利用RNA测序技术探索静脉内平滑肌瘤病与子宫平滑肌瘤关系

发布时间：2018-03-02 07:11

  本文关键词： 静脉内平滑肌瘤病 子宫平滑肌瘤 RNA转录测序 聚类分析　出处：《北京协和医学院》2017年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：一、研究背景:静脉内平滑肌瘤病为临床上较为少见的一种平滑肌细胞肿瘤,其病理学特点提示静脉内平滑肌瘤病为一种良性肿瘤,但其生物学行为具有恶性特点,临床上可见静脉内平滑肌瘤病瘤体可从子宫内侵袭到髂静脉血管至下腔静脉,部分病例甚至可至右心房内,亦有文献报道该病存在远处肺转移。自2002年11月至2015年1月,中国医学科学院、北京协和医院共收治了 30757位子宫平滑肌瘤患者,其中有76名患者(占子宫平滑肌瘤患者总数0.25%)被诊断为静脉内平滑肌瘤病。静脉内平滑肌瘤病患者分别于心外科、血管外科、妇产科接受手术治疗。自2002年11月至2016年6月,中国医学科学院、北京协和医院心脏外科诊断并手术治疗41位静脉内平滑肌瘤病患者,其中有30位(73.3%)患者之前因子宫平滑肌瘤疾病接受手术治疗。这个有趣的临床现象引起了我们的注意,我们推测,静脉内平滑肌瘤病与子宫平滑肌瘤或许存在某些特定的关系。复习文献可知,目前关于静脉内平滑肌瘤病的起源,有两种假说较大家广为接受。第一种假说认为,静脉内平滑肌瘤病起源于血管壁的血管平滑肌细胞;另一种假说则提示,静脉内平滑肌瘤病由子宫平滑肌瘤演化而来。目前现有的文献中,用于探索静脉内平滑肌瘤病与子宫平滑肌瘤之间关系的实验方法,多为比较两者病理结果的差异及免疫组化结果的不同,少部分研究是从分子水平来探索血管平滑肌瘤与子宫平滑肌瘤之间的关系,未发现使用RNA测序技术来探索静脉内平滑肌瘤病的文献。因此,我们实验设计为利用RNA测序技术,从分子水平来探索静脉内平滑肌瘤病与子宫平滑肌瘤之间的关系。二、方法:1.病人及标本:我们从2014年于中国医学科学院、北京协和医院心脏外科接受手术治疗的静脉内平滑肌瘤病患者中选取5例病人,留取切除血管平滑肌瘤及自身子宫正常平滑肌作为标本;同时从子宫平滑肌瘤患者中留取3例患者子宫平滑肌瘤及正常子宫平滑肌作为对照组。鉴于血管平滑肌瘤的大体标本远段、中段及近段形态存在差异,我们将血管平滑肌瘤标本人为分为远段(近心段)、中段及近段(子宫段)。2.提取RNA及测序:从每个标本选取50 mg标本组织,使用Trizol(Invitrogen)试剂将RNA萃取出来,行质量检测,质量检测合格者使用IlluminaHiSeqTM 2000 platform(Illumina,San Diego,CA)进行 RNA 测序。3.数据分析:对所获得测序数据进行分析,得出静脉内平滑肌瘤病组差异表达基因及子宫平滑肌瘤病组差异表达基因的Gene ontology功能富集条目,最后分析包含差异表达基因的标本之间的关系。三、结果:1.血管平滑肌瘤标本的近心段、中段、子宫段共有的差异表达基因较少,提示血管平滑肌瘤或许是多源性基因表达。2.所得到的血管平滑肌瘤和子宫平滑肌瘤组差异表达基因,均富集于GO里的细胞外基质、激素刺激反应、细胞黏附、细胞死亡等功能条目。3.聚类分析提示静脉内平滑肌瘤病和子宫平滑肌瘤标本并不能明显区分开来。四、结论:血管平滑肌瘤和子宫平滑肌瘤的差异表达基因均与激素刺激反应、细胞外基质、细胞粘连等功能相关。这提示血管平滑肌瘤和子宫平滑肌瘤拥有着相似的基因调控系统。聚类分析结果提示所选取血管平滑肌瘤和子宫平滑肌瘤标本距离较近,不能完全区分开来。因此我们或许可以认为静脉内平滑肌瘤病与子宫平滑肌瘤功能关系相近,或许是子宫平滑肌瘤的亚型。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R737.33

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本文编号：1555507