基于基因数据库分析CD44在胶质瘤中的表达及意义

发布时间：2018-03-23 14:38

  本文选题：胶质瘤　切入点：CD　出处：《华中科技大学学报(医学版)》2017年03期

【摘要】：目的研究CD44在胶质瘤中的表达和临床意义,以及CD44下调对胶质瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法检索Oncomine数据库中关于CD44的信息,对其在各类型肿瘤及胶质瘤中的表达情况进行检索。利用R2基因分析可视化平台及TCGA数据库中下载的胶质瘤基因芯片数据集,分析CD44的表达水平与胶质瘤患者预后的关系。通过siRNA抑制CD44的表达,通过CCK-8试验、Transwell小室、流式细胞术检测CD44下调对胶质瘤U251细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。结果 Oncomine数据库中共收集了467项不同肿瘤类型的关于CD44的研究结果,对比正常组织,有统计学差异的结果有68项,其中CD44表达增高的有51项,表达降低的有17项。胶质瘤中高表达的有10项,未搜索到低表达的项目,10项研究共包括955例样本。分析R2基因分析可视化平台(包含504例胶质母细胞瘤)及TCGA数据库(包含529例低级别胶质瘤)的基因芯片数据发现,CD44高表达患者预后更差。在胶质母细胞瘤中CD44高、低表达组患者2年生存率分别为13%和25%(P=0.000 1),在低级别胶质瘤中CD44高、低表达组患者5年生存率分别为47%和61%(P=0.001 0)。采用特异性针对CD44基因的siRNA转染U251胶质瘤细胞可显著抑制CD44的表达,与阴性对照组和空白对照组相比,转染组的细胞增殖和侵袭明显受到抑制,且流式细胞学显示转染组对比阴性对照组细胞凋亡率增加,分别为7.10%和4.11%(P0.05)。结论 CD44在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤预后判断指标及潜在的治疗靶点。
[Abstract]:Objective to study the expression and clinical significance of CD44 in glioma and the effect of down-regulation of CD44 on proliferation, invasion and apoptosis of glioma cells. The expression of glioma gene in various types of tumors and gliomas was searched. The glioma gene chip data set downloaded from the R2 gene analysis visualization platform and the TCGA database was used. To analyze the relationship between the expression of CD44 and the prognosis of glioma patients, the expression of CD44 was inhibited by siRNA, and the proliferation of U251 cells was detected by down-regulation of CD44 by CCK-8 assay. Results A total of 467 studies on CD44 of different tumor types were collected in the Oncomine database. Compared with normal tissues, there were 68 different results, 51 of which had increased CD44 expression. There were 17 cases of decreased expression and 10 cases of high expression in gliomas. A total of 955 samples were included in 10 studies that did not search for low expression items. Gene chip data from the R2 gene analysis visualization platform (504 glioblastoma cases) and the TCGA database (529 low grade gliomas) were analyzed. It was found that the prognosis of patients with high expression of CD44 was worse. CD44 was higher in glioblastoma. The 2-year survival rates of low expression group were 13% and 25%(P=0.000 1 respectively. The 5-year survival rate of low expression group was 47% and that of low expression group was 47% and 61%(P=0.001 0 respectively. U251 glioma cells transfected with siRNA targeting CD44 gene could significantly inhibit the expression of CD44. Compared with the negative control group and the blank control group, the cell proliferation and invasion of the transfected group were significantly inhibited, and flow cytology showed that the apoptosis rate of the transfected group was higher than that of the negative control group. Conclusion CD44 is highly expressed in gliomas and can be used as a prognostic index and a potential therapeutic target for glioma.
【作者单位】： 华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤中心;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(No.81272780)
【分类号】：R739.41

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本文编号：1653894