盆腔菌群与上皮性卵巢癌的相关性研究
发布时间:2021-08-01 18:08
目的上皮性卵巢癌是女性生殖系统常见的恶性肿瘤,由于病因及发生机制不明,晚期患者五年生存率仅40%,其病死率居妇科恶性肿瘤之首。近来多项研究表明,人体微环境菌群的变化可能与人体肿瘤的发生有关。当前研究发现女性生殖道具有独特的菌落结构,盆腔是卵巢存在的微环境,因而更具有研究价值和临床意义。本课题旨在探究上皮性卵巢癌患者的盆腔菌群特征,阐明盆腔菌群与上皮性卵巢癌的相关性,为卵巢癌的诊治及预后预测提供有效的思路及价值。方法研究对象为在浙江大学医学院附属邵逸夫医院及浙江省肿瘤医院住院的手术患者,分为上皮性卵巢癌组、卵巢良性肿瘤组及子宫肌瘤组(对照组),共50例,术中收集直肠子宫陷凹腹腔液标本。根据组织学类型、病理分级、有无淋巴结转移等临床特征进行分组。采用16Sr RNA基因高通量测序技术以及高级生物信息分析及统计方法,比较明确盆腔菌群种类及丰度,筛选差异菌群,构建诊断模型,进行菌群功能分析,筛选相关通路。结果(1)16Sr RNA基因高通量测序分析显示上皮性卵巢癌患者具有独特的盆腔菌群结构,相对于肌瘤组有显著的菌群差异性,但对于卵巢良性肿瘤组,差异性不显著。(2)基于观测到的OTU数目,显示卵...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(1.A)临床样本处理流程图;(1.B)数据分析流程图
浙江大学硕士学位论文结果12图2提取的部分样本(上皮性卵巢癌、卵巢良性肿瘤及子宫肌瘤组)的DNA电泳结果。3.3PCR扩增鉴定测序区域的不同对环境中微生物的丰富性及多样性估计影响很大,偏高或偏低都会对数据的可靠性造成很大的干扰,研究中我们选取的细菌V3-V4区域进行PCR扩増,这一区域的基因组DNA对环境中微生物的种类及相对丰度估计更加准确。部分样本PCR扩增结果如图3所示,我们可以看到在此条件下大部分样品菌群基因组都可以被扩增出来。图3使用V3-V4区带有的特异引物PCR扩增后部分样本基因组DNA凝胶电泳鉴定图(目的条带为430bp)。
浙江大学硕士学位论文结果12图2提取的部分样本(上皮性卵巢癌、卵巢良性肿瘤及子宫肌瘤组)的DNA电泳结果。3.3PCR扩增鉴定测序区域的不同对环境中微生物的丰富性及多样性估计影响很大,偏高或偏低都会对数据的可靠性造成很大的干扰,研究中我们选取的细菌V3-V4区域进行PCR扩増,这一区域的基因组DNA对环境中微生物的种类及相对丰度估计更加准确。部分样本PCR扩增结果如图3所示,我们可以看到在此条件下大部分样品菌群基因组都可以被扩增出来。图3使用V3-V4区带有的特异引物PCR扩增后部分样本基因组DNA凝胶电泳鉴定图(目的条带为430bp)。
本文编号:3315997
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(1.A)临床样本处理流程图;(1.B)数据分析流程图
浙江大学硕士学位论文结果12图2提取的部分样本(上皮性卵巢癌、卵巢良性肿瘤及子宫肌瘤组)的DNA电泳结果。3.3PCR扩增鉴定测序区域的不同对环境中微生物的丰富性及多样性估计影响很大,偏高或偏低都会对数据的可靠性造成很大的干扰,研究中我们选取的细菌V3-V4区域进行PCR扩増,这一区域的基因组DNA对环境中微生物的种类及相对丰度估计更加准确。部分样本PCR扩增结果如图3所示,我们可以看到在此条件下大部分样品菌群基因组都可以被扩增出来。图3使用V3-V4区带有的特异引物PCR扩增后部分样本基因组DNA凝胶电泳鉴定图(目的条带为430bp)。
浙江大学硕士学位论文结果12图2提取的部分样本(上皮性卵巢癌、卵巢良性肿瘤及子宫肌瘤组)的DNA电泳结果。3.3PCR扩增鉴定测序区域的不同对环境中微生物的丰富性及多样性估计影响很大,偏高或偏低都会对数据的可靠性造成很大的干扰,研究中我们选取的细菌V3-V4区域进行PCR扩増,这一区域的基因组DNA对环境中微生物的种类及相对丰度估计更加准确。部分样本PCR扩增结果如图3所示,我们可以看到在此条件下大部分样品菌群基因组都可以被扩增出来。图3使用V3-V4区带有的特异引物PCR扩增后部分样本基因组DNA凝胶电泳鉴定图(目的条带为430bp)。
本文编号:3315997
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