miRNA 452-5p及miRNA215-5p在结直肠癌组织中表达及意义
发布时间：2021-07-03 01:51
[目的]（1）利用基因高通量Miseq测序技术对比分析结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织中miRNA的差异表达。（2）应用实时荧光定量PCR（Quantitative Real time PCR RT-qPCR）技术验证 miRNA452-5p 和 miRNA215-5p 在结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织中表达,并通过分析其与临床病理资料之间的关系,为进一步研究miRNA 452-5p和miRNA215-5p在结直肠癌中生物学功能及其调控下游靶基因机制奠定基础。（3）绘制 ROC 曲线（Receiver operating characteristic,ROC）和曲线下面积（Area under the ROC curve,AUC）评估 miRNA452-5p、miRNA215-5p及2-miRNA panel的诊断价值,期望探索出潜在的结直肠癌诊断价值的分子标志物和治疗靶点。[方法]（1）收集3例结直肠癌组织及配对癌旁正常肠粘膜组织送至上海康成生物有限公司进行基因高通量Miseq测序筛选差异表达miRNA。（2）收集2017年7月至2017年10月在昆明医科大学第一附属医院消化内镜中...
【文章来源】：昆明医科大学云南省
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
高通量Miseq测序实验流程
１．２结直肠癌组织差异表达的ｍｉＲＮＡ??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织差异表达ｍｉＲＮＡ中４０种ｍｉＲＮＡ表达上调，??４８种ｍｉＲＮＡ表达下调（表１，图３）。??１．３?ｍｉＲＮＡ在染色体上的分布差异结果见图４??１．４?ｍｉＲＮＡ对其耙基因的调节??采用Ｍｉｒｄｂｖ５和Ｔａｒｇｅｔｓｃａｎ７．１两种耙基因预测软件预测结直肠癌组织与癌??旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的靶基因。测出上调ｍｉＲＮＡＳ靶基因共４１２，??下调ｍｉＲＮＡＳ靶基因３７２，其中上调ｍｉＲ－３７５耙基因２个，ｍｉＲ２１５－５ｐ靶基因９??个，ｍｉＲｌ－３ｐ靶基因１１５个，ｍｉＲ９９ａ－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ２１８－５ｐ靶基因１４９??个，ｍｉＲ１００－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ１９５－５ｐ靶基因１１３个；下调ｍｉＲ７－５ｐ耙基因??２０?个，ｍｉＲ３３５－３ｐ?靶基因?２８?个，ｍｉＲ１３５ｂ－５ｐ?靶基因?１０４?个，ｍｉＲ－１２４６?靶基因??２０?个，ｍｉＲ２２３－３ｐ?耙基因?３８?个，ｍｉＲ－７９７４?耙基因?８６?个，ｍｉＲ４５２－５ｐ?耙基因?２６??个（表２－３）。??１．５差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ生物过程和ＫＥＧＧ通路??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ分析结果表明，??在这些变化的ｍｉＲＮＡ中
结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织差异表达ｍｉＲＮＡ中４０种ｍｉＲＮＡ表达上调，??４８种ｍｉＲＮＡ表达下调（表１，图３）。??１．３?ｍｉＲＮＡ在染色体上的分布差异结果见图４??１．４?ｍｉＲＮＡ对其耙基因的调节??采用Ｍｉｒｄｂｖ５和Ｔａｒｇｅｔｓｃａｎ７．１两种耙基因预测软件预测结直肠癌组织与癌??旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的靶基因。测出上调ｍｉＲＮＡＳ靶基因共４１２，??下调ｍｉＲＮＡＳ靶基因３７２，其中上调ｍｉＲ－３７５耙基因２个，ｍｉＲ２１５－５ｐ靶基因９??个，ｍｉＲｌ－３ｐ靶基因１１５个，ｍｉＲ９９ａ－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ２１８－５ｐ靶基因１４９??个，ｍｉＲ１００－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ１９５－５ｐ靶基因１１３个；下调ｍｉＲ７－５ｐ耙基因??２０?个，ｍｉＲ３３５－３ｐ?靶基因?２８?个，ｍｉＲ１３５ｂ－５ｐ?靶基因?１０４?个，ｍｉＲ－１２４６?靶基因??２０?个，ｍｉＲ２２３－３ｐ?耙基因?３８?个，ｍｉＲ－７９７４?耙基因?８６?个，ｍｉＲ４５２－５ｐ?耙基因?２６??个（表２－３）。??１．５差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ生物过程和ＫＥＧＧ通路??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ分析结果表明，??在这些变化的ｍｉＲＮＡ中
【参考文献】：
期刊论文
[1]microRNA-200c靶向抑制转录因子激活蛋白2α表达增强结肠癌细胞增殖能力的体外研究[J]. 樊丽君,李美宁,王爽,孙建文,牛万通,程牛亮. 肿瘤研究与临床. 2015 (04)
[2]Early stage colon cancer[J]. Hugh James Freeman. World Journal of Gastroenterology. 2013(46)
[3]结直肠癌病因与发病机制最新研究进展[J]. 张涛涛,阎岩. 科协论坛(下半月). 2009(07)
博士论文
[1]血清microRNA作为生物标记物在结直肠腺癌早期诊断中的应用[D]. 郑桂喜.山东大学 2014
[2]microRNA在结肠癌上皮间质转化中的作用与机制研究[D]. 张志勇.第四军医大学 2012
本文编号：3261619
【文章来源】：昆明医科大学云南省
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
高通量Miseq测序实验流程
１．２结直肠癌组织差异表达的ｍｉＲＮＡ??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织差异表达ｍｉＲＮＡ中４０种ｍｉＲＮＡ表达上调，??４８种ｍｉＲＮＡ表达下调（表１，图３）。??１．３?ｍｉＲＮＡ在染色体上的分布差异结果见图４??１．４?ｍｉＲＮＡ对其耙基因的调节??采用Ｍｉｒｄｂｖ５和Ｔａｒｇｅｔｓｃａｎ７．１两种耙基因预测软件预测结直肠癌组织与癌??旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的靶基因。测出上调ｍｉＲＮＡＳ靶基因共４１２，??下调ｍｉＲＮＡＳ靶基因３７２，其中上调ｍｉＲ－３７５耙基因２个，ｍｉＲ２１５－５ｐ靶基因９??个，ｍｉＲｌ－３ｐ靶基因１１５个，ｍｉＲ９９ａ－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ２１８－５ｐ靶基因１４９??个，ｍｉＲ１００－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ１９５－５ｐ靶基因１１３个；下调ｍｉＲ７－５ｐ耙基因??２０?个，ｍｉＲ３３５－３ｐ?靶基因?２８?个，ｍｉＲ１３５ｂ－５ｐ?靶基因?１０４?个，ｍｉＲ－１２４６?靶基因??２０?个，ｍｉＲ２２３－３ｐ?耙基因?３８?个，ｍｉＲ－７９７４?耙基因?８６?个，ｍｉＲ４５２－５ｐ?耙基因?２６??个（表２－３）。??１．５差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ生物过程和ＫＥＧＧ通路??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ分析结果表明，??在这些变化的ｍｉＲＮＡ中
结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织差异表达ｍｉＲＮＡ中４０种ｍｉＲＮＡ表达上调，??４８种ｍｉＲＮＡ表达下调（表１，图３）。??１．３?ｍｉＲＮＡ在染色体上的分布差异结果见图４??１．４?ｍｉＲＮＡ对其耙基因的调节??采用Ｍｉｒｄｂｖ５和Ｔａｒｇｅｔｓｃａｎ７．１两种耙基因预测软件预测结直肠癌组织与癌??旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的靶基因。测出上调ｍｉＲＮＡＳ靶基因共４１２，??下调ｍｉＲＮＡＳ靶基因３７２，其中上调ｍｉＲ－３７５耙基因２个，ｍｉＲ２１５－５ｐ靶基因９??个，ｍｉＲｌ－３ｐ靶基因１１５个，ｍｉＲ９９ａ－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ２１８－５ｐ靶基因１４９??个，ｍｉＲ１００－５ｐ靶基因１２个，ｍｉＲ１９５－５ｐ靶基因１１３个；下调ｍｉＲ７－５ｐ耙基因??２０?个，ｍｉＲ３３５－３ｐ?靶基因?２８?个，ｍｉＲ１３５ｂ－５ｐ?靶基因?１０４?个，ｍｉＲ－１２４６?靶基因??２０?个，ｍｉＲ２２３－３ｐ?耙基因?３８?个，ｍｉＲ－７９７４?耙基因?８６?个，ｍｉＲ４５２－５ｐ?耙基因?２６??个（表２－３）。??１．５差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ生物过程和ＫＥＧＧ通路??结直肠癌组织与癌旁正常肠粘膜组织间差异表达ｍｉＲＮＡ的ＧＯ分析结果表明，??在这些变化的ｍｉＲＮＡ中
【参考文献】：
期刊论文
[1]microRNA-200c靶向抑制转录因子激活蛋白2α表达增强结肠癌细胞增殖能力的体外研究[J]. 樊丽君,李美宁,王爽,孙建文,牛万通,程牛亮. 肿瘤研究与临床. 2015 (04)
[2]Early stage colon cancer[J]. Hugh James Freeman. World Journal of Gastroenterology. 2013(46)
[3]结直肠癌病因与发病机制最新研究进展[J]. 张涛涛,阎岩. 科协论坛(下半月). 2009(07)
博士论文
[1]血清microRNA作为生物标记物在结直肠腺癌早期诊断中的应用[D]. 郑桂喜.山东大学 2014
[2]microRNA在结肠癌上皮间质转化中的作用与机制研究[D]. 张志勇.第四军医大学 2012
本文编号：3261619
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