基于核磁共振代谢组学的胰腺癌代谢分型和不同分化程度的胰腺癌模型血清代谢差异的研究
发布时间：2021-11-19 14:45
第一部分基于组织核磁共振代谢组学的胰腺癌代谢分型的研究目的:探索基于核磁共振（NMR）代谢组学技术建立胰腺癌组织代谢分型,揭示胰腺癌在组织代谢组学层面的异质性,发现不同分型患者在临床进展和预后的差异。方法:采用1H NMR波谱检测113例胰腺癌组织样本（PCa组）和56例正常胰腺组织样本（Control组）代谢数据,通过分层聚类分析（HCA）获得PCa不同亚组。联合单变量和多变量统计方法分析不同亚组代谢变化、相关代谢通路及组间代谢差异,根据亚组代谢特征确定代谢分型。收集并比较各分型患者临床资料的差异。受试者工作特征曲线（ROC）分析筛选区分胰腺癌以及区分特定分型的代谢标志物。结果:根据HCA分析,得到PCa-1、2A和2B三个亚组。与Control组相比,PCa各亚组代谢变化显著,表现为糖类、羧酸类、部分氨基酸及氨基酸分解产物含量的上升和三羧酸循环底物、嘧啶、嘌呤、核苷类、胆碱类以及烟酰胺类物质含量的降低,仅有少部分代谢物呈不同变化趋势,提示不同亚组总体代谢重构趋势相似。亚组间比较显示,各亚组中代谢物含量变化程度和代谢变化主要相关通路并不相同。PCa-1组以高氨基...
【文章来源】：福建医科大学福建省
【文章页数】：156 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
胰腺癌组织（PCa）与正常胰腺组织（Control）水溶性萃取物平均1HNMR图谱，黑框表示其内的谱线放大20倍；波谱归属见表1.2.
42图1.3PCa各亚组与对照组的组织核磁共振波谱数据OPLS-DA比较得分图及代谢物火山图。A-C. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B OPLS-DA 得分图。R2X、R2Y和 Q2来源于 10 次交叉验证和响应排序检验, P 值为 CV-ANOVA 检验，D-F. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B 代谢物火山图。右侧图为左侧绿色框区域的放大图。每一个圆点代表一个代谢物，圆点的大小按照 VIP 值从大到小分为 4 种大小（<10%、10-30%、30%-60%和>60%）进行编码。圆点的颜色按照 Pcorr 绝对值大小进行编码，越高越偏向红色。横坐标由后组该代谢物平均含量/前组该代谢物平均含量比值的Log2值进行表示，
5 基于 PCa 各亚组与 Control 组代谢差异的关键代谢通路。A-C.ControlvsPCa- PCa-2B 代谢差异的相关代谢通路点状图，圆点代表代谢通路，纵轴和圆点颜路的-Log10（P 值）表示和编码，-Log10（P 值）越高，圆点位置越高、颜色越偏向路与代谢差异相关的可信度越高。横轴代表各代谢通路的代谢影响，该通路对代，离原点越远，半径越大。P 值采用通路富集分析计算获得，代谢影响采用通路算得出，上述工作采用 MetaboAnalysts 3.0 服务实现。各图中代谢通路数字标识标识。D. PCa 各亚组与 Control 组比较，P 值最小的前 20 各代谢通路热图。图中Ca-2A、PCa-2B 分别代表 PCa-1、PCa-2A 和 PCa-2B 与 Control 组代谢差异通路果中，P 值最小的前 20 位代谢通路。各代谢通路颜色按照 P 值得大小进行编码近黄色，P 值越低，颜色越接近棕色，P 值越高。黑色则代表该通路不属于 P 值 位代谢通路。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Dysregulated lipid metabolism in cancer[J]. Feng Zhang, Guangwei Du, Department of Integrative Biology and Pharmacology, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, United States. World Journal of Biological Chemistry. 2012(08)
本文编号：3505263
【文章来源】：福建医科大学福建省
【文章页数】：156 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
胰腺癌组织（PCa）与正常胰腺组织（Control）水溶性萃取物平均1HNMR图谱，黑框表示其内的谱线放大20倍；波谱归属见表1.2.
42图1.3PCa各亚组与对照组的组织核磁共振波谱数据OPLS-DA比较得分图及代谢物火山图。A-C. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B OPLS-DA 得分图。R2X、R2Y和 Q2来源于 10 次交叉验证和响应排序检验, P 值为 CV-ANOVA 检验，D-F. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B 代谢物火山图。右侧图为左侧绿色框区域的放大图。每一个圆点代表一个代谢物，圆点的大小按照 VIP 值从大到小分为 4 种大小（<10%、10-30%、30%-60%和>60%）进行编码。圆点的颜色按照 Pcorr 绝对值大小进行编码，越高越偏向红色。横坐标由后组该代谢物平均含量/前组该代谢物平均含量比值的Log2值进行表示，
5 基于 PCa 各亚组与 Control 组代谢差异的关键代谢通路。A-C.ControlvsPCa- PCa-2B 代谢差异的相关代谢通路点状图，圆点代表代谢通路，纵轴和圆点颜路的-Log10（P 值）表示和编码，-Log10（P 值）越高，圆点位置越高、颜色越偏向路与代谢差异相关的可信度越高。横轴代表各代谢通路的代谢影响，该通路对代，离原点越远，半径越大。P 值采用通路富集分析计算获得，代谢影响采用通路算得出，上述工作采用 MetaboAnalysts 3.0 服务实现。各图中代谢通路数字标识标识。D. PCa 各亚组与 Control 组比较，P 值最小的前 20 各代谢通路热图。图中Ca-2A、PCa-2B 分别代表 PCa-1、PCa-2A 和 PCa-2B 与 Control 组代谢差异通路果中，P 值最小的前 20 位代谢通路。各代谢通路颜色按照 P 值得大小进行编码近黄色，P 值越低，颜色越接近棕色，P 值越高。黑色则代表该通路不属于 P 值 位代谢通路。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Dysregulated lipid metabolism in cancer[J]. Feng Zhang, Guangwei Du, Department of Integrative Biology and Pharmacology, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, United States. World Journal of Biological Chemistry. 2012(08)
本文编号：3505263
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