利用CRISPR技术研究Rgnef在胃癌发生发展中的功能
发布时间：2021-07-10 18:28
背景与目的:胃癌是十分常见的消化系统恶性肿瘤之一。在我国胃癌发病率和死亡率都较高,而且由于其缺乏早期的特异性临床表现,不易察觉,导致通常诊断出的胃癌都已进入中晚期,发生了浸润和转移。目前,治疗胃癌主要是通过手术、化疗、放疗的方法,但是整体效果并不理想,转移率和术后复发率都很高,5年生存率低至20%～30%。胃癌的发病机理是众多基因长期突变积累,导致一系列基因表达及信号通路调节发生异常。所以,研究有关的基因在胃癌发生、发展过程中的作用及其调节仍然是胃癌发病机制基础理论研究的重要环节,这类研究对胃癌未来的诊疗及治疗方面新技术的开发有重要意义。ARHGEF28（Rho guanine nucleotide exchange factor 28）,又称为:Rgnef、p190RHOGEF、RIP2,是一种蛋白编码基因,位于人类染色体5q13.2,315836bp,共含有44个外显子和45个内含子。由于基因的不同剪切方式,一共有十四种转录变异体,其中最长的一个转绿变异体mRNA共6351bp,ORF（开放阅读框）长5196bp,含有36个外显子。Rgnef基因是Rho鸟苷酸交换因子（RhoGEF...
【文章来源】：陕西师范大学陕西省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：96 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２?Ｒｇｎｅｆ结构域图［７９］??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｈｅ?Ｒｇｎｅｆ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｓ?ｗｉｔｈ?ｔｈｅ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｄｏｍａｉｎｓ１７９１??
图１－５ＣＲＩＳＰＲ结构图［１５５】??Ｆｉｇ．?１－５?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＣＲ１ＳＰＲ［１５５］???ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９系统的作用机芾丨Ｊ??ＣＲ丨ＳＰＲ／Ｃａｓ系统的作用过程共包括三个阶：第一步是得到新的ｓｐａｃｅｒ，候首先是寻找到ＰＡＭ结构，将噬菌体ＤＮＡ或者外源质粒中含有ＰＡＭ的为Ｐｒｏｔｏｓｐｃｅｒ，经过核酸切割形成新的Ｓｐａｃｅｒ，进入到ＣＲＩＳＰＲ序列的５’方步是ＣＲ１ＳＰＲ基因座在菌体内的大量进行复制及转录，再对产物进行切割ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ，两者会结合在一起，然后再与Ｃａｓ结合；第三ＰＲ／Ｃａｓ，在ｃｒＲＮＡ的作用下，找到靶位点，Ｃａｓ发挥剪刀的功能，使得断裂，破坏外来遗传物质１１５５，｜５６］。??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９中，成熟的ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ有部分区域是互补的，所以稳定的双链ＲＮＡ，与Ｃａｓ９的特定结构域结合，形成核糖蛋白复合物。ｃｒＲ用就是特异性的寻找靶基因，在结构上与之完全贴合，解开ＤＮＡ双ＮＡ则作为支架结构，呈游离状态，这时，它们携带的Ｃａｓ９蛋白开始发的作用，其中ＲｕｖＣ切割与ｃｒＲＮＡ序列一致的ＤＮＡ，ＨＮＨ切割对应的
ｓｃｔｌｕｃｎｃｃ?ＣＪ５??图１－５ＣＲＩＳＰＲ结构图［１５５】??Ｆｉｇ．?１－５?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＣＲ１ＳＰＲ［１５５］??１．３．２?ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９系统的作用机芾丨Ｊ??ＣＲ丨ＳＰＲ／Ｃａｓ系统的作用过程共包括三个阶：第一步是得到新的ｓｐａｃｅｒ，在这??个时候首先是寻找到ＰＡＭ结构，将噬菌体ＤＮＡ或者外源质粒中含有ＰＡＭ的序列??确定为Ｐｒｏｔｏｓｐｃｅｒ，经过核酸切割形成新的Ｓｐａｃｅｒ，进入到ＣＲＩＳＰＲ序列的５’方向；??第二步是ＣＲ１ＳＰＲ基因座在菌体内的大量进行复制及转录，再对产物进行切割后，??产生ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ，两者会结合在一起，然后再与Ｃａｓ结合；第三步是??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ，在ｃｒＲＮＡ的作用下，找到靶位点，Ｃａｓ发挥剪刀的功能，使得外来??基因断裂，破坏外来遗传物质１１５５，｜５６］。??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９中
【参考文献】：
期刊论文
[1]Development of genome engineering technologies in cattle: from random to specific[J]. Soo-Young Yum,Ki-Young Youn,Woo-Jae Choi,Goo Jang. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(02)
[2]CRISPR/Cas9在丝状真菌基因组编辑中的应用[J]. 李红花,刘钢. 遗传. 2017(05)
[3]Current and emerging therapies in unresectable and recurrent gastric cancer[J]. Erin Jou,Lakshmi Rajdev. World Journal of Gastroenterology. 2016(20)
[4]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[5]Rho小G蛋白相关激酶的结构与功能[J]. 闫慧娟,勿呢尔,莫日根,范丽菲. 中国细胞生物学学报. 2014(07)
本文编号：3276439
【文章来源】：陕西师范大学陕西省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：96 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２?Ｒｇｎｅｆ结构域图［７９］??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｈｅ?Ｒｇｎｅｆ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｓ?ｗｉｔｈ?ｔｈｅ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｄｏｍａｉｎｓ１７９１??
图１－５ＣＲＩＳＰＲ结构图［１５５】??Ｆｉｇ．?１－５?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＣＲ１ＳＰＲ［１５５］???ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９系统的作用机芾丨Ｊ??ＣＲ丨ＳＰＲ／Ｃａｓ系统的作用过程共包括三个阶：第一步是得到新的ｓｐａｃｅｒ，候首先是寻找到ＰＡＭ结构，将噬菌体ＤＮＡ或者外源质粒中含有ＰＡＭ的为Ｐｒｏｔｏｓｐｃｅｒ，经过核酸切割形成新的Ｓｐａｃｅｒ，进入到ＣＲＩＳＰＲ序列的５’方步是ＣＲ１ＳＰＲ基因座在菌体内的大量进行复制及转录，再对产物进行切割ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ，两者会结合在一起，然后再与Ｃａｓ结合；第三ＰＲ／Ｃａｓ，在ｃｒＲＮＡ的作用下，找到靶位点，Ｃａｓ发挥剪刀的功能，使得断裂，破坏外来遗传物质１１５５，｜５６］。??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９中，成熟的ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ有部分区域是互补的，所以稳定的双链ＲＮＡ，与Ｃａｓ９的特定结构域结合，形成核糖蛋白复合物。ｃｒＲ用就是特异性的寻找靶基因，在结构上与之完全贴合，解开ＤＮＡ双ＮＡ则作为支架结构，呈游离状态，这时，它们携带的Ｃａｓ９蛋白开始发的作用，其中ＲｕｖＣ切割与ｃｒＲＮＡ序列一致的ＤＮＡ，ＨＮＨ切割对应的
ｓｃｔｌｕｃｎｃｃ?ＣＪ５??图１－５ＣＲＩＳＰＲ结构图［１５５】??Ｆｉｇ．?１－５?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＣＲ１ＳＰＲ［１５５］??１．３．２?ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９系统的作用机芾丨Ｊ??ＣＲ丨ＳＰＲ／Ｃａｓ系统的作用过程共包括三个阶：第一步是得到新的ｓｐａｃｅｒ，在这??个时候首先是寻找到ＰＡＭ结构，将噬菌体ＤＮＡ或者外源质粒中含有ＰＡＭ的序列??确定为Ｐｒｏｔｏｓｐｃｅｒ，经过核酸切割形成新的Ｓｐａｃｅｒ，进入到ＣＲＩＳＰＲ序列的５’方向；??第二步是ＣＲ１ＳＰＲ基因座在菌体内的大量进行复制及转录，再对产物进行切割后，??产生ｔｒａｃｒＲＮＡ和ｃｒＲＮＡ，两者会结合在一起，然后再与Ｃａｓ结合；第三步是??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ，在ｃｒＲＮＡ的作用下，找到靶位点，Ｃａｓ发挥剪刀的功能，使得外来??基因断裂，破坏外来遗传物质１１５５，｜５６］。??ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９中
【参考文献】：
期刊论文
[1]Development of genome engineering technologies in cattle: from random to specific[J]. Soo-Young Yum,Ki-Young Youn,Woo-Jae Choi,Goo Jang. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(02)
[2]CRISPR/Cas9在丝状真菌基因组编辑中的应用[J]. 李红花,刘钢. 遗传. 2017(05)
[3]Current and emerging therapies in unresectable and recurrent gastric cancer[J]. Erin Jou,Lakshmi Rajdev. World Journal of Gastroenterology. 2016(20)
[4]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[5]Rho小G蛋白相关激酶的结构与功能[J]. 闫慧娟,勿呢尔,莫日根,范丽菲. 中国细胞生物学学报. 2014(07)
本文编号：3276439
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3276439.html
