食管癌相关新miRNA的鉴定与功能的初步研究
发布时间：2020-12-16 08:51
一、研究背景与目的研究发现miRNA的表达异常与多种肿瘤的发生、发展相关,miRNA可能成为肿瘤诊断和预后判断的生物标志物。本研究基于前期Solexa高通量测序及miRDeep2软件预测的结果,对候选新miRNA进行了二级结构预测及实验验证,评估候选新miRNA与食管癌的发病风险,进一步评价它们的生物学功能,初步探讨可能的调控机制,为寻找潜在的肿瘤标志物及其临床应用提供基础数据支持。二、研究方法与结果（一）食管癌相关候选新miRNA的鉴定及与食管癌的发病风险研究基于前期对食管癌细胞RNA的Solexa高通量测序和miRDeep2软件预测的结果,选择了miRDeep2软件评分最高的4个候选新miRNA,使用sflod在线预测网站分析候选新miRNA前体序列的二级结构,结果显示4个候选新miRNA的前体序列都能以较低的自由能形成茎环结构,且成熟体序列分别位于茎环的3’及5’臂上。使用荧光定量PCR检测候选新miRNA在食管癌细胞及食管上皮细胞中的表达情况,结果显示novel-miR-4885、novel-miR-13894、novel-miR-21009均能在食管癌细胞及食管上皮细胞中稳定...
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
候选新miRNA的PCR产物TA克隆测序峰图
癌相关候选新 miRNA 的鉴定及与食管癌的发病风险研究13图1-4. 荧光定量 PCR 检测候选新 miRNA 在食管癌组织及癌旁组织中的相对表达3.2 候选新 miRNA 与食管癌发病风险分析为探讨候选新 miRNA 与食管癌发病之间的关系，以 novelmiRNA 的相对表达(- Cт)为协变量，对数据进行条件 logistic 回归分析。结果显示，novel-miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-21009 表达的升高能显著增加食管癌的发病风险(P<0.05)，而 novel-miR-13894 表达的升高不影响食管癌的发病风险 (P>0.05)。提示 novel- miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-21009 可能是食管癌的促癌因子 (表 1-4)。表1-4. 候选 novel-miRNA 与食管癌患病风险的条件 logistic 回归分析novel-miRNA group β SE Wald P OR 95%CInovel-miR-4885 cancer tissue 0.208 0
第二章 候选新 miRNA 的生物学功能研究21图2-2. 候选新 miRNA 对食管癌细胞早期凋亡的影响，*P<0.05 与 miR-NC 比较3.4 候选新 miRNA 对食管癌细胞增殖的影响通过EdU染色成像法检测miRNAmimic转染后EC109细胞的增殖情况，novle-miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-13894、novel-miR-21009 转染组细胞增殖率分别为(37.25±4.09)%、(31.32±3.53)%、(31.25±1.21)%、(30.71±4.25)%，与对照组(31.36±2.98)%相比，novel-miR-4885转染组的细胞增殖率显著升高(P<0.05)，表明 novel-miR-4885 能促进食管癌细胞的增殖；novel-miR-7121、novel-miR-13894、novel-miR-21009 转染组细胞增殖率与对照组无统计学差异(P>0.05)(图 2-3)。
【参考文献】：
期刊论文
[1]外科治疗Ⅲ期食管癌患者的生存状况研究[J]. 孙嘉阳,郭占林. 中国现代医学杂志. 2017(15)
[2]lncRNA与miRNA相互调控机制的研究进展[J]. 胡铭阳,明佳. 转化医学电子杂志. 2017(02)
[3]环状RNA及其与肿瘤关系的研究进展[J]. 陈畅,王雪莲. 中国病原生物学杂志. 2016(12)
[4]环状RNA:潜在的新型miRNA活性调控分子[J]. 张燕燕,任国诚,张晾. 中国生物化学与分子生物学报. 2015(11)
[5]LncRNA与miRNA的交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响[J]. 芮强,何震宇. 医学综述. 2015(09)
[6]microRNA定量检测方法的研究进展[J]. 祝申蓉,吴旭日,陈依军. 中国药科大学学报. 2015(01)
[7]细胞周期与肿瘤转化医学[J]. 詹启敏,陈杰. 中国肿瘤临床. 2014(01)
[8]食管癌的治疗进展[J]. 辛亮. 山东医药. 2014(02)
[9]miR-590-5p和miR-590-3p参与肝细胞肝癌发展的机制[J]. 杨红飞,郑文宏,赵文淘,关春燕,安靓. 南方医科大学学报. 2013(06)
[10]microRNA与肿瘤细胞周期的关系及其研究方法进展[J]. 周珏宇,石嵘,郑文岭,马文丽. 基础医学与临床. 2013(01)
硕士论文
[1]肝癌中粘附分子α-catenin和β-catenin的甲基化改变[D]. 申思敏.昆明医科大学 2014
本文编号：2919886
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
候选新miRNA的PCR产物TA克隆测序峰图
癌相关候选新 miRNA 的鉴定及与食管癌的发病风险研究13图1-4. 荧光定量 PCR 检测候选新 miRNA 在食管癌组织及癌旁组织中的相对表达3.2 候选新 miRNA 与食管癌发病风险分析为探讨候选新 miRNA 与食管癌发病之间的关系，以 novelmiRNA 的相对表达(- Cт)为协变量，对数据进行条件 logistic 回归分析。结果显示，novel-miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-21009 表达的升高能显著增加食管癌的发病风险(P<0.05)，而 novel-miR-13894 表达的升高不影响食管癌的发病风险 (P>0.05)。提示 novel- miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-21009 可能是食管癌的促癌因子 (表 1-4)。表1-4. 候选 novel-miRNA 与食管癌患病风险的条件 logistic 回归分析novel-miRNA group β SE Wald P OR 95%CInovel-miR-4885 cancer tissue 0.208 0
第二章 候选新 miRNA 的生物学功能研究21图2-2. 候选新 miRNA 对食管癌细胞早期凋亡的影响，*P<0.05 与 miR-NC 比较3.4 候选新 miRNA 对食管癌细胞增殖的影响通过EdU染色成像法检测miRNAmimic转染后EC109细胞的增殖情况，novle-miR-4885、novel-miR-7121、novel-miR-13894、novel-miR-21009 转染组细胞增殖率分别为(37.25±4.09)%、(31.32±3.53)%、(31.25±1.21)%、(30.71±4.25)%，与对照组(31.36±2.98)%相比，novel-miR-4885转染组的细胞增殖率显著升高(P<0.05)，表明 novel-miR-4885 能促进食管癌细胞的增殖；novel-miR-7121、novel-miR-13894、novel-miR-21009 转染组细胞增殖率与对照组无统计学差异(P>0.05)(图 2-3)。
【参考文献】：
期刊论文
[1]外科治疗Ⅲ期食管癌患者的生存状况研究[J]. 孙嘉阳,郭占林. 中国现代医学杂志. 2017(15)
[2]lncRNA与miRNA相互调控机制的研究进展[J]. 胡铭阳,明佳. 转化医学电子杂志. 2017(02)
[3]环状RNA及其与肿瘤关系的研究进展[J]. 陈畅,王雪莲. 中国病原生物学杂志. 2016(12)
[4]环状RNA:潜在的新型miRNA活性调控分子[J]. 张燕燕,任国诚,张晾. 中国生物化学与分子生物学报. 2015(11)
[5]LncRNA与miRNA的交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响[J]. 芮强,何震宇. 医学综述. 2015(09)
[6]microRNA定量检测方法的研究进展[J]. 祝申蓉,吴旭日,陈依军. 中国药科大学学报. 2015(01)
[7]细胞周期与肿瘤转化医学[J]. 詹启敏,陈杰. 中国肿瘤临床. 2014(01)
[8]食管癌的治疗进展[J]. 辛亮. 山东医药. 2014(02)
[9]miR-590-5p和miR-590-3p参与肝细胞肝癌发展的机制[J]. 杨红飞,郑文宏,赵文淘,关春燕,安靓. 南方医科大学学报. 2013(06)
[10]microRNA与肿瘤细胞周期的关系及其研究方法进展[J]. 周珏宇,石嵘,郑文岭,马文丽. 基础医学与临床. 2013(01)
硕士论文
[1]肝癌中粘附分子α-catenin和β-catenin的甲基化改变[D]. 申思敏.昆明医科大学 2014
本文编号：2919886
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/2919886.html
