骨肉瘤miRNA分子共调控网络的构建

发布时间：2018-07-26 18:27

【摘要】：目的探讨骨肉瘤潜在的miRNA分子调控网络,为解析骨肉瘤发生发展的分子机制提供理论支撑。方法通过差异表达分析获得骨肉瘤组织表达水平发生显著性改变的miRNA,并找到具有显著差异的miRNA靶基因;再通过KEGG代谢通路富集分析以及GO基因功能注释,探究骨肉瘤组织与正常组织相比表达水平发生显著性改变基因的功能,构建分子共调控网络。结果筛选差异表达miRNA52例,其中31例miRNA上调表达,21例miRNA下调表达;参与肿瘤通路的miRNA共有5例,其关联靶基因共有314个。KEGG代谢通路富集分析结果与GO基因功能分析结果显示,差异表达基因主要参与肿瘤相关的代谢通路。基于差异表达基因及TRED数据库中所收录的人类转录因子信息,对差异表达基因进行分子偶联,构建了分子共调控网络。结论基于分子共表达网络,对骨肉瘤发生发展的分子作用机制进行了系统性挖掘。
[Abstract]:Objective to explore the potential miRNA molecular regulatory network of osteosarcoma and provide theoretical support for the molecular mechanism of osteosarcoma. Methods miRNAs with significant changes in expression level of osteosarcoma were obtained by differential expression analysis, and miRNA target genes with significant differences were found, and then enriched by KEGG metabolic pathway and annotated by go gene function. To explore the function of gene expression in osteosarcoma tissues compared with normal tissues, and to construct molecular coregulation networks. Results differential expression of miRNA52 was screened in 31 cases, in which 31 cases were up-regulated and 21 cases were down-regulated in miRNA, 5 cases were involved in tumor pathway, and 314 associated target genes were detected by enrichment analysis of KEGG metabolic pathway and go gene function analysis. Differentially expressed genes are mainly involved in tumor-related metabolic pathways. Based on the differentially expressed genes and the information of human transcription factors in TRED database, a molecular coregulation network was constructed by molecular coupling of differentially expressed genes. Conclusion based on the molecular coexpression network, the molecular mechanism of osteosarcoma was systematically explored.
【作者单位】： 吉林大学第二医院骨科医学中心;
【基金】：吉林省直卫生专项项目 吉林大学白求恩医学部博士研究生拔尖人才培育计划(YB201501);吉林大学研究生创新基金支持(2016108,2016041)
【分类号】：R738.1

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本文编号：2146910