胰腺癌循环肿瘤细胞（CTCs）的转录组分析

发布时间：2021-01-28 11:50

　　胰腺癌是预后较差和死亡率较高的恶性肿瘤之一,其中肿瘤细胞的转移是造成胰腺癌患者死亡的主要原因。胰腺癌中某些细胞能够突破基底膜、渗透至血液中,并伴随循环系统迁移至其他组织或器官,这些细胞被称为循环肿瘤细胞（Circulating Tumor Cells,CTCs）。近年来的研究发现,CTCs在患者液体活检中具有重要的预后意义。不仅如此,越来越多的证据表明,CTCs作为肿瘤转移的种子,在脱离原发病灶后能够抑制失巢凋亡,在血液循环中抵抗流体剪切力和并躲避免疫监视,其存活现象与内在基因表达机制可能能够为肿瘤治疗和转移阻断提供新的思路。然而,目前关于CTCs的内在机制的研究仍不充分,其中的关键调控因子、不同转录模式、存活和免疫逃逸机制以及关键基因与患者生存的确切关系仍未得到深入的、系统的研究。为了研究胰腺癌CTCs中的关键基因和表达模式,我们首先下载了来自GEO数据库的包含75个胰腺癌CTCs的共187个样本的转录组数据,识别其中未被注释的CTCs特异性的新lncRNA,并通过其表达调控作用及共表达网络的计算,寻找其中起到关键调控作用的lncRNA。基于包含新lncRNA的胰腺癌转录组数据,我们... 

【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

本研究技术路线

16图 2.2 基于 TSS 距离计算出的邻近的成对转录本、随机成对转录本之间的相关系数绝对分布及各个分布两两之间的差异显著性。箱图（A）表示 10 种成对转录本之间的转录相性，下图（B）表示上图中两两箱图的相关性分布之间的差异显著性，通过四种颜色划分为 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四个差异显著性水平

2.3 基于 gene body 距离计算出的邻近的成对转录本、随机成对转录本之间的相关系对值分布及各个分布两两之间的差异显著性。箱图（A）表示 10 种成对转录本之间的相关性，下图（B）表示上图中两两箱图相关性分布之间的差异显著性，通过四种颜划分为 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四个差异显著性水平


本文编号：3004946