基于生物信息学分析口腔鳞状细胞癌ceRNA调控网络的构建

发布时间：2021-05-09 04:54

　　口腔鳞状细胞癌（oral20squamous20cell20carcinoma,OSCC）是全球十大最常见的癌症之一,全球每年新增病例大约300,000,而五年生存率大约50%。口腔癌是一个广义的术语,包括了颊部、舌部、舌基底部、牙龈、口底、硬腭等部位的恶性肿瘤,其中约95%的口腔恶性肿瘤是鳞状细胞癌。口腔鳞状细胞癌的分子机制尚未完全探明。因此,探索口腔鳞癌进展过程中的关键分子,阐明其在口腔鳞癌进展中的作用,并为诊断口腔鳞癌寻找一些个性化的分子标志物是十分必要的。同时,这些标志物可以帮助口腔鳞癌患者寻找治疗分子靶标,进行预后判断和个性化定制治疗方案。目前随着高通量测序技术的发展,相较传统技术成本更低、更快速且更灵敏。因此,伴随着高通量测序数据的发展,促进了测序数据分析方法的发展,也为进一步探索生命科学的基因表达调控关系提供了基础。本研究的目的是通过一系列生物信息学分析探索口腔鳞状细胞癌与基因表达的关系,筛选出差异表达的RNA,构建ceRNA网络以及探索潜在的生物学标志物。首先我们从TCGA数据库中下载口腔鳞癌患者的RNA-seq,miRNA-seq和临床数据并进行标准化、注释以及整合。... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 有关数据库和分析工具的介绍
    1.1 TCGA数据库
    1.2 R语言
    1.3 DAVID
    1.4 Cytoscape可视化工具
    1.5 ceRNA数据库
第二章 TCGA数据库中口腔鳞状细胞癌的生物学分析
    2.1 研究目的和意义
    2.2 材料和方法
    2.3 结果
    2.4 讨论
全文总结
参考文献
附录
    病例一
    病例二
    病例三
    病例四
    病例五
中英文对照缩略词
致谢



本文编号：3176665