Pdlim1/2/7表达在急性髓系白血病中的临床意义
发布时间:2021-04-02 11:23
目的:近年来,Pdliml/2/7基因已经被报道在实体肿瘤的发生、发展中起着重要作用,是一种癌基因。然而其在恶性血液系统疾病尤其是急性髓系白血病(acute myeloidleukemia,AML)中的作用还有待研究。本研究拟探索AML中Pdliml/2/7基因的表达、甲基化水平及其对患者预后的影响,以期为AML患者的预后分层、疗效观察及病情监控提供有效生物标志。方法:收集AML患者和健康对照骨髓标本,进行RNA、DNA提取,并将RNA逆转录成cDNA、DNA进行亚硫酸氢盐修饰。应用实时定量荧光PCR(real-time quantitative PCR,RQ-PCR)检测 AML 患者中 Pdlim1/2/7 基因表达,并利用 SPSS 20.0软件对数据进行处理。通过应用蛋白印迹法(Westernblot)检测白血病细胞株中Pdlim1蛋白表达。应用实时定量甲基化特异性PCR(real-time quantitative methylation-specific PCR,RQ-MSP)分析 AML 患者中 Pdlim1 启动子区甲基化水平。结果:1.在GEO数据集GSE24006和...
【文章来源】:江苏大学江苏省
【文章页数】:71 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GSE24006及GSE63270中AML和NBM差异表达的热图和火山图
江苏大学硕士学位论文25图4.2aGSE24006数据集中Pdlim1在AML患者和对照组中的表达;bGSE63270数据集中Pdlim1在AML患者和对照组中的表达;cGSE63270中Pdlim2在AML患者和对照组中的表达;dGSE24006中Pdlim7在AML患者和对照组中的表达。Figure4.2a.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006;b.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270;c.ExpressionlevelofPdlim2inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270;d.ExpressionlevelofPdlim7inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006.4.2.2Pdlim1表达在HSC分化过程中呈现动态变化同时我们对Pdlim1表达在造血干细胞(hematopoieticstemcell,HSC)向外周血成熟细胞分化过程中的变化情况进行研究。我们选取两组正常造血细胞的表GSE24006p<0.001GSE63270p<0.001图4.2aPdlim1图4.2bPdlim1图4.2dPdlim7图4.2cPdlim2GSE63270p<0.001GSE24006p<0.001
Pdlim1/2/7表达在急性髓系白血病中的临床意义26达谱数据集GSE42519和GSE13159进行分析来研究HSC髓系分化过程中Pdlim1基因的表达情况。如图4.3结果显示Pdlim1表达在AML中与成熟外周血细胞相比明显上调,且该基因在HSC中表达最高,随着血细胞分化成熟其表达逐渐下调,由此我们猜测,Pdlim1基因参与HSC向成熟外周血细胞增殖分化过程,且随着HSC分化成熟呈现出规律性动态变化。以上结果说明Pdlim1基因与早期造血调控和造血干细胞分化密切相关。图4.3Pdlim1基因随着造血细胞分化过程中的其表达产生变化(公共数据集GSE42519和GSE13159)Figure4.3TheexpressionpatternofPdlim1duringdifferentiationofthemajorhematopoieticlineages(publisheddatasetGSE42519andGSE13159)4.2.3PCR、Westernblot检测Pdlim1在白血病细胞株中表达水平首先用PCR检测Pdlim1基因在白血病细胞株中转录水平,如图4.4,Pdlim1mRNA在白血病细胞株U937、SHI-1、THP1、K562、HEL、HL60、SKM1和HEP2高表达。接着用Westernblot检测了白血病细胞株THP1和HL60中Pdlim1的蛋白表达量,实验结果显示,THP1细胞株和HL60细胞株中Pdlim1蛋白水平也较高,结果见图4.5。12345678910
本文编号:3115185
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【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GSE24006及GSE63270中AML和NBM差异表达的热图和火山图
江苏大学硕士学位论文25图4.2aGSE24006数据集中Pdlim1在AML患者和对照组中的表达;bGSE63270数据集中Pdlim1在AML患者和对照组中的表达;cGSE63270中Pdlim2在AML患者和对照组中的表达;dGSE24006中Pdlim7在AML患者和对照组中的表达。Figure4.2a.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006;b.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270;c.ExpressionlevelofPdlim2inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270;d.ExpressionlevelofPdlim7inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006.4.2.2Pdlim1表达在HSC分化过程中呈现动态变化同时我们对Pdlim1表达在造血干细胞(hematopoieticstemcell,HSC)向外周血成熟细胞分化过程中的变化情况进行研究。我们选取两组正常造血细胞的表GSE24006p<0.001GSE63270p<0.001图4.2aPdlim1图4.2bPdlim1图4.2dPdlim7图4.2cPdlim2GSE63270p<0.001GSE24006p<0.001
Pdlim1/2/7表达在急性髓系白血病中的临床意义26达谱数据集GSE42519和GSE13159进行分析来研究HSC髓系分化过程中Pdlim1基因的表达情况。如图4.3结果显示Pdlim1表达在AML中与成熟外周血细胞相比明显上调,且该基因在HSC中表达最高,随着血细胞分化成熟其表达逐渐下调,由此我们猜测,Pdlim1基因参与HSC向成熟外周血细胞增殖分化过程,且随着HSC分化成熟呈现出规律性动态变化。以上结果说明Pdlim1基因与早期造血调控和造血干细胞分化密切相关。图4.3Pdlim1基因随着造血细胞分化过程中的其表达产生变化(公共数据集GSE42519和GSE13159)Figure4.3TheexpressionpatternofPdlim1duringdifferentiationofthemajorhematopoieticlineages(publisheddatasetGSE42519andGSE13159)4.2.3PCR、Westernblot检测Pdlim1在白血病细胞株中表达水平首先用PCR检测Pdlim1基因在白血病细胞株中转录水平,如图4.4,Pdlim1mRNA在白血病细胞株U937、SHI-1、THP1、K562、HEL、HL60、SKM1和HEP2高表达。接着用Westernblot检测了白血病细胞株THP1和HL60中Pdlim1的蛋白表达量,实验结果显示,THP1细胞株和HL60细胞株中Pdlim1蛋白水平也较高,结果见图4.5。12345678910
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