基于共病的前列腺癌演化研究
发布时间：2020-07-10 23:15
【摘要】：前列腺癌是西方发达国家和地区发病率最高的泌尿系统恶性肿瘤。近年来,在亚洲地区的发病率和死亡率也在逐年升高。目前针对前列腺癌的研究大多停留在临床表型以及诊断治疗方法等层面,而对其发病机制较少。基于此,本文从共病的角度,探究心血管疾病、脑血管疾病、糖尿病和膀胱癌对前列腺癌发生发展过程的影响。本课题基于系统生物学思维和理论,从分子、网络、信号通路等层次系统分析四种共病与前列腺癌发生和发展的相互作用关系。一方面,选择对应疾病基因芯片表达数据,通过T检验鉴定差异表达基因,进一步对差异表达基因进行显著性检验和生物功能分析。另一方面,利用WGCNA包构建加权基因共表达网络,获得共表达模块,通过显著性分析,得到与疾病相关的重要模块,再对模块内基因做功能富集分析。对比分析不同时期前列腺癌与四种共病在基因表达层面和共表达网络层面的结果,我们发现:在差异表达基因、信号转导通路以及基因本体论方面,这四种共病与前列腺癌转移期的一致性更高,对应相同的基因以及通路条目更多,且经文献验证,这些代谢通路在四种共病和前列腺癌的发生发展过程中均发挥重要的作用;从共病的角度看,膀胱癌与前列腺癌的关系最为密切,其次是糖尿病,心血管疾病与脑血管疾病与前列腺癌关系最有限;从前列腺癌的发病阶段看,糖尿病在前列腺癌初期和转移期的变化最大,膀胱癌在前列腺癌初期和转移期的变化和前列腺癌本身的变化趋势基本一致,心血管疾病和脑血管疾病几乎都是在转移期前列腺癌才出现。共病在前列腺癌的演化过程中扮演着重要的角色,本课题结合系统生物学的方法在分子和系统层面探究前列腺癌与四种共病的关系,为前列腺癌的发病机理研究和个性化治疗提供了新思路、新方法,具有一定的研究意义和价值。
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R737.25
【图文】：
但越来越多的临床实例反映了过度诊断和多度治疗对于前列腺癌的危害[11影响临床判断的重要因素有年龄[12]、共病[13]、前列腺癌的阶段等。共病指数较高相对年轻以及前列腺癌初期的患者接受激进的治疗手段的可能性较大[14]。前列腺癌误判因素多研究显示，激进的治疗手段不能使前列腺癌的死亡率显著降低，而一些没有接受治疗的前列腺癌初期患者生存率反而更高[15]。近年来，共病（Comorbidity）作为前列腺癌的风险因素受到了越来越多的重视和研究。我们通过 Pubmed 检索发现，从 1998 年至今，对前列腺癌和共病的研究总体处于上升状态（图 1.1）。研究前列腺癌和共病，更多是为了通过共病指数对临床病人死亡率和存活时间进行预期判断。最常见的两个共病指数是 the Charlson ComorbiditIndex（CCI）和 the Elixhauser et al. Comorbidity Measure （ECM）[16]。CCI 是直接通过临床病人死亡率数据获得 16 种疾病数据，根据权重，计算其对于死亡率的影响ECM 则是通过搜集 30 种共病，观察着 30 种共病对急性住院患者的短期预后。
IPA 通路富集条数 55 26 119 3 13 65 91注：Pca： 前列腺癌（Prostate Cancer, PCa）PCa-BP：前列腺癌初期（Primary Prostate Cancer, PCa-BP）PCa-BM：前列腺癌转移期（Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM）CVD： 心血管疾病（Cardiovascular Disease CVD）CEVD： 脑血管疾病（Cerebrovascular Disease, CEVD）DM： 糖尿病（Diabetes Mellitus, DM）BCa： 膀胱癌（Bladder Cancer, BCa）在获得显著性 IPA 通路后，我们将四种共病的显著性 IPA 通路分别与前列腺癌期和转移期显著性 IPA 通路进行对比分析，获得共病与前列腺癌初期和转移期重叠通路条目，重点对重叠 IPA 通路进行分析。按通路重叠数量由大到小排列，直观地示了前列腺癌与四种共病 IPA 通路重叠关系，从整体上看为：膀胱癌>糖尿病>脑血管疾病>心血管疾病。其中，前列腺癌转移期与四种共病的 IPA 通路重叠数量均大初期，说明转移期的前列腺癌患者得共病的可能性更大（图 3.1）。具体初期和转移前列腺癌分别与四种共病共享的 IPA 通路条目见附表 2。
第三章 前列腺癌与共病分子机理研究 基于共病的前列腺癌演化研究表 3.6 KEGG 分析全部数据列表PCa PCa-BP PCa-BM CVD CEVD DM BCaKEGG 通路富集条数 30 12 43 0 3 9 16注：Pca： 前列腺癌（Prostate Cancer, PCa）PCa-BP：前列腺癌初期（Primary Prostate Cancer, PCa-BP）PCa-BM：前列腺癌转移期（Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM）CVD： 心血管疾病（Cardiovascular Disease CVD）CEVD： 脑血管疾病（Cerebrovascular Disease, CEVD）DM： 糖尿病（Diabetes Mellitus, DM）BCa： 膀胱癌（Bladder Cancer, BCa）
本文编号：2749582
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R737.25
【图文】：
但越来越多的临床实例反映了过度诊断和多度治疗对于前列腺癌的危害[11影响临床判断的重要因素有年龄[12]、共病[13]、前列腺癌的阶段等。共病指数较高相对年轻以及前列腺癌初期的患者接受激进的治疗手段的可能性较大[14]。前列腺癌误判因素多研究显示，激进的治疗手段不能使前列腺癌的死亡率显著降低，而一些没有接受治疗的前列腺癌初期患者生存率反而更高[15]。近年来，共病（Comorbidity）作为前列腺癌的风险因素受到了越来越多的重视和研究。我们通过 Pubmed 检索发现，从 1998 年至今，对前列腺癌和共病的研究总体处于上升状态（图 1.1）。研究前列腺癌和共病，更多是为了通过共病指数对临床病人死亡率和存活时间进行预期判断。最常见的两个共病指数是 the Charlson ComorbiditIndex（CCI）和 the Elixhauser et al. Comorbidity Measure （ECM）[16]。CCI 是直接通过临床病人死亡率数据获得 16 种疾病数据，根据权重，计算其对于死亡率的影响ECM 则是通过搜集 30 种共病，观察着 30 种共病对急性住院患者的短期预后。
IPA 通路富集条数 55 26 119 3 13 65 91注：Pca： 前列腺癌（Prostate Cancer, PCa）PCa-BP：前列腺癌初期（Primary Prostate Cancer, PCa-BP）PCa-BM：前列腺癌转移期（Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM）CVD： 心血管疾病（Cardiovascular Disease CVD）CEVD： 脑血管疾病（Cerebrovascular Disease, CEVD）DM： 糖尿病（Diabetes Mellitus, DM）BCa： 膀胱癌（Bladder Cancer, BCa）在获得显著性 IPA 通路后，我们将四种共病的显著性 IPA 通路分别与前列腺癌期和转移期显著性 IPA 通路进行对比分析，获得共病与前列腺癌初期和转移期重叠通路条目，重点对重叠 IPA 通路进行分析。按通路重叠数量由大到小排列，直观地示了前列腺癌与四种共病 IPA 通路重叠关系，从整体上看为：膀胱癌>糖尿病>脑血管疾病>心血管疾病。其中，前列腺癌转移期与四种共病的 IPA 通路重叠数量均大初期，说明转移期的前列腺癌患者得共病的可能性更大（图 3.1）。具体初期和转移前列腺癌分别与四种共病共享的 IPA 通路条目见附表 2。
第三章 前列腺癌与共病分子机理研究 基于共病的前列腺癌演化研究表 3.6 KEGG 分析全部数据列表PCa PCa-BP PCa-BM CVD CEVD DM BCaKEGG 通路富集条数 30 12 43 0 3 9 16注：Pca： 前列腺癌（Prostate Cancer, PCa）PCa-BP：前列腺癌初期（Primary Prostate Cancer, PCa-BP）PCa-BM：前列腺癌转移期（Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM）CVD： 心血管疾病（Cardiovascular Disease CVD）CEVD： 脑血管疾病（Cerebrovascular Disease, CEVD）DM： 糖尿病（Diabetes Mellitus, DM）BCa： 膀胱癌（Bladder Cancer, BCa）
【参考文献】
相关期刊论文 前4条
1 党强;周小果;仝建;;前列腺癌相关长链非编码RNA转录产物1在非小细胞肺癌组织中的表达及意义[J];中华实验外科杂志;2016年05期
2 王斌;王超;李晶;;大差异网络异常数据特征检测算法的仿真分析[J];计算机仿真;2013年08期
3 王耀珍;张志利;;糖尿病肾病发病机制的研究进展[J];中国药物与临床;2008年01期
4 刘静,赵冬,秦兰萍,王薇,吴桂贤,曾哲淳,王文化,吴兆苏;低密度脂蛋白胆固醇与心血管病发病关系的前瞻性研究[J];中华心血管病杂志;2001年09期
本文编号：2749582
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