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miR-338和miR-497以LINC00473为靶标抑制肝癌细胞侵袭转移

发布时间:2020-03-24 08:25
【摘要】:肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是目前世界范围内最常见也是致死率最高的癌种之一,严重威胁了全球人民的身体健康,探明肝癌的发生发展机制对于肝癌患者的治疗,延长病人的生存期有着重要作用。在肝癌发生发展的过程中,涉及到了一系列的基因,其中既包括具有编码能力的编码基因(coding gene)同时也包括了一系列的非编码基因(non-coding gene),其中非编码基因可以分为小 RNA(small RNAs)以及长链的非编码 RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)。小 RNA 包含的范围较大,包括了微 RNA(microRNA,miRNA)、转运 RNA(transfer RNAs,tRNAs)、与 Piwi 蛋白相相作用的 RNA(Piwi-interacting RNAs,piRNAs)、核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)等,本文重点关注对象是 miRNA。在肝癌细胞的增殖、侵袭、转移和凋亡的过程中,miRNA可以通过转录后调节进行基因调控,而lncRNAs则不但可以进行转录后调控进而参与了肝癌的发生发展进程,同时也可以通过在转录水平进行组蛋白修饰或DNA甲基化等方式调节相关基因的表达进而参与肝癌进展,同时,还可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs)与靶基因竞争性结合miRNA参与基因调控过程。MicroRNA指的是由内源基因编码,由20~25个核苷酸组成的非编码的单链RNA,它可以与信使RNA(message RNA,mRNA)通过碱基互补配对的方式来沉默靶基因从而达到对靶基因调控的作用。对于lncRNA而言,指的是长度大于200个核苷酸,不具有蛋白质编码能力的非编码RNA。研究表明,lncRNAs可以通过与DNA、RNA或蛋白质之间的结合参与了机体内包括染色体修饰、表观遗传调控、RNA的加工、基因转录、细胞周期调控等众多的生命活动进程。本文利用了细胞转染技术,将micro RNA-338和micro RNA-497转染至肝癌细胞系中,检测它们是否会影响靶基因LINC00473的表达进而调控肝癌细胞的增殖、侵袭、转移等细胞功能。我们通过生物信息学手段,利用多种数据库,筛选验证出作为LINC00473基因的ceRNA GPR-124,阐明了靶基因调控肝癌细胞的分子机制。结果证明了 miR-338-3p和miR-497-5p都是抑癌因子,并且通过GSE数据库分析得知LINC00473在肝癌组织中是异常表达的癌基因,与实验结果相符。因此,LINC0047为肝癌患者的治疗提供了新的靶点,为肝癌发生提供了潜在的生物标志物。
【图文】:

基因组,位置,转录本,可变剪接


子对增强子的抑制,最终导致激活了鸡溶菌酶基因表达的结果,lncRNA可以千扰转录逡逑功能,如Strieker邋SH等人[71]发现在/g/>印记的基因簇中,等可以将如_?截断成逡逑为不同程度大小的片段,在通过转录干扰抑制/g/>的转录的过程中,可以发现逡逑Arn的转录本覆盖到启动子后抑制了邋/g/2r的转录,而不是转录本身过程,逡逑IncRNA可以控制转录因子,如Hung等人[72]发现DNA损伤能通过激活IncRNA逡逑(启动子相关转录本,扣MX4通过与NF-YA相互作用抑制了对凋亡基因启动子区逡逑域结合,进而抑制凋亡基因表达,参与细胞周期调控;参与转录后调控,包括可变剪接逡逑的调控,如Kurogi邋Y等人[73]在Hala细胞内发现Mato/可以与SR蛋白特异性结合,调逡逑节了核斑定位和磷酸化水平,募集SR蛋白至转录活跃区调控mRNA前体可变剪接,逡逑IncRNA可以对RNA亚细胞定位调控,如Torres邋M等人[74]发现TVeaW与细胞核亚结构逡逑paraspeckles形成密切相关,参与3’UTR反向重复Alu元件mRNA在Paraspeckles内滞逡逑留,,抑制了邋mRNA出核,IncRNA可以对RNA稳定性调控,如Faghihi等人「5]发现逡逑凡能与形成RNA双螺旋最终增加BACE1稳定性,使AP含量升高并通逡逑过正反馈促进转录,最终引起阿尔兹海默病。逡逑-

癌症,基因组,机理


逦sUnd^ion*邋|?romot?f-??K>ciftted逡逑图1-lLncRNA基因组位置逡逑Figure邋1-1邋Genomic邋contexts邋of邋IncRNA逡逑1.3.2与癌症之间的关系逡逑由于近些年来癌症患者人数的逐渐增长,对于IncRNA与肿瘤之间的机理关系也越逡逑来越受到了人们的重视
【学位授予单位】:北京化工大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R735.7

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本文编号:2598068

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