长链非编码RNA LINC02163在肝细胞肝癌中的作用和机制研究
发布时间：2021-07-31 23:01
肝细胞肝癌（hepatocellular carcinoma,HCC,简称肝癌）是全世界范围内常见的恶性肿瘤之一。尽管HCC在手术治疗、放化疗以及分子靶向治疗等方面取得了很大进展,但由于其高侵袭、高转移及高复发等特性,HCC患者预后差的现状仍未发生根本改变。截止目前肝癌发生发展的确切分子机制尚不完全清楚。因此,探讨HCC侵袭转移的分子机制,并寻找有效的治疗靶点以及早期诊断和预后预测的生物标志物是目前HCC研究的重要方向。近年来的研究发现,长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）在包括肝癌在内的多种肿瘤中异常表达,在肝癌的发生与发展过程中发挥着促癌基因或抑癌基因的重要作用。在本研究中,我们重点对一个新的、在肝细胞肝癌中表达上调的lncRNA LINC02163进行研究,分析其在肝癌组织及肝癌细胞中的表达和临床意义,研究其生物学功能及可能的作用机制。具体内容如下:第一部分LINC02163的分子特征以及在肝细胞肝癌组织中的表达和临床意义目的:分析LINC02163的分子特征,研究LINC02163在肝细胞肝癌组织中的表达及其与肝癌患者临床病理参数和预后的关联...
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
LINC02163的分子特征和编码能力
hthatoflncRNA(MALAT1)andmRNA(GAPDH,β-actin).(D)TheORFpredictiveresultsofLINC02163gene.1.2.2目的基因LINC02163和内参基因β-actin引物的验证结果目的基因LINC02163及内参基因β-actin引物合成完成后，我们用qRT-PCR验证了这两对引物效果和特异性。观察LINC02163及β-actin的扩增曲线与扩增产物的熔解曲线结果（图1-2），可以看出LINC02163及β-actin的扩增曲线有完整的指数增长期和非指数平台期，对应的熔解曲线在同一熔解温度上有一特异峰，提示设计的引物效果和特异性较好，达到实验要求，可进行后续实验。图1-2LINC02163与β-actin的扩增曲线和熔解曲线。Figure1-2:AmplificationandmeltingcurvesofLINC02163andβ-actin.1.2.3LINC02163在肝癌组织中的表达情况我们利用qRT-PCR检测和分析60例肝癌以及其配对癌旁肝组织标本中LINC02163的差异表达情况，用β-actin作为内参基因对目的基因LINC02163的表达量进行校正。结果表明：与配对癌旁组织相比，LINC02163在肝癌组织中的表达明显升高，差异有统计学意义（P<0.001，图1-3A）。为了进一步证实我们结果，我们利用生物信息学软件starBase（http://starbase.sysu.edu.cn/）查询TCGA肝细胞肝癌数据库中的LINC02163基因表达情况，starBase上分析的结果与本实验组织样本的结果一致（图1-3B）。
陆军军医大学硕士学位论文20图1-3：LINC02163在肝癌组织与肝组织中的基因表达量。（A）qRT-PCR检测分析肝癌组织（n=60）与其配对癌旁组织（n=60）中LINC02163的表达量。用ΔΔCt值显示LINC02163的表达水平（ΔCt=CtLINC02163－Ctβ-actin，ΔΔCt=ΔCt实验组－ΔCt对照组）。ΔΔCt值越高，表达量越高。***，Wilcoxon符号秩检验，P<0.001。（B）TCGA肝细胞肝癌数据库中的肝癌组织（n=374）与正常肝组织（n=50）LINC02163的表达量。Figure1-3:TheexpressionofLINC02163inHCCandlivertissues.(A)qRT-PCRwasusedtodetectandanalyzetherelativeexpressionlevelofLINC02163inHCCtissues(n=60)andpairedadjacenttissues(n=60).ΔΔCtvalueswereusedtoshowrelativeexpressionlevelofLINC02163(ΔCt=CtLINC02163－Ctβ-actin,ΔΔCt=ΔCtexperiment－ΔCtcontrol).HigherΔΔCtvaluesindicatehigherexpression.***,Wilcoxonsymbolranktest,P<0.001.(B)LINC02163expressioninHCCtissues(n=374)andnormallivertissues(n=50)inTCGAHCCdatabase.1.2.4LINC02163在肝癌组织中的表达与肝癌患者临床病理参数之间的关系我们进一步分析了60例HCC患者肝癌组织中LINC02163的表达与各临床病理参数之间的关系，以便验证LINC02163在肝癌发生发展过程中的作用。将纳入研究的60例病例按照HCC组织的LINC02163相对表达量依次排序，并按中位数方法分为高表达组及低表达组各30例。用2检验分别验证两组间临床一般情况及病理参数有无统计学差异。结果显示，LINC02163的表达水平与性别、年龄、肝硬化、AFP表达水平、肿瘤直径、数目、病理分级等无明显相关性，而与肿瘤TNM分期和微血管侵犯（MVI）有显著的关联（P<0.01，表1-3）。相比临床早期（Ⅰ～Ⅱ期,
【参考文献】：
期刊论文
[1]Downregulation of LncRNAH19 and MiR-675 Promotes Migration and Invasion of Human Hepatocellular Carcinoma Cells through AKT/GSK-3β/Cdc25A Signaling Pathway[J]. 吕军,马宁,陈锡林,黄晓卉,汪谦. Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2014(03)
[2]Risk factors for early recurrence of small hepatocellular carcinoma after curative resection[J]. Yan-Ming Zhou,Jia-Mei Yang,Bin Li,Zheng-Feng Yin,Feng Xu,Bin Wang,Wen Xu and Tong Kan Department of Hepato-Biliary-Pancreato-Vascular Surgery,First Xiamen Hospital,Fujian Medical University,Xiamen 361003,China;Department of Special Treatment,Department of Molecular Oncology,Department of Pathology,Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital,Second Military Medical University,Shanghai 200438,China. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2010(01)
本文编号：3314340
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
LINC02163的分子特征和编码能力
hthatoflncRNA(MALAT1)andmRNA(GAPDH,β-actin).(D)TheORFpredictiveresultsofLINC02163gene.1.2.2目的基因LINC02163和内参基因β-actin引物的验证结果目的基因LINC02163及内参基因β-actin引物合成完成后，我们用qRT-PCR验证了这两对引物效果和特异性。观察LINC02163及β-actin的扩增曲线与扩增产物的熔解曲线结果（图1-2），可以看出LINC02163及β-actin的扩增曲线有完整的指数增长期和非指数平台期，对应的熔解曲线在同一熔解温度上有一特异峰，提示设计的引物效果和特异性较好，达到实验要求，可进行后续实验。图1-2LINC02163与β-actin的扩增曲线和熔解曲线。Figure1-2:AmplificationandmeltingcurvesofLINC02163andβ-actin.1.2.3LINC02163在肝癌组织中的表达情况我们利用qRT-PCR检测和分析60例肝癌以及其配对癌旁肝组织标本中LINC02163的差异表达情况，用β-actin作为内参基因对目的基因LINC02163的表达量进行校正。结果表明：与配对癌旁组织相比，LINC02163在肝癌组织中的表达明显升高，差异有统计学意义（P<0.001，图1-3A）。为了进一步证实我们结果，我们利用生物信息学软件starBase（http://starbase.sysu.edu.cn/）查询TCGA肝细胞肝癌数据库中的LINC02163基因表达情况，starBase上分析的结果与本实验组织样本的结果一致（图1-3B）。
陆军军医大学硕士学位论文20图1-3：LINC02163在肝癌组织与肝组织中的基因表达量。（A）qRT-PCR检测分析肝癌组织（n=60）与其配对癌旁组织（n=60）中LINC02163的表达量。用ΔΔCt值显示LINC02163的表达水平（ΔCt=CtLINC02163－Ctβ-actin，ΔΔCt=ΔCt实验组－ΔCt对照组）。ΔΔCt值越高，表达量越高。***，Wilcoxon符号秩检验，P<0.001。（B）TCGA肝细胞肝癌数据库中的肝癌组织（n=374）与正常肝组织（n=50）LINC02163的表达量。Figure1-3:TheexpressionofLINC02163inHCCandlivertissues.(A)qRT-PCRwasusedtodetectandanalyzetherelativeexpressionlevelofLINC02163inHCCtissues(n=60)andpairedadjacenttissues(n=60).ΔΔCtvalueswereusedtoshowrelativeexpressionlevelofLINC02163(ΔCt=CtLINC02163－Ctβ-actin,ΔΔCt=ΔCtexperiment－ΔCtcontrol).HigherΔΔCtvaluesindicatehigherexpression.***,Wilcoxonsymbolranktest,P<0.001.(B)LINC02163expressioninHCCtissues(n=374)andnormallivertissues(n=50)inTCGAHCCdatabase.1.2.4LINC02163在肝癌组织中的表达与肝癌患者临床病理参数之间的关系我们进一步分析了60例HCC患者肝癌组织中LINC02163的表达与各临床病理参数之间的关系，以便验证LINC02163在肝癌发生发展过程中的作用。将纳入研究的60例病例按照HCC组织的LINC02163相对表达量依次排序，并按中位数方法分为高表达组及低表达组各30例。用2检验分别验证两组间临床一般情况及病理参数有无统计学差异。结果显示，LINC02163的表达水平与性别、年龄、肝硬化、AFP表达水平、肿瘤直径、数目、病理分级等无明显相关性，而与肿瘤TNM分期和微血管侵犯（MVI）有显著的关联（P<0.01，表1-3）。相比临床早期（Ⅰ～Ⅱ期,
【参考文献】：
期刊论文
[1]Downregulation of LncRNAH19 and MiR-675 Promotes Migration and Invasion of Human Hepatocellular Carcinoma Cells through AKT/GSK-3β/Cdc25A Signaling Pathway[J]. 吕军,马宁,陈锡林,黄晓卉,汪谦. Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2014(03)
[2]Risk factors for early recurrence of small hepatocellular carcinoma after curative resection[J]. Yan-Ming Zhou,Jia-Mei Yang,Bin Li,Zheng-Feng Yin,Feng Xu,Bin Wang,Wen Xu and Tong Kan Department of Hepato-Biliary-Pancreato-Vascular Surgery,First Xiamen Hospital,Fujian Medical University,Xiamen 361003,China;Department of Special Treatment,Department of Molecular Oncology,Department of Pathology,Eastern Hepatobiliary Surgery Hospital,Second Military Medical University,Shanghai 200438,China. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2010(01)
本文编号：3314340
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