNA序列中常见的多态位点模式,运用单体型分型的方法可以找出约50万个标签SNPs (tagger SNPs)来代表整个基因图谱之中的SNP集合。我们在国际人类基因组单体型图计划提供的SNP公共数据库中选取了KDR基因13个SNP位点。最后参考SNP位点所在的位置及国内外文献报道,再选取4个非同义突变位点(rs2305948, rs1870377, rs34231037和rs34038364),以及一个功能性位点rs2071559,采用高通量MassARRAY时间飞行质谱生物芯片系统检测入组患者KDR基因位点的单核苷酸多态性。统计患者的基线人口学及临床病理资料,使用修订版实体瘤疗效评价标准(modified response evaluation criterion in solid tumors,mRECIST)评价患者行TACE术后的疗效,将CR+PR+SD的患者定义为疾病控制组,PD的患者定义为疾病进展组。定义无进展生存期(progressionfree survival, PFS)为首次治疗之日到首次记录到肿瘤进展(PD)或因任何原因死亡,以先出现者为准。统计分析比较疾病控制组和疾病进展组两组间基本临床资料的差异,分析KDR基因位点多态性基因型频率分布,计算不同基因型肝细胞癌疾病进展的相对危险度。采用SPSS13.0统计软件进行统计学分析,计数资料以率比较,组间比较用Pearson's x2检验;两组间用独立样本t检验比较或非参数秩和检验;采用Kaplan-Meier法进行两组间的生存分析,用log-rank方法进行组间生存率比较;采用非条件logistic回归分析计算不同基因型频率与所研究人群肝细胞癌疾病进展风险,以优势比(odds ratio, OR)及95%可信区间(confidence intervals, CIs)表示相对危险度,分析肝细胞癌和基因型的相关性。所有统计均为双侧检测,P0.05为差异有统计学意义。结果对所有获得满意基因分型的患者进行相关人口学特征及临床指标统计分析,一共192例患者,其中159例(82.8%)为男性,33例(17.2%)为女性。乙型病毒性肝炎HBV表面抗原阳性的患者有152例(79.2%),没有HCV阳性病人;所有HBsAg (+)且乙肝病毒拷贝数500拷贝/m1的患者均使用抗乙肝药物,如拉米夫定,恩替卡韦,替米夫定等,单药或联合用药。病人中位年龄为53岁,50岁以上的患者有126位。肝硬化患者98例(51.0%)。基线水平AFP高于400ng/ml的有124例(64.5%),低于400 ng/m1的有68例(35.4%)。原发肿瘤大小范围为直径3.4-13cm,平均直径为6.8cm,其中肿瘤直径大于5cm的有146例(76.0%),小于5cm的有46例(24.0%)。癌肿病灶数目为1-8个,中位数为2个,57.8%患者病灶数≥2。肝功能按照child-pugh分级,A级的有138例(71.8%),B级的有54例(28.1%),B级的患者中42例为7分,12例为8分,无9分或者肝功能C级的患者。肿瘤侵犯门静脉的患者61例(31.8%),无血管侵犯的患者131例(68.2%)。BCLC分期:110例(57.3%)患者为B期,82例(42.7%)患者为C期。对患者进行疗效评价,其中CR者0例,PR和SD分别为42和36例,PD者114例。疾病控制组与疾病进展组中患者年龄(50岁vs≥50岁)、性别、肿瘤数目(1个vs≥2个)、AFP水平(400ng/ml vs ≥400ng/ml)、有无肝硬化、有无淋巴结转移的分布相似,P0.05。疾病控制组与疾病进展组中患者的肿瘤分期、肿瘤直径和有无门静脉癌栓的分布有统计学差异,P0.05。BCLCB期患者在疾病控制组和进展组中的数目分别为56和54个,BCLCC期患者在疾病控制组和进展组中的数目分别为22和60个,分布有统计学差异(卡方值=11.2,P=-0.001)。肿瘤直径5 cm的患者在疾病控制组和进展组中的数目分别为49和97个,肿瘤直径≤5 cm的患者在疾病控制组和进展组中的数目分别为29和17个,分布有统计学差异(卡方值=12.6,P=0.001)。门静脉侵犯患者疾病控制组和进展组中的数目分别为33和28个,无门静脉侵犯患者在疾病控制组和进展组中的数目分别为45和86个,分布有统计学差异(卡方值=6.728,P=0.009)。年龄、性别、AFP、肿瘤数目、肝功能与PFS无关(P0.05),肿瘤BCLC分期、肿瘤大小、门静脉侵犯与PFS有关(P0.05)。肿瘤直径5cm较肿瘤直径5cm的患者PFS长(18个月vs 11.5个月,P0.001)。无门静脉癌栓的患者较肿瘤侵犯门静脉的患者PFS长(13个月vs 10个月,P0.001)。肿瘤分期为B期的患者较肿瘤分期为C期的患者PFS长(13.5个月vs 11个月,P=0.011)。经卡方检验得出基因型频率分布符合哈迪温伯格遗传平衡定量,P值均大于0.05,说明样本具有一定的人群代表性。KDR基因rs2071559位点检测到CC、TT和CT三种基因型。CC基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为32.0%和27.2%;TT基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为26.9%和46.5%;CT基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为41.0%和26.3%(卡方值=8.079,P=0.018)。KDR基因rs1870377位点检测到TT、TA和AA三种基因型。TT基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为20.5%和36.0%;TA基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为34.6%和36.0%;AA基因型在疾病控制组和进展组中的分布频率分别为44.9%和28.1%。三种基因型在疾病控制组与进展组间分布频率比较具有显著性统计学差异(卡方值=7.495,P=0.024)。其余SNPs位点各基因型在疾病控制组与进展组间分布频率均相当,P值未见显著统计学差异(P0.05)。rs2071559、rs1870377两个位点的各基因型与基线水平的肿瘤大小、是否有门静脉侵犯、肿瘤分期均无明显相关性。采用log-rank方法检验患者各位点不同基因型间PFS的关系,rs2071559位点CC基因型和CT+TT基因型的中位PFS分别为15.0月和13.0月,P=0.006。rs1870377位点AA基因型和TT+TA基因型的中位PFS分别为15.0月和11.5月,P=0.001。其余SNP位点不同基因型的PFS比较无显著差异。非条件Logistic回归分析显示,KDR基因rs2071559位点CC基因型是肝细胞癌疾病进展的保护因素,携带CC基因型的患者其疾病进展的风险较携带另外两种基因型的患者低(OR=0.347,95% CI=0.136-0.875, P=0.028)。KDR基因rsl870377位点AA基因型是肝细胞癌疾病进展的保护因素,携带AA基因型的患者其疾病进展的风险较携带另外两种基因型的患者低(OR=0.131,95% CI=0.032-0.451, P=0.034).其余SNP位点与肝细胞癌疾病控制或疾病进展之间均未发现显著相关。纳入可能的混杂因素进行多因素logistic回归分析,结果示:巴塞罗那分期和位点是影响肝细胞癌预后的重要因素,巴塞罗那B期和rs2071559位点携带CC基因型的患者发生疾病进展的比率较低(OR=0.133,95% CI=0.021-0.513, P= 0.025; OR=0.415,95% CI= 0.218-0.677, P= 0.031).结论KDR基因rs2071559位点多态性和肝细胞癌患者接受肝动脉化疗栓塞的临床疗效有关。
【关键词】:肝细胞癌 基因多态性 肝动脉化疗栓塞术 KDR预后
【学位授予单位】:南方医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R735.7
【目录】:
- 摘要3-8
- ABSTRACT8-15
- 第一章 前言15-18
- 第二章 材料与方法18-35
- 第一节 临床资料18-24
- 第二节 VEGRF-2基因候选多态位点的检测24-33
- 第三节 统计学方法33-35
- 第三章 结果35-52
- 第一节 研究人群的人口学资料和临床基本资料35-36
- 第二节 临床病理特征与预后的关系36-42
- 第三节 基因分型结果42-46
- 第四节 rs2071559、rs1870377与肝细胞癌主要临床病理参数的关系46-48
- 第五节 各基因SNP位点与肝细胞癌TACE疗效的关联分析48-52
- 第四章 讨论52-62
- References62-65
- 中英文缩写词65-66
- 攻读学位期间发表成果66-67
- 附录67-69
- 致谢69-70
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