维生素D水平/缺乏与肝癌发生风险的孟德尔随机化研究
发布时间：2021-05-28 08:37
目的:采用孟德尔随机化方法,选择代表维生素D（Vitamin D,VD）水平/缺乏的遗传变异构建遗传风险评分（Genetic risk score,GRS）,以此作为工具变量,进行VD水平/缺乏与原发性肝癌（简称“肝癌”）发生的因果关系分析。方法:1、采用1:1频数匹配的病例对照研究方法。病例组为南方医科大学顺德医院收治的30～79岁新发肝癌病例,共1068例;1068例健康对照以及构建工具变量的2000例健康个体均来自于顺德健康筛查人群。2、采用酶联免疫法检测血清25（OH）D浓度。选择GWAS报道且在亚洲人群中经验证以及课题组前期验证的共9个VD关联变异作为目标遗传变异（rs12785878、rs1790349、rs4588、rs7041、rs1155563、rs10741657、rs12794714、rs6013897和rs2209314）,应用TaqMan荧光定量PCR技术进行基因分型。3、按照血清25（OH）D<50nmol/L判断为VD缺乏的标准,将VD水平进行分类（VD缺乏/不缺乏）。为排除季节因素（日照时数）影响VD水平所致的混杂偏倚,仅纳入采样时间相近（1～5月...
【文章来源】：广东药科大学广东省
【文章页数】：100 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 前言
1.1 肝癌的流行现状
1.2 VD抗肝癌的生物学机制研究现状
1.3 VD水平/缺乏与肝癌发生流行病学研究现状
1.4 观察法研究易受混杂和反向因果偏倚影响
1.5 孟德尔随机化以遗传变异作为工具变量,能呈现暴露与疾病间的真实关系
1.6 敏感性分析考察孟德尔随机化研究结果的稳健性
1.7 VD水平关联遗传变异已验证,为VD与肝癌的孟德尔随机化研究提供契机
课题思路(技术路线)
第二章 材料与方法
2.1 确定研究对象和统计效能估计
2.1.1 确定研究对象
2.1.2 统计效能估计
2.2 资料收集和生物样本采集
2.2.1 流行病学调查和临床数据收集
2.2.2 血样标本采集和处理
2.3 选择遗传变异
2.4 实验室试剂、设备和耗材
2.4.1 主要试剂
2.4.2 专用设备
2.4.3 主要耗材
2.5 实验室检测
2.5.1 检测血清25(OH)D浓度
2.5.2 检测血清乙肝五项
2.5.3 提取血液DNA
2.5.4 检测遗传变异
2.6 质量控制
2.6.1 收集资料的质量控制
2.6.2 实验室检测的质量控制
2.7 统计分析
2.7.1 研究对象的特征
2.7.2 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的关联分析(传统的观察法分析)
2.7.3 验证VD水平/缺乏关联的遗传变异
2.7.4 计算VD水平/缺乏的遗传风险评分(构建工具变量)
2.7.5 验证工具变量(遗传风险评分,GRS)的稳健性
2.7.6 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
2.7.7 多效性检验
2.7.8 敏感性分析
第三章 结果
3.1 研究对象的特征
3.2 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的关联分析
3.3 健康个体中验证VD水平/缺乏的遗传变异
3.3.1 哈迪温伯格平衡检验和连锁不平衡检验
3.3.2 健康个体中验证VD水平的遗传变异
3.3.3 健康个体中验证VD缺乏的遗传变异
3.4 构建工具变量(遗传风险评分,GRS)
3.4.1 VD水平的遗传风险评分与VD水平的关联分析
3.4.2 VD缺乏的遗传风险评分与VD缺乏的关联分析
3.4.3 弱工具变量检验和效能检验
3.5 VD水平与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
3.6 VD缺乏与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
3.7 检验工具变量的多效性
3.7.1 VD水平/缺乏关联遗传变异与混杂因素的关联分析
3.7.2 VD水平/缺乏的遗传风险评分与混杂因素的关联分析
3.8 敏感性分析
3.8.1 新遗传风险评分与肝癌因果关联的敏感性分析
3.8.2 遗传风险评分与肝癌因果关联在观察组二的敏感性分析
第四章 讨论
4.1 传统的观察性分析:VD水平/缺乏与肝癌发生的病例对照研究
4.2 孟德尔随机化分析:VD水平/缺乏与肝癌发生的因果推断
4.3 验证孟德尔随机化研究的前提条件、敏感性分析确保研究结果的稳定性
第五章 创新与不足
5.1 创新
5.2 不足
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
综述
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表的论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]维生素D缺乏与酒精性肝病的相关性研究[J]. 杨冰冰,胡纯秋,胡永迪,储兰兰,徐德祥. 安徽医科大学学报. 2019(08)
[2]肝癌发生发展机制的研究进展及其治疗现状[J]. 陈世发,赵礼金. 中国普通外科杂志. 2018(07)
[3]Association between serum vitamin D levels and gastric cancer:A retrospective chart analysis[J]. Neil Vyas,Rafael Ching Companioni,Melik Tiba,Hassan Alkhawam,Carmine Catalano,Robert Sogomonian,Joel Baum,Aaron Walfish. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2016(09)
[4]Cancer incidence and mortality in Guangdong province,2012[J]. Ruilin Meng,Kuangrong Wei,Liang Xia,Yanjun Xu,Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Lifeng Lin. Chinese Journal of Cancer Research. 2016(03)
[5]维生素D与成年人骨骼健康应用指南（2014年标准版）[J]. 廖祥鹏,张增利,张红红,朱汉民,周建烈,黄琪仁,汪之顼,王亮,刘忠厚. 中国骨质疏松杂志. 2014(09)
[6]维生素D与癌症:研究现状和展望[J]. 李绵,陈培战,李晓光,王慧. 生命科学. 2013(02)
[7]原发性肝癌诊疗规范（2011年版）[J]. Ministry of Health of the People’s Republic of China. 临床肝胆病杂志. 2011(11)
[8]Vitamin D for the prevention and treatment of pancreatic cancer[J]. Kun-Chun Chiang, Department of Surgery, Chang Gung Memorial Hospital, Chang Gung University, Taoyuan 333, Taiwan, ChinaTai C Chen, Boston University School of Medicine, 715 Albany Street, Boston, MA 02118, United States. World Journal of Gastroenterology. 2009(27)
硕士论文
[1]顺德区30岁以上人群血清VD水平及不同遗传特征人群VD营养状况[D]. 周新凤.广东药科大学 2019
本文编号：3207932
【文章来源】：广东药科大学广东省
【文章页数】：100 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 前言
1.1 肝癌的流行现状
1.2 VD抗肝癌的生物学机制研究现状
1.3 VD水平/缺乏与肝癌发生流行病学研究现状
1.4 观察法研究易受混杂和反向因果偏倚影响
1.5 孟德尔随机化以遗传变异作为工具变量,能呈现暴露与疾病间的真实关系
1.6 敏感性分析考察孟德尔随机化研究结果的稳健性
1.7 VD水平关联遗传变异已验证,为VD与肝癌的孟德尔随机化研究提供契机
课题思路(技术路线)
第二章 材料与方法
2.1 确定研究对象和统计效能估计
2.1.1 确定研究对象
2.1.2 统计效能估计
2.2 资料收集和生物样本采集
2.2.1 流行病学调查和临床数据收集
2.2.2 血样标本采集和处理
2.3 选择遗传变异
2.4 实验室试剂、设备和耗材
2.4.1 主要试剂
2.4.2 专用设备
2.4.3 主要耗材
2.5 实验室检测
2.5.1 检测血清25(OH)D浓度
2.5.2 检测血清乙肝五项
2.5.3 提取血液DNA
2.5.4 检测遗传变异
2.6 质量控制
2.6.1 收集资料的质量控制
2.6.2 实验室检测的质量控制
2.7 统计分析
2.7.1 研究对象的特征
2.7.2 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的关联分析(传统的观察法分析)
2.7.3 验证VD水平/缺乏关联的遗传变异
2.7.4 计算VD水平/缺乏的遗传风险评分(构建工具变量)
2.7.5 验证工具变量(遗传风险评分,GRS)的稳健性
2.7.6 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
2.7.7 多效性检验
2.7.8 敏感性分析
第三章 结果
3.1 研究对象的特征
3.2 VD水平/缺乏与肝癌发生风险的关联分析
3.3 健康个体中验证VD水平/缺乏的遗传变异
3.3.1 哈迪温伯格平衡检验和连锁不平衡检验
3.3.2 健康个体中验证VD水平的遗传变异
3.3.3 健康个体中验证VD缺乏的遗传变异
3.4 构建工具变量(遗传风险评分,GRS)
3.4.1 VD水平的遗传风险评分与VD水平的关联分析
3.4.2 VD缺乏的遗传风险评分与VD缺乏的关联分析
3.4.3 弱工具变量检验和效能检验
3.5 VD水平与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
3.6 VD缺乏与肝癌发生风险的孟德尔随机化分析
3.7 检验工具变量的多效性
3.7.1 VD水平/缺乏关联遗传变异与混杂因素的关联分析
3.7.2 VD水平/缺乏的遗传风险评分与混杂因素的关联分析
3.8 敏感性分析
3.8.1 新遗传风险评分与肝癌因果关联的敏感性分析
3.8.2 遗传风险评分与肝癌因果关联在观察组二的敏感性分析
第四章 讨论
4.1 传统的观察性分析:VD水平/缺乏与肝癌发生的病例对照研究
4.2 孟德尔随机化分析:VD水平/缺乏与肝癌发生的因果推断
4.3 验证孟德尔随机化研究的前提条件、敏感性分析确保研究结果的稳定性
第五章 创新与不足
5.1 创新
5.2 不足
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
综述
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表的论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]维生素D缺乏与酒精性肝病的相关性研究[J]. 杨冰冰,胡纯秋,胡永迪,储兰兰,徐德祥. 安徽医科大学学报. 2019(08)
[2]肝癌发生发展机制的研究进展及其治疗现状[J]. 陈世发,赵礼金. 中国普通外科杂志. 2018(07)
[3]Association between serum vitamin D levels and gastric cancer:A retrospective chart analysis[J]. Neil Vyas,Rafael Ching Companioni,Melik Tiba,Hassan Alkhawam,Carmine Catalano,Robert Sogomonian,Joel Baum,Aaron Walfish. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2016(09)
[4]Cancer incidence and mortality in Guangdong province,2012[J]. Ruilin Meng,Kuangrong Wei,Liang Xia,Yanjun Xu,Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Lifeng Lin. Chinese Journal of Cancer Research. 2016(03)
[5]维生素D与成年人骨骼健康应用指南（2014年标准版）[J]. 廖祥鹏,张增利,张红红,朱汉民,周建烈,黄琪仁,汪之顼,王亮,刘忠厚. 中国骨质疏松杂志. 2014(09)
[6]维生素D与癌症:研究现状和展望[J]. 李绵,陈培战,李晓光,王慧. 生命科学. 2013(02)
[7]原发性肝癌诊疗规范（2011年版）[J]. Ministry of Health of the People’s Republic of China. 临床肝胆病杂志. 2011(11)
[8]Vitamin D for the prevention and treatment of pancreatic cancer[J]. Kun-Chun Chiang, Department of Surgery, Chang Gung Memorial Hospital, Chang Gung University, Taoyuan 333, Taiwan, ChinaTai C Chen, Boston University School of Medicine, 715 Albany Street, Boston, MA 02118, United States. World Journal of Gastroenterology. 2009(27)
硕士论文
[1]顺德区30岁以上人群血清VD水平及不同遗传特征人群VD营养状况[D]. 周新凤.广东药科大学 2019
本文编号：3207932
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