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LncRNA PCAT1遗传变异SNPs与乳腺癌遗传易感性关联分析及初步功能验证

发布时间:2021-06-27 16:00
  目的乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,同时它也是女性癌症中死亡的主要的原因,且其发病的机制相对复杂,研究揭示乳腺癌的发病可能与个人生活的习惯、生活的环境、生殖方面的因素和遗传方面的因素等多种因素及其相互作用有关。随着对长链非编码RNA(long non-coding RNA,IncRNA)的研究的不断深入,lncRNA相关的生物学方面的功能也逐渐浮现,且重心已出现向单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)方面转移的倾向。有研究表明,前列腺癌相关转录本1(PCAT1)是多种癌症的致癌因子且与癌症的进展密切相关,如前列腺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌等,但PCAT1与乳腺癌易感性之间的研究尚未被发现。本研究的目的是探究PCAT1的8个SNPs与乳腺癌易感性之间的关联,并对乳腺癌相关的SNP进行初步的功能探究。方法1.生物信息学方法筛选PCAT1的SNPs并预测其潜在功能:综合使用NCBI、Ensembl、1000 Genomes和Haploview 4.2根据最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)大于0.05筛选位于PC... 

【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校

【文章页数】:106 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

LncRNA PCAT1遗传变异SNPs与乳腺癌遗传易感性关联分析及初步功能验证


图3.1所示,基因型T所对应??的峰图位置为173.34,基因型C所对应的峰图位置为175.16;图3.1?(A)为基??因型TT,?3.1?(B)为基因型TC,?3.1?(C)为基因型CC

基因型,位置,基因,位点


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基因型,位置,位点,电泳


????(3)尸CL477位点rsl7762938的电泳峰型图如图3.3所示,基因型T所对应??的峰图位置为160.00,基因型C所对应的峰图位置为162.18;图3.3?(A)为基??因型TT,?3.3?(B)为基因型TC,3.3?(C)为基因型CC。??^?1S7.0?I58XJ?159X!?160.G?161.0?1M.0?163.0??16000??*4000?/?\??12000?I?\??10000??跡?1??6000?/?\??^?,'、/?\??〇.?'■?^^\^?'??????巳?一—???'?1W.0?-? ̄???-mo???????1^;??—??uooo??IOOOD??8000??A??咖?I?\?A??::?J?L'?/?\??J???、一,?一?V/??farfy? ̄?...?wa?'? ̄?u:j??2tom-??-?A??-?/?\?|?? ̄?■?/?\?i??.?/?\?:??v??〇l?—?????????????x??图3.3尸G427位点rsl7762938基因分型的电泳峰型图??30??

【参考文献】:
期刊论文
[1]长链非编码RNA PCAT-1在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义[J]. 杨宗澄,黄海燕,徐欣.  上海口腔医学. 2019(01)
[2]单倍型分析技术研究进展[J]. 李双双,张迎新,范成明,陈宇红,邓传良,胡赞民.  生物工程学报. 2018(06)
[3]人类长链非编码RNA相关SNP鉴定与功能预测的研究进展[J]. 龚静,柳纯洁,缪小平,郭安源.  生物技术通报. 2015(11)
[4]Long non-coding RNAs in stem cells and cancer[J]. Gabriel Eades,Yong-Shu Zhang,Qing-Lin Li,Ji-Xiang Xia,Yuan Yao,Qun Zhou.  World Journal of Clinical Oncology. 2014(02)

硕士论文
[1]长链非编码RNA LINC00520 SNPs与乳腺癌遗传易感性关联分析及功能验证[D]. 郭巧云.郑州大学 2019
[2]LncRNA MALAT1和BCAR4 SNPs与乳腺癌遗传易感性关联研究及功能分析[D]. 彭瑞.郑州大学 2018
[3]miR-149-5p、CCL18在弥漫大B细胞淋巴瘤的表达及临床意义[D]. 周倩萍.广西医科大学 2018



本文编号:3253157

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