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5-羟甲基化胞嘧啶全基因组测定在胃癌的探索

发布时间:2021-07-13 16:50
  1、背景和目的:胃癌是全球范围内的第四大恶性肿瘤,第二大致死性疾病,东亚地区的病例占总体的一半以上。从胃癌的组织学分类来说主要有腺癌、腺鳞癌、鳞癌、类癌等,其中绝大部分是胃腺癌。尽管现在可以通过体格检查、影像学及内镜下组织活检等检查发现胃癌,但是中国胃癌患者发现时大都临床分期较晚,进展期胃癌比例约占70%,严重影响预后。因此探究胃恶性肿瘤的相关的致病机制的研究具有重要的意义。表观遗传学是DNA碱基序列没有改变的情况下,其表型出现可传递到下一代变化的一门学科。DNA甲基化是其经典调控之一,在各种疾病的调控中起到了重要的作用。近年来,5hmC作为胞嘧啶修饰过程的中间产物,丰富了我们对DNA甲基化的表观遗传调控过程的认识,也为我们寻找胃癌相关基因提供新的线索。但目前对于全基因组5hmC在胃癌中的研究甚少。在本研究中,我们将通过hMe-Seal化学标记结合高通量测序,研究5hmC在胃癌中的表达,探讨特异性5hmC分布及作用位点与胃癌的关系。2、方法1、收集吉林大学第二医院胃肠外科2017年1月至2018年1月病理确诊为胃癌患者的手术切除标本6例,每组标本包括肿瘤组织、癌旁组织和远端正常组织。2... 

【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:46 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

5-羟甲基化胞嘧啶全基因组测定在胃癌的探索


图2.1?:胃癌和癌旁组织与正常组织相比5hmC表达水平??

区域图,胃癌,位点,富集


?第四章结果???今、*’?V?11?;??,s?#?^?\??:丨'倉之、??二?/?、、丨??丨、?厂??、?**?<??*>??'????Gain?of?5hmC?'????_■■,》**、*?,????Lossof5hmC?泛?<〇??圆3.1:5hmC在胃癌患者中的染色体循环圏???表3,?1.胃:癌中DhMRs.表达水〒???DhMRs表达水平?5hmC上升位点?5hmC下降位点??T/N?1344?17318??P/N?4795?1876??重合位点?U2S?6??P?v.?.?N??Tv,.N?_??|???Garn^StmC??8,???Gairvof彻C?■?7???toa-〇f-5NnC??£???Low-ol-5hmC??hhiiiL-ii?il??IL?CM?J?■■?(V??!?/?/?^?////?^?^?^///??图3.2?:DhMRs在胃癌中基因区域富集情况??18??

5-羟甲基化胞嘧啶全基因组测定在胃癌的探索


图4.1癌旁中获得或失去5hmC的?

【参考文献】:
期刊论文
[1]浅析胃癌的发病率与患者年龄的关系[J]. 田园园.  当代医药论丛. 2015(07)
[2]表观遗传新标志物5hmC的研究进展[J]. 葛苗苗,蔡春.  生物化学与生物物理进展. 2014(09)
[3]Review of salt consumption and stomach cancer risk:Epidemiological and biological evidence[J]. Paul D Terry.  World Journal of Gastroenterology. 2009(18)
[4]Hypermethylation and aberrant expression of Wnt antagonist secreted frizzled-related protein 1 in gastric cancer[J]. Cheng-Hai Zhao, Ning Zhang, Department of Pathophysiology, School of Basic Medicine, China Medical University, Shenyang 110001, Liaoning Province, China Xian-Min Bu, Department of General Surgery, the Second Affiliated Hospital, China Medical University, Shenyang 110004, Liaoning Province, China.  World Journal of Gastroenterology. 2007(15)



本文编号:3282436

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