长链非编码RNA-LCAT1在肺癌发生发展中作用机制研究
发布时间:2021-04-20 15:39
长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,基因组中大约只有2%的基因能够编码蛋白质,剩下的约98%的基因并不具有蛋白编码的功能。近年来越来越多的研究表明lnc RNA在多种肿瘤的发生发展中扮演者重要的角色。lnc RNA可以调控肿瘤细胞的增殖、细胞运动、血管新生以及细胞骨架的形成。肺癌是所有癌症中发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,肺癌病人的五年生存率仍然保持在15%左右。肺癌的发病率和死亡率高居不下不仅仅与空气污染和环境恶化相关,同样的也因为肺癌的在早期难以诊断,缺乏相应的早期诊断标志物。因此开发肺癌早期诊断标志物迫在眉睫。目前,长链非编码RNA在肺癌发生中的生物学功能以及临床研究意义还不够清楚。因此研究lnc RNA在肺癌发生发展中的作用机理以及将lnc RNA作为其早期诊断标志物有着重要的基础与临床研究意义。为探究lnc RNAs在肺癌发生中扮演的角色,我们首先对TCGA数据库中的485例肺腺癌样本和56例癌旁样本的RNA-seq数据进行lnc RNA鉴定和差异表达分析。我们鉴定筛选出一条新的lnc RNA,命名为...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:146 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
致谢
中文摘要
英文摘要
缩略词表
第一部分 :长链非编码RNA-LCAT1内源性竞争性结合miR-4715-5p调控Rac1/Pak1功能促进肺癌的发生发展
1 引言
2 材料与方法
2.1 常用仪器和试剂
2.2 主要试剂耗材
2.3 细胞系和组织样本
2.4 缓冲液和培养液的配置方法
2.5 实验方法
3 结果
3.1 从TCGA数据库中筛选差异表达的长链非编码 RNA-LCAT1
3.2 沉默LCAT1抑制在体内和体外肺癌细胞的增殖
3.3 敲低LCAT1可以在体内抑制肺癌细胞的增殖
3.4 LCAT1沉默能在体内和体外抑制肺癌细胞迁移和侵袭
3.5 敲低LCAT1会导致细胞周期阻滞并造成基因表达谱改变
3.6 LCAT1 作为內源竞争性结合的RNA起作用(Competing endogenous RNA)
3.7 LCAT1 的生物学功能至少一部分是通过调控miR-4715-5p来实现的
3.8 RAC1 作为miR-4715-5p的靶基因受到LCAT1 间接调控
3.9 RAC1促进肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭
3.10 LCAT1 通过吸附miR-4715-5p来调控下游RAC1/PAK1 的功能从而促进肺癌细胞的增殖以及进程
3.11 RAC1抑制剂作为佐剂能够在体外提高紫杉醇对肺癌细胞的杀伤
4 讨论
5 结论与展望
参考文献
第二部分 :长链非编码RNA-LCAT1 通过调节c-Myc功能从而促进肺癌细胞的进程
1 引言
2 实验材料与方法
2.1 常用仪器和试剂
2.2 主要试剂耗材
2.3 细胞系
2.4 实验方法
3 结果
3.1 LCAT1与FUBP3 蛋白相互结合
3.2 FUBP3在肺癌细胞中的生物学功能探究
3.3 si RNA敲低FUBP3 导致c-Myc蛋白水平下降而不影响其m RNA的表达
3.4 LCAT1 敲低不影响c-Myc的 m RNA表达却显著降低蛋白表达
3.5 FUBP3 敲低不影响c-Myc蛋白的半衰期
3.6 LCAT1 敲减不改变c-Myc蛋白的稳定性
3.7 FUBP3和LCAT1 敲低不影响c-Myc m RNA稳定性
4 讨论
5 结论
参考文献
综述 非编 RNA在肿瘤中作用研究
参考文献
作者简历及在学期间取的科研成果
本文编号:3149954
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:146 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
致谢
中文摘要
英文摘要
缩略词表
第一部分 :长链非编码RNA-LCAT1内源性竞争性结合miR-4715-5p调控Rac1/Pak1功能促进肺癌的发生发展
1 引言
2 材料与方法
2.1 常用仪器和试剂
2.2 主要试剂耗材
2.3 细胞系和组织样本
2.4 缓冲液和培养液的配置方法
2.5 实验方法
3 结果
3.1 从TCGA数据库中筛选差异表达的长链非编码 RNA-LCAT1
3.2 沉默LCAT1抑制在体内和体外肺癌细胞的增殖
3.3 敲低LCAT1可以在体内抑制肺癌细胞的增殖
3.4 LCAT1沉默能在体内和体外抑制肺癌细胞迁移和侵袭
3.5 敲低LCAT1会导致细胞周期阻滞并造成基因表达谱改变
3.6 LCAT1 作为內源竞争性结合的RNA起作用(Competing endogenous RNA)
3.7 LCAT1 的生物学功能至少一部分是通过调控miR-4715-5p来实现的
3.8 RAC1 作为miR-4715-5p的靶基因受到LCAT1 间接调控
3.9 RAC1促进肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭
3.10 LCAT1 通过吸附miR-4715-5p来调控下游RAC1/PAK1 的功能从而促进肺癌细胞的增殖以及进程
3.11 RAC1抑制剂作为佐剂能够在体外提高紫杉醇对肺癌细胞的杀伤
4 讨论
5 结论与展望
参考文献
第二部分 :长链非编码RNA-LCAT1 通过调节c-Myc功能从而促进肺癌细胞的进程
1 引言
2 实验材料与方法
2.1 常用仪器和试剂
2.2 主要试剂耗材
2.3 细胞系
2.4 实验方法
3 结果
3.1 LCAT1与FUBP3 蛋白相互结合
3.2 FUBP3在肺癌细胞中的生物学功能探究
3.3 si RNA敲低FUBP3 导致c-Myc蛋白水平下降而不影响其m RNA的表达
3.4 LCAT1 敲低不影响c-Myc的 m RNA表达却显著降低蛋白表达
3.5 FUBP3 敲低不影响c-Myc蛋白的半衰期
3.6 LCAT1 敲减不改变c-Myc蛋白的稳定性
3.7 FUBP3和LCAT1 敲低不影响c-Myc m RNA稳定性
4 讨论
5 结论
参考文献
综述 非编 RNA在肿瘤中作用研究
参考文献
作者简历及在学期间取的科研成果
本文编号:3149954
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