人纤溶酶原Kringle 5与电压依赖性阴离子通道蛋白VDAC1的相互作用研究

发布时间：2020-05-17 08:18

【摘要】：恶性肿瘤已成为威胁人类生命健康的重大疾病之一。现有研究证实,人纤溶酶原Kringle 5通过与电压依赖性阴离子通道蛋白VDAC1相互作用来诱导细胞凋亡,抑制肿瘤增长。但二者之间具体的相互作用尚不清楚。对此,本研究采用分子动力学模拟和实验相结合的方法,对人纤溶酶原Kringle 5与VDAC1的相互作用机理进行了研究。利用分子动力学模拟得到二者相互作用的轨迹。对两者相互作用的氨基酸分析,发现二者通过氢键,静电力与范德华力相互作用,对构象变化进行分析,发现复合物中由268VAL,269ASN,270ALA与由165THR,166GLN,167SER构成的β片层消失变为无规则卷曲;由162SER,163ARG,164VAL与由327PRO,328GLU,329THR构成的无规则卷曲变为了小的β片层,且163ARG,166GLN分别通过氢键与Kringle 5中的361TYR和357PRO产生作用。对结合能量进行了分析并分解,发现二者的结合可以自发进行,且静电力为二者相互作用的主要驱动力,29GLU为二者相互作用的关键氨基酸。对关键氨基酸进行了突变研究,也从反面验证了二者之间存在相互作用。实验方面采用了前沿色谱法和表面等离子共振来研究。结果表明Kringle 5能与VDAC1发生相互作用。前沿色谱中,结合常数采用两种方法计算得到分别为3.63×10~6 L/mol,3.5×10~6 L/mol,用SPR法得到的结合常数为1.63×10~4 L/mol。这些参数均能从实验方面验证VDAC1与Kringle 5之间的相互作用。
【图文】：

第一章 绪论 K1-K4 功能区与血管生成抑制素具有高度同源性血管抑素类似的或相关的蛋白，也包含着同样的有同样的功能，可以也对血管内皮细胞的增殖与 5 个环状结构域（Kringles），水解后可产生一片段，经研究发现，Kringles 1-4，Kringles 1-5，K血管增生[21,22]，重组人的纤溶酶原 Kringles 1、Kr抑制内皮的增生，研究报道，Kringles 4 可以抑制。

的血管增生，重组人的纤溶酶原 Kringles 1、Kring能抑制内皮的增生，研究报道，Kringles 4 可以抑制内生。图 1.1 人纤溶酶原，血管生成抑素与 Kringle 5 的关系[22]人纤溶酶原中与血管生成抑制素相连的一个环状结构域硫键（图 1.2），分子量约为 8KD，与 Kringle 1、Krin较高的同源性。
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R730.5

【参考文献】

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本文编号：2668218