基于增强CT图像和临床资料的胆囊息肉良恶性鉴别的影像组学研究
发布时间:2021-07-19 10:48
目的:探讨基于增强CT图像和临床资料的影像组学鉴别诊断良恶性胆囊息肉样病变(PLG)的价值。方法:145例PLG接受腹部增强CT检查、最大径≥1 cm且经病理证实,良性82例,恶性63例,将其随机按照7:3的比例分为训练集和测试集,回顾性收集这些患者的一般资料并测量相关传统CT图像特征。组学特征的获取使用ITK-SNAP软件手动分割门静脉期CT图像的3D ROI,导入AK分析软件提取影像组学特征,以Lasso回归法进行特征降维,借助R语言软件建立Logistic回归模型并验证,采用ROC曲线评价模型的诊断效能。结果:在测试集中,临床模型、组学模型和联合模型的AUC值分别为0.861、0.924和0.931,但是联合模型和两个单一模型的AUC值之间的差异没有统计学意义。结论:基于增强CT图像和临床资料的影像组学可有效鉴别≥1cm的胆囊息肉的良恶性。
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:38 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例筛选流程图
中国医科大学硕士学位论文4图2影像组学分析流程图:获得原始图像后,进行重采样,后进行图像分割,之后使用R语言进行特征提取及筛选,最后建立模型并验证2.4图像分割将预处理后的门脉期CT图像加载至ITK-SNAP软件(http://www.itksnap.org,版本3.6.0)中,由2名有经验的影像诊断医师在不知晓病理结果的前提下使用ITK-SNAP软件在同一窗宽、窗位(150HU、80HU)下手动勾画门脉期CT图像的3D感兴趣区(Volumeofinterest,VOI),意见不一致时协商解决。勾画时避开临近明显强化的血管,将所画VOI文件以“.nii”格式导出保存至本地。2.5影像组学特征提取及选择将重采样后的门静脉期CT原始图像及勾画好的VOI文件导入AK平台进行组学特征提取,VOI自动生成基于病灶形态学、CT值大小的相关特征及基于一阶直方图、高阶纹理等相关的影像组学特征。采用R语言3.5.2版(https://www.r-project.org)在训练集中选择影像组学特征。首先对所有组学特征的异常值及缺失值进行预处理,使用中位数替代异常值及缺失值。然后基于R语言3.5.2版中的“glmnet”包(广义线性模型),使用Lasso法进行降维,重复100次,对特征进行不断迭代选择,直至筛选得到系数不为0的特征。2.6临床特征的提取及选择追溯每一位入组患者的临床资料,记录年龄、性别、病理结果、CA-125、CA-199、
中国医科大学硕士学位论文9图3部分PLG患者的门静脉期CT图像A1-A3:病理证实为分化程度不同的腺癌。A1:男性,59岁,PLG位于胆囊底,直径为1.8cm;A2:女性,66岁,PLG位于胆囊体,直径为1.7cm;A3:男性,62岁,PLG位于胆囊底,直径为3.0cm。B1-B3,病理诊断为腺瘤。B1:男性,56岁,PLG位于胆囊底,直径为1.7cm;B2:女性,65岁,病变位于胆囊颈,直径为2.8cm;B3:男性,55岁,病变位于胆囊底,直径为2.1cm。3.2临床特征模型的构建与验证本研究共纳入临床特征15个,分别是性别、年龄、症状、基底宽窄、平扫期CT值、动脉期CT值、门脉期CT值、静脉期CT值、最大直径、是否单发、息肉所在位置、有无结石。但由于CA-125、CA-199、CEA和平扫期CT值中的缺失值太多,故本研究未将其纳入分析。剩余11个特征与PLG的良恶性进行相关性分析,结果如图4所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]胆囊息肉癌变风险分析和临床处理的研究进展[J]. 郑亚民,姚贵宾,王悦华,李非. 医学研究杂志. 2018(08)
[2]胆囊息肉临床诊治的新进展[J]. 张培松,曹葆强,龚仁华. 中医临床研究. 2017(24)
[3]对胆囊息肉样病变外科处理的思考[J]. 吕文才,贾莉,温爽,郎桂玲,王希春,孙尚韶,惠扬,于国峰,魏磊,付维利. 中华肝胆外科杂志. 2015 (07)
[4]体检人员胆囊息肉检出情况及其相关因素分析[J]. 王巍,于晓松. 临床军医杂志. 2015(06)
[5]胆囊息肉样病变的癌变危险因素分析[J]. 梁荔,冯宪光,周敬强,刘双. 山东医药. 2014(21)
[6]Analysis of risk factors for polypoid lesions of gallbladder among health examinees[J]. Hua-Li Yang, Lei Kong, Li-Li Hou, Hui-Fang Shen, Yu Wang, Xin-Gang Gu, Jian-Min Qin, Pei-Hao Yin, Qi Li, Department of Ultrasonography, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of General Surgery, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of Oncology, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(23)
[7]胆囊息肉样病变的诊治进展[J]. 苏铭,王学汉. 中华肝胆外科杂志. 2006(12)
本文编号:3290560
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:38 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例筛选流程图
中国医科大学硕士学位论文4图2影像组学分析流程图:获得原始图像后,进行重采样,后进行图像分割,之后使用R语言进行特征提取及筛选,最后建立模型并验证2.4图像分割将预处理后的门脉期CT图像加载至ITK-SNAP软件(http://www.itksnap.org,版本3.6.0)中,由2名有经验的影像诊断医师在不知晓病理结果的前提下使用ITK-SNAP软件在同一窗宽、窗位(150HU、80HU)下手动勾画门脉期CT图像的3D感兴趣区(Volumeofinterest,VOI),意见不一致时协商解决。勾画时避开临近明显强化的血管,将所画VOI文件以“.nii”格式导出保存至本地。2.5影像组学特征提取及选择将重采样后的门静脉期CT原始图像及勾画好的VOI文件导入AK平台进行组学特征提取,VOI自动生成基于病灶形态学、CT值大小的相关特征及基于一阶直方图、高阶纹理等相关的影像组学特征。采用R语言3.5.2版(https://www.r-project.org)在训练集中选择影像组学特征。首先对所有组学特征的异常值及缺失值进行预处理,使用中位数替代异常值及缺失值。然后基于R语言3.5.2版中的“glmnet”包(广义线性模型),使用Lasso法进行降维,重复100次,对特征进行不断迭代选择,直至筛选得到系数不为0的特征。2.6临床特征的提取及选择追溯每一位入组患者的临床资料,记录年龄、性别、病理结果、CA-125、CA-199、
中国医科大学硕士学位论文9图3部分PLG患者的门静脉期CT图像A1-A3:病理证实为分化程度不同的腺癌。A1:男性,59岁,PLG位于胆囊底,直径为1.8cm;A2:女性,66岁,PLG位于胆囊体,直径为1.7cm;A3:男性,62岁,PLG位于胆囊底,直径为3.0cm。B1-B3,病理诊断为腺瘤。B1:男性,56岁,PLG位于胆囊底,直径为1.7cm;B2:女性,65岁,病变位于胆囊颈,直径为2.8cm;B3:男性,55岁,病变位于胆囊底,直径为2.1cm。3.2临床特征模型的构建与验证本研究共纳入临床特征15个,分别是性别、年龄、症状、基底宽窄、平扫期CT值、动脉期CT值、门脉期CT值、静脉期CT值、最大直径、是否单发、息肉所在位置、有无结石。但由于CA-125、CA-199、CEA和平扫期CT值中的缺失值太多,故本研究未将其纳入分析。剩余11个特征与PLG的良恶性进行相关性分析,结果如图4所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]胆囊息肉癌变风险分析和临床处理的研究进展[J]. 郑亚民,姚贵宾,王悦华,李非. 医学研究杂志. 2018(08)
[2]胆囊息肉临床诊治的新进展[J]. 张培松,曹葆强,龚仁华. 中医临床研究. 2017(24)
[3]对胆囊息肉样病变外科处理的思考[J]. 吕文才,贾莉,温爽,郎桂玲,王希春,孙尚韶,惠扬,于国峰,魏磊,付维利. 中华肝胆外科杂志. 2015 (07)
[4]体检人员胆囊息肉检出情况及其相关因素分析[J]. 王巍,于晓松. 临床军医杂志. 2015(06)
[5]胆囊息肉样病变的癌变危险因素分析[J]. 梁荔,冯宪光,周敬强,刘双. 山东医药. 2014(21)
[6]Analysis of risk factors for polypoid lesions of gallbladder among health examinees[J]. Hua-Li Yang, Lei Kong, Li-Li Hou, Hui-Fang Shen, Yu Wang, Xin-Gang Gu, Jian-Min Qin, Pei-Hao Yin, Qi Li, Department of Ultrasonography, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of General Surgery, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of Oncology, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(23)
[7]胆囊息肉样病变的诊治进展[J]. 苏铭,王学汉. 中华肝胆外科杂志. 2006(12)
本文编号:3290560
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