胰腺星状细胞差异表达基因的筛

发布时间：2021-10-17 17:55

　　第一部分静止几活化胰腺星状细胞差异表达基因的筛选及生物信息学分析目的:胰腺癌具有发现晚、进展快、可手术比例小、高耐药率以及高病死率的特点,被称为“癌症之王”,而其显著病理特点为:以PSC为中心,ECM主导的胰腺癌组织纤维结缔组织生成。随着基因技术、信息技术的飞速发展,大数据时代的到来,生物信息学这一门跨学科手段成为人们从宏观角度解读疾病的又一利器。因此我们采用这一手段,筛选静止及活化状态下PSC的差异表达基因并对其进行生物信息学分析。方法:选取北京协和医院8例经病理确诊为胰腺导管腺癌患者的癌组织原代培养PSC。连续5天每天加入ATRA避光培养获得静止状态PSC,分别提取静止及活化状态下PSC基因组进行测序分析,从中筛选出DEG,利用包括GO分析和KEGG生物学通路富集分析在内的生物信息学方法,进一步探索DEG间的生物关联及作用。结果:从33289条基因中筛选出192个DEG,其中上调表达基因109个,下调表达基因83个,其中排在前三位的下调基因是:HR、RP11-624L4.1和FGF9。GO富集分析生物过程BP部分排在前2位的是:细胞外结构组织和细胞外基质组织;CC部分排在前3位的是... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：44 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
序
摘要
Abstract
前言
第一部分 静止及活化状态胰腺星状细胞差异表达基因的筛选
    1. 材料与方法
        1.1 样本收集
        1.2 实验材料
        1.3 实验方法
    2. 实验结果
        2.1 DEG筛选
        2.2 生物信息学分析
    3. 讨论
    4. 结论
第二部分FGF9及其相关受体的RT-qPCR验证
    1. 材料与方法
        1.1 实验所需试剂、耗材及仪器见表 1.1
        1.2 实验方法
    2. 实验结果
        2.1 qPCR结果
    3. 讨论
    4. 结论
综述
参考文献
作者简介
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]成纤维细胞生长因子受体2在胃癌中的研究进展[J]. 魏文珍,王玉平,周永宁.  医学综述. 2016(12)
[2]成纤维细胞生长因子及其受体抑制剂的研究进展[J]. 杜培娟.  化学与生物工程. 2014(12)
[3]成纤维细胞生长因子受体3研究进展[J]. 杨启红.  国外医学.遗传学分册. 2003(05)



本文编号：3442181