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基于质谱的肺腺癌淋巴结转移相关蛋白质组学及磷酸化修饰组学研究

发布时间:2021-06-24 14:35
  目的肺腺癌是恶性程度最高的肿瘤之一,淋巴结转移是其最主要的转移途径之一。一部分患者在肿瘤体积较小时即出现淋巴结转移,蛋白质是生命功能的执行者,了解这部分患者淋巴结转移相关蛋白具有重要的临床价值。本研究通过基于质谱的蛋白组学及磷酸化修饰组学,探索肺腺癌淋巴结转移关键蛋白和通路,并尝试建立蛋白亚组。方法本研究入组52例肺腺癌患者并收集临床资料,其中实验组(淋巴结转移性肺腺癌,病理分期T1b N2M0)病例25例,对照组(无淋巴结转移性肺腺癌病理分期T3-4N0M0)病例27例。利用52例患者的冰冻肿瘤样本和正常肺组织样本,通过基于质谱的4D-LFQ定量蛋白质组学技术鉴定蛋白并进行定量,由于样本量限制,42例患者进行了蛋白磷酸化修饰组学检测。本研究以差异表达量变化≥2作为显著上调的阈值,≤1/2作为显著下调的变化阈值,分别筛选肿瘤样本对比正常样本、实验组肿瘤样本对比正常组肿瘤样本的差异表达蛋白及磷酸化修饰位点,并对差异蛋白进行亚细胞定位、结构域分析、GO功能注释和KEGG通路富集分析。通过蛋白互作网络筛选关键蛋白,并对患者进行蛋白亚组分组和预后分析。结果实验组患者EGFR基因突变频率更高,而... 

【文章来源】:华南理工大学广东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:84 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

基于质谱的肺腺癌淋巴结转移相关蛋白质组学及磷酸化修饰组学研究


病例筛选流程图

曲线,生存分析,实验组,患者


第二章肺腺癌淋巴结转移实验组与对照组病例筛选流程及临床数据分析11表2-5临床变量与OS的单因素与多因素cox分析(续)2.3.4.2实验组和对照组生存分析实验组和对照组患者的术后无病生存时间(DFS)见图2-2,总生存时间(OS)见图2-3,实验组的DFS更差(HR=1.934,95%CI:0.992-3.772,P=0.046),但生存曲线出现明显交叉。实验组和对照组的OS无差异(P=0.464)。图2-2实验组和对照组患者DFS生存分析图

生存分析,实验组,患者


华南理工大学硕士学位论文12图2-3实验组和对照组患者OS生存分析图2.4讨论淋巴结是肺腺癌最常见的转移模式,也是最常见的术后复发模式,因此,探索肺腺癌淋巴结转移的影响因素和蛋白,有助于判断临床预后,进而为手术方式、术后辅助治疗和随访提供参考意见。为更好地寻找早期肺腺癌淋巴结转移的影响因素,本研究通过设定严格的入组条件,筛选出27例对照组患者和25例实验组患者,并在本章中对临床信息进行对比。本研究发现,大肿瘤组患者的吸烟指数更高。吸烟可提升多种癌症的发病率,2019年science一篇研究通过大样本全外显子测序,发现吸烟与多种不同突变特征的突变负荷增加相关,吸烟指数的提升与DNA突变数目成正比,提示吸烟可通过影响基因的稳定性而影响肿瘤的发生[19]。本研究对两组患者进行生存分析,实验组的病理分期高于对照组,结果显示实验组DFS劣于对照组。两组总生存时间没有生存差异,可能由三个原因造成:①由于本研究入组患者淋巴结转移异质性高,为临床上较少见类型,样本量有限制。②实验组虽然分期高,但更多患者接受了辅助治疗。③实验组拥有更多EGFR突变的患者。EGFR突变是手术完全切除后的NSCLC预后良好因素[20]。本研究团队既往研究adjuvant研究入组了IIA-IIIA期(N1-N2)EGFR19/21位点突变的非小细胞肺癌患者,手术R0切除后辅助治疗方案1:1随机分配进行EGFR抑制剂吉非替尼或长春瑞滨+顺铂化疗,结果显示靶向治疗组的DFS有明显获益,但今年最新的随访结果提示DFS的获益并没有转化为OS的获益,原因可能是化疗组进展后允许接受后续靶向治疗[21]。总体而言,在其

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3247282

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