食管鳞状细胞癌hsa c ircRNA6448-14的功能及机制的初步研究
发布时间：2021-09-15 20:25
研究背景环状RNA（circular RNA,circRNA）是一类新型的非编码RNA,在恶性肿瘤的进展中发挥重要作用。然而,circRNA在食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）中的作用尚不清楚,因此我们构建我国高发区ESCC的circRNA表达谱,并探讨关键circRNA在ESCC中的功能及机制。第一部分 食管鳞状细胞癌相关circRNA表达谱分析目的构建我国高发区ESCC相关circRNA表达谱,筛选出差异表达circRNA并对其进行功能预测。方法选取6对ESCC组织和配对癌旁正常组织样本,采取基因芯片技术和微阵列分析构建circRNA表达谱;以差异倍数（FC）≥ 2倍且p<0.05为条件,筛选差异表达的circRNA;通过GO和Pathway分析,预测circRNA的功能;构建circRNA-miRNA调控网络图,探讨circRNA作用机制。结果CircRNA在ESCC组织与匹配癌旁正常组织的表达差异明显,共发现15908个circRNAs表达失调（FC≥2.0,p值<0.05）,其中上调7161个,下调87...
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２食管鱗癌全样本ｃｉｒｃＲＮＡ表达分析（Ａ）聚类分析，（Ｂ）相关性分析，（Ｃ）箱线图，??（Ｄ）主成分分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ａｎａｌｙｓｉｓ?
?第一部分食管鱗状细胞癌相关ｃｉｒｃＲＮＡ表达谱分析???Ｅ?Ｆ??■?Ｕｐｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ?ＩＳｆＫＩｆｌ??Ｈ?Ｄｏｗｎｒｅｇｕｌａｔ？ｄ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ??□?Ｔｏｔａｌ?ｎｒｃＲＮＡｓ?１６０００?■??■?ｕｐ－ｒｅｇｕｌａＫｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ??ｎ?１４０００?■?Ｃ??■?ｄｏｗｎ－ｒｅａｕｌａｔｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ??１２０００?漏??＾?＾?ｄ?ａ?ｔｏｔａｌ?ａｒｃＫＮＡ??ｌ＿塵―—＂＾?ｉ１??图３食管鳞状细胞癌ｃｉｒＲＮＡ差异表达（Ａ）聚类分析图，（Ｂ）散点图，（Ｃ）火山图，??（Ｄ）圆环图，（Ｅ）?ｃｉｒｃＲＮＡ染色体分布图，（Ｆ）?ｃｉｒｃＲＮＡ来源图??Ｆｉｇｕｒｅ?３?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｏｆ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ?ｉｎ?ＥＳＣＣ．?（Ａ）?Ｈｉｅｒａｒｃｈｉｃａｌ?ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ．?（Ｂ）?Ｓｃａｔｔｅｒ??ｐｌｏｔ．?（Ｃ）?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ．?（Ｄ）?Ｃｉｒｃｏｓ?ｐｌｏｔ．?（Ｅ）?ＣｉｒｃＲＮＡ?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ．?（Ｆ）?ＣｉｒｃＲＮＡ??ｓｏｕｒｃｅ．??２．３差异ｃｉｒｃＲＮＡ基因注释富集分析??２．３．１?ＧＯ基因功能富集分析??图４Ａ可见ｃｉｒｃＲＮＡ的宿主基因在ＢＰ、ＣＣ和ＭＦ中均有分布。ＢＰ中，差??异表达ｃｉｒｃＲＮＡ主要分布在细胞过程（ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｐｒｏｃｅｓｓ）、单组织过程??（ｓｉｎｇｌｅ－ｏｒｇａｎｉｓｍ）、代谢过程（ｍｅｔａｂｏｌｉｃ?ｐｒｏｃｅｓｓ）、生物调节（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ）??和生物过程调节（ｒ
?第一部分食管鳞状细胞癌相关ｃｉｒｃＲＮＡ表达谱分析???＿?＿｜屢＿?顯＿?Ｉ??－??图４Ａ食管鳞状细胞癌差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ基因ＧＯ功能分类图??Ｆｉｇｕｒｅ?４Ａ?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＧＯ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ?ｉｎ?ＥＳＣＣ??２．３．２?Ｐａｔｈｗａｙ富集分析??图４Ｂ可见，ｃｉｒｃＲＮＡ差异表达主要富集Ｐａｔｈｗａｙ有细胞外基质受体相互作??用（ＥＣＭ－ｒｅｃｅｐｔｏｒ?ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ）、粘着斑（ｆｏｃａｌ?ａｄｈｅｓｉｏｎ）、蛋白质消化与吸收??（ｐｒｏｔｅｉｎ?ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ?ａｎｄ?ａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ）、阿米巴病（Ａｍｏｅｂｉａｓｉｓ）、紧密接头（ｔｉｇｈｔ??ｊｕｎｃｔｉｏｎ）和ＤＮＡ复制（ＤＮＡ?ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ）等，其他Ｐａｔｈｗａｙ上也有少量富集。??图４Ｂ食管鱗状细胞癌差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ基Ｗ?ＫＥＧＧ－Ｐａｔｈｗａｙ阁??Ｆｉｇｕｒｅ?４Ｂ?ＫＥＧＧ－Ｐａｔｈｗａｙ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ＥＳＣＣ??２５??
【参考文献】：
期刊论文
[1]影响食管癌患者手术预后的因素分析[J]. 章晓彬,王中林. 江苏医药. 2019(03)
[2]影响pN0期食管癌术后生存因素分析[J]. 董石磊,王玉祥,何明,李静,齐战,杨洁,李娟. 中华肿瘤防治杂志. 2019(03)
[3]Predicting malignant transformation of esophageal squamous cell lesions by combined biomarkers in an endoscopic screening program[J]. Hao Zhang,Hao Li,Qing Ma,Fang-Yan Yang,Tao-Yu Diao. World Journal of Gastroenterology. 2016(39)
本文编号：3396753
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２食管鱗癌全样本ｃｉｒｃＲＮＡ表达分析（Ａ）聚类分析，（Ｂ）相关性分析，（Ｃ）箱线图，??（Ｄ）主成分分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ａｎａｌｙｓｉｓ?
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【参考文献】：
期刊论文
[1]影响食管癌患者手术预后的因素分析[J]. 章晓彬,王中林. 江苏医药. 2019(03)
[2]影响pN0期食管癌术后生存因素分析[J]. 董石磊,王玉祥,何明,李静,齐战,杨洁,李娟. 中华肿瘤防治杂志. 2019(03)
[3]Predicting malignant transformation of esophageal squamous cell lesions by combined biomarkers in an endoscopic screening program[J]. Hao Zhang,Hao Li,Qing Ma,Fang-Yan Yang,Tao-Yu Diao. World Journal of Gastroenterology. 2016(39)
本文编号：3396753
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