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荧光原位杂交基因探针诊断Xp11.2易位性肾癌和ASPL-TFE3肾癌

发布时间:2021-04-13 04:06
  Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌(简称Xp11.2易位性肾癌)是2004年WHO新分类的一种肾癌亚型,它是以TFE3基因断裂,并与ASPL、PRCC、 CLTC、PSF、NonO等相关基因发生平衡易位,形成TFE3融合基因为特征。其主要好发于青少年,约占儿童肾癌的1/3,45岁以下肾癌的15%,占成年肾癌患者的1%左右。该肾癌预后总体较差,对于常规的放化疗均不敏感,手术治疗是主要方式,但多数患者易出现远处转移,靶向治疗部分有效。Xp11.2易位性肾癌的准确诊断对判断患者的预后以及术后的辅助治疗至关重要。但是,目前Xp11.2易位性肾癌的诊断主要是停留在组织学水平和免疫组化水平,相关研究提示这些方法存在误诊和漏诊的可能。在Xp11.2易位性肾癌所有融合基因类型中,ASPL-TFE3肾癌是发病率最高的一种,也是预后最差的一种,目前仍没有适合于临床的方法诊断该肾癌。因此进一步准确诊断Xp11.2易位性肾癌和ASPL-TFE3肾癌,值得进一步的研究与探索。为此,我们设计了TFE3分离探针用于诊断Xp11.2易位性肾癌以及ASPL-TFE3双融合探针用于诊断ASPL-TFE3肾癌。目... 

【文章来源】:南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:51 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

荧光原位杂交基因探针诊断Xp11.2易位性肾癌和ASPL-TFE3肾癌


图2-1:?TFE3分离探针设计模式图??

设计模式,探针,日化,名称


RPll-?RPll-?RPll-??63?化?10?日化16?475F12??國2-2;?ASPL^E3双融合探针中ASPL段设计模式图??表2-3?ASPLTFE3双諫合探针TFE3基因处BAC克隆的基本信息??克隆名称?定位?片段大小??CTD-2516D6?chrX:4826%3?6-48484403?218Kb??CTD-2522M13?chrX:48420425-4%02847?182Kb??RP11-416B14?chrX:48580872-48763I98?182Kb??CTD-2311N12?XPl?1:48713289-48923401?210Kb??CTD-2312C1?chrX:48959513-49170367?210Kb??CTD-2248C21?chrX:49154756-4?>242991?88Kb??RPH-9?巧?H17?chrX:4?犯93025-49440119?147Kb??

片段,信息学,生物信息学分析,生物学


3.2对所选BAC克隆进行生物信息学分析??(1)通过Ensemble数据库了解所选克隆在染色体中的位置,W及周围基因??情况。??口)通过http://projects.tcag.ca/efi油网站对所选的BAC克隆的恃异性分析进??行生物学信息学分析,明确其所选克隆的特异性。确定BAC克隆,从invitrogen??公司订购该克隆。??eFISH?Result??

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3134583

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