miR-27a-3p抑制B4GALT3表达对胃癌BGC-823细胞增殖和侵袭的影响及机理研究
【学位授予单位】:南华大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R735.2
【图文】:
化的主要成分—粘蛋白型 O-糖链糖基化在肿瘤中高表达,有利于肿瘤生物标记物的研究[11]。B4GALT3(Gene ID: 8703),全称 beta-1,4-galactosyltransferase 3,又称beta4Gal-T3,位于染色体 1q23.3 上,是β1,4 半乳糖基转移酶家族中的第 3 个成员(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8703)。Zhang M 等人[14]利用人胎盘cDNA 文库成功克隆出 B4GALT3,并指出在其编码区第 77 位,119 位,190 位以及 209 位氨基酸处存在四个保守的半胱氨酸残基,半胱氨酸残基对糖基转移酶催化反应中的二硫键形成至关重要[14, 15]。Henrik Clausen 等人[15]在 1997 年对B4GALT3 的全长编码序列的测序和克隆进行了相关描述,指出 B4GALT3 序列编码一个具有 4 个残基胞浆域、18 个残基穿膜域、1 个茎区或颈区域和 371 个残基催化域以及具有 4 个潜在 N-链糖基化位点的Ⅱ型跨膜糖蛋白。B4GALT3 基因的结构如图 1.1 所示。而且 B4GALT3 的编码区有 6 个外显子[15],在 5'-非翻译区有一个 34 碱基的内含子[16],全部序列与 B4GALT1 具有 44%的序列同源性[15]。
第四章 结 果4.1 B4GALT3 在不同胃癌细胞系中的表达情况Western blot 检测 B4GALT3 在胃癌 SGC-7901 细胞、MGC-803 细胞和BGC-823 细胞中的蛋白表达水平,并以 GES-1 细胞作为对照。结果如图 4.1 所示:相对于 GES-1 细胞,B4GALT3 在胃癌细胞中表达水平明显上调,具有统计学意义(P<0.05)。
图 4.2 软件预测与 B4GALT3 靶向结合的 miRNAs绿色代表该软件预测有 miRNA 与 B4GALT3 结合;红色代表该软件没有预测到 miRNA 与B4GALT3 有结合;黄色代表预测该 miRNA 的软件总数。通过 miRanda 对上一步筛选出的 miRNAs 进行热力学稳定性和序列保守性评分分析,结果发现上述 20 个靶 miRNAs 中同时满足热力学稳定性评分(mirSVR)绝对值≥0.1,且序列保守性评分(PhastCons)在 0.5~0.7 之间的有7 个,分别是 miR-27a,miR-27b,miR-338-3p,miR-125b,miR-28-5p,miR-379,miR-491-5p,如图 4.3 所示。其中评分位于前两位的 miR-27a,miR-27b 属同一家族,调控的靶基因类似。结合相关文献双荧光素酶报告基因检测证实[24],可得出 B4GALT3 是 miR-27a 潜在的分子靶向基因。
【参考文献】
相关期刊论文 前8条
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本文编号:2789250
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