基于液相色谱-质谱联用技术的早期胃癌血液代谢组学研究
发布时间：2021-09-08 14:23
应用液相色谱质谱联用技术（LC-MS）对进展期胃癌、早期胃癌和健康人的血液样本进行分析,得出进展期胃癌、早期胃癌、健康人血清样本代谢物代谢谱,找出差异代谢产物。并尝试检验这些标记物对区分胃癌和健康人、早期胃癌和健康人的准确性,为寻找早期胃癌新的生物标志物提供科学依据。方法:1、样本处理:样本采集后14000r/min离心5min,取上清液供LC-MS分析。2、LC-MS分析:通过液相色谱-质谱仪对血清样本进行检测,得到进展期胃癌、早期胃癌和健康人的血液样本代谢图谱和相关原始数据。3、数据处理:采用方差分析、主成分分析、偏最小二乘判别分析、聚类分析等统计方法进行分析,分析胃癌患者和健康人、早期胃癌和健康人的差异代谢产物,绘制ROC曲线验证这些产物对于区分各组的准确性。4、验证组验证:设立独立样本作为验证组,用几种差异代谢物对验证组进行验证、分组和准确性的判断。结果:1、在正负两种离子模式下,得到进展期胃癌、早期胃癌和健康人样本的总离子流程图,可看到各组之间存在峰度值差异;2、通过方差分析,共筛选出316个具有统计学意义的代谢物;主成分分析得分图可以看到各组可以很好的区分开;3、用偏最小二...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
进展期胃癌、早期胃癌和健康人血样的LC-MS总离子流图
第3章实验结果253.2方差分析方差分析的意义是通过分析研究不同来源的变异对总变异的贡献大小，从而确定可控因素对研究结果影响力的大校为了从大量的数据中区分开三组的差异代谢物，本实验通过对三组数据进行方差分析，筛选符合条件的F值和P值。F就是计算出来的F值,用来评估组间差异。F值表示整个拟合方程的显著性，F越大，表示方程越显著，拟合程度也就越好通过用组间均方去除组内均方的商（即F值）与1相比较，若F值接近1，则说明各组均值间的差异没有统计学意义，若F值远大于1，则说明各组均值间的差异有统计学意义，同样P值小于0.05表示具有统计学意义。通过设置条件为F值远大于1且P值小于0.01，共筛选出316个具有统计学意义的代谢物，如图3.2所示，数值见附表1.通过对这些数据的统计分析来研究进展期胃癌、早期胃癌和健康人血样之间的差异。图3.2方差分析结果
第3章实验结果263.3主成分分析本实验通过对离子流图的数据进行特征识别，得到含有所有信息的文件（.xls格式），将数据经过metalab软件进行归一化、标度化等预处理并转换成.csv格式，将该数据导入metaboanalyst.ca网站进行主成分分析（PCA）。其得分图如图3.3所示。图中的每一个点分别代表一个样本，各个样本的代谢特点确定了这些代谢物位置，因此，样本间的距离越近，表示样本间具有相似的代谢物组成，生理病理状态下样本相差小；反之样本距离越远，表示代谢物差距越大，生理病理状态下样本相差大。在得分图上可以明确的看出，组间的聚集良好，说明组内的差异较校进展期胃癌、早期胃癌分别可以和健康人的样本可以分开，证明组间存在差异，进展期和早期胃癌之间部分存在交集，说明一些产物既可以存在与早期胃癌，也可以存在进展期胃癌中。图3.3主成分分析得分图.（）进展期胃癌，（）早期胃癌，（）健康人，（）质控组
【参考文献】：
期刊论文
[1]靶向多胺代谢调控网络的小分子药物及抗肿瘤应用[J]. 马红艳,刘森. 中国生物化学与分子生物学报. 2020(04)
[2]早期胃癌内镜下规范化切除的专家共识意见（2018,北京）[J]. 北京市科委重大项目《早期胃癌治疗规范研究》专家组,柴宁莉,翟亚奇,杜晨. 中华胃肠内镜电子杂志. 2018(02)
[3]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[4]Magnifying narrow-band imaging endoscopy is superior in diagnosis of early gastric cancer[J]. Hang Yu,Ai-Ming Yang,Xing-Hua Lu,Wei-Xun Zhou,Fang Yao,Gui-Jun Fei,Tao Guo,Li-Qing Yao,Li-Ping He,Bang-Mao Wang. World Journal of Gastroenterology. 2015(30)
本文编号：3390945
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
进展期胃癌、早期胃癌和健康人血样的LC-MS总离子流图
第3章实验结果253.2方差分析方差分析的意义是通过分析研究不同来源的变异对总变异的贡献大小，从而确定可控因素对研究结果影响力的大校为了从大量的数据中区分开三组的差异代谢物，本实验通过对三组数据进行方差分析，筛选符合条件的F值和P值。F就是计算出来的F值,用来评估组间差异。F值表示整个拟合方程的显著性，F越大，表示方程越显著，拟合程度也就越好通过用组间均方去除组内均方的商（即F值）与1相比较，若F值接近1，则说明各组均值间的差异没有统计学意义，若F值远大于1，则说明各组均值间的差异有统计学意义，同样P值小于0.05表示具有统计学意义。通过设置条件为F值远大于1且P值小于0.01，共筛选出316个具有统计学意义的代谢物，如图3.2所示，数值见附表1.通过对这些数据的统计分析来研究进展期胃癌、早期胃癌和健康人血样之间的差异。图3.2方差分析结果
第3章实验结果263.3主成分分析本实验通过对离子流图的数据进行特征识别，得到含有所有信息的文件（.xls格式），将数据经过metalab软件进行归一化、标度化等预处理并转换成.csv格式，将该数据导入metaboanalyst.ca网站进行主成分分析（PCA）。其得分图如图3.3所示。图中的每一个点分别代表一个样本，各个样本的代谢特点确定了这些代谢物位置，因此，样本间的距离越近，表示样本间具有相似的代谢物组成，生理病理状态下样本相差小；反之样本距离越远，表示代谢物差距越大，生理病理状态下样本相差大。在得分图上可以明确的看出，组间的聚集良好，说明组内的差异较校进展期胃癌、早期胃癌分别可以和健康人的样本可以分开，证明组间存在差异，进展期和早期胃癌之间部分存在交集，说明一些产物既可以存在与早期胃癌，也可以存在进展期胃癌中。图3.3主成分分析得分图.（）进展期胃癌，（）早期胃癌，（）健康人，（）质控组
【参考文献】：
期刊论文
[1]靶向多胺代谢调控网络的小分子药物及抗肿瘤应用[J]. 马红艳,刘森. 中国生物化学与分子生物学报. 2020(04)
[2]早期胃癌内镜下规范化切除的专家共识意见（2018,北京）[J]. 北京市科委重大项目《早期胃癌治疗规范研究》专家组,柴宁莉,翟亚奇,杜晨. 中华胃肠内镜电子杂志. 2018(02)
[3]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[4]Magnifying narrow-band imaging endoscopy is superior in diagnosis of early gastric cancer[J]. Hang Yu,Ai-Ming Yang,Xing-Hua Lu,Wei-Xun Zhou,Fang Yao,Gui-Jun Fei,Tao Guo,Li-Qing Yao,Li-Ping He,Bang-Mao Wang. World Journal of Gastroenterology. 2015(30)
本文编号：3390945
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