脂肪酸合成酶作为癌症治疗靶点的生物信息学分析
发布时间：2021-02-16 08:58
目的基于生物信息学探究脂肪酸合成酶（FASN）在癌症中的作用,为将FASN作为肿瘤诊断生物标志物和防控靶点提供线索。方法从癌症基因组图谱TCGA数据库中获取10 967份样本资料,采用cBioPortal和GEPIA肿瘤基因分析工具,探究FASN基因在癌症病人中的序列变化和表达情况,并进一步分析FASN在肿瘤组织和正常组织间的表达差异;从GEO数据库获取非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）病人的样本数据,分析FASN在NAFLD诱发肝细胞癌疾病进程中的作用;采用String数据库检索FASN相关蛋白并进行富集功能注释。结果 FASN基因在10 967份癌组织样本中的改变率为4.60%,在肝细胞癌、膀胱癌等多种实体瘤中表达上升;FASN在NAFLD组和对照组的表达值为9.78±0.74和8.99±1.21（P<0.05）,在重度脂肪变性和轻度脂肪变性患者的表达值为791.89±420.59和562.85±432.87（P<0.05）;FASN相关蛋白的生物学功能主要为介导蛋白间结合、调节催化酶活性以及调控能量代谢。结论 FASN与多种癌症的发生发展密切相关,靶向抑制FASN有希望...
【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(03)北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
FASN基因在不同癌症中的变化
在cBioPortal中进一步分析FASN mRNA在32种不同肿瘤组织中的表达情况,我们发现FASN在乳腺癌、前列腺癌、肝细胞癌和肺癌等多种肿瘤组织中呈现高表达(图2)。为了探究FASN在癌组织与正常组织之间的表达差异,我们利用GEPIA工具分析TCGA数据库中癌症病人与匹配病例样本中FASN的表达,经过对数转化,得到表达差异分布图(图3)。结果显示,FASN在肝细胞癌、膀胱癌、结肠癌和胰腺癌等多种实体瘤中表达上升(图3),提示FASN异常表达增高与上述肿瘤的发生相关。图3 FASN在不同癌组织与正常组织的表达差异
FASN在不同癌组织与正常组织的表达差异
【参考文献】：
期刊论文
[1]脂肪酸合成酶在肿瘤细胞中的作用[J]. 罗一成,王继辰. 肿瘤代谢与营养电子杂志. 2018(04)
[2]非酒精性脂肪性肝病防治指南（2018更新版）[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease,Chinese Society of Hepatology,Chinese Medical Association;Fatty Liver Expert Committee,Chinese Medical Doctor Association;. 现代医药卫生. 2018(05)
本文编号：3036536
【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(03)北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
FASN基因在不同癌症中的变化
在cBioPortal中进一步分析FASN mRNA在32种不同肿瘤组织中的表达情况,我们发现FASN在乳腺癌、前列腺癌、肝细胞癌和肺癌等多种肿瘤组织中呈现高表达(图2)。为了探究FASN在癌组织与正常组织之间的表达差异,我们利用GEPIA工具分析TCGA数据库中癌症病人与匹配病例样本中FASN的表达,经过对数转化,得到表达差异分布图(图3)。结果显示,FASN在肝细胞癌、膀胱癌、结肠癌和胰腺癌等多种实体瘤中表达上升(图3),提示FASN异常表达增高与上述肿瘤的发生相关。图3 FASN在不同癌组织与正常组织的表达差异
FASN在不同癌组织与正常组织的表达差异
【参考文献】：
期刊论文
[1]脂肪酸合成酶在肿瘤细胞中的作用[J]. 罗一成,王继辰. 肿瘤代谢与营养电子杂志. 2018(04)
[2]非酒精性脂肪性肝病防治指南（2018更新版）[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease,Chinese Society of Hepatology,Chinese Medical Association;Fatty Liver Expert Committee,Chinese Medical Doctor Association;. 现代医药卫生. 2018(05)
本文编号：3036536
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