结直肠癌中差异表达环状RNA的鉴定与表达调控网络预测及初步验证
发布时间：2021-12-10 12:02
目的:长久以来,癌症一直被誉为人类健康的“第一大杀手”。结直肠癌（colorectal cancer,CRC）是第三大常见的肿瘤,也是消化道肿瘤内发病率排名第二位的恶性肿瘤。根据美国国家癌症研究所的监测数据,在2019年中,结直肠癌约有145,600例发病病例,且有51,012例新增死亡病例。在我国,结直肠癌发病率数十年来逐渐递增,位于男性罹患癌症发病的第三位,女性中第二位。随着国民经济水平提高,饮食结构的改变,结直肠癌的发病年龄逐渐走低,青少年与中青年的患病人数已然增长。然而,许多结直肠癌患者在诊断之时已经发展为恶性晚期并伴有多发转移,如果能够实现肿瘤的早期诊断可大大降低肿瘤的发病率。目前结直肠癌的治疗方式多以外科手术切除为主辅助化疗药物的应用;癌症患者往往预后差,复发率高,不足40%的患者生存期超过5年。近些年来,根据肿瘤特异性筛查靶点研发的靶向药物与精准治疗得到巨大突破,在多种肿瘤中得到了较好的疗效。但肿瘤的发生发展是个多变复杂的过程,受多种因素的影响;目前,结直肠癌的病理机制尚未研究透彻,又缺乏有效的治疗靶标和生物标志物。因此,深入研究其发生机制、筛选出特异性的治疗靶点与生物标...
【文章来源】：中国医科大学辽宁省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
1CRC成对组织中DECs筛选结果
中国医科大学硕士学位论文21图3.1.2DECs特征分析图（a）circRNA种类分布（b）circRNA序列长度分布（c）circRNA的染色体分布。3.1.3DECs亲本基因的功能富集分析由于circRNA在功能上可能与其亲本基因的功能具有相关性，我们对其亲本基因进行了GeneOntology与KEGG富集分析。根据GO-bp结果分析得到，亲本基因对应的生物学功能主要依次富集在细胞分化的调控、组织结构分化、纤毛运动形成、MAPK联级反应的正向调控、G-蛋白偶联受体信号通路、神经元反射发育的正调控、细胞形态调节、促进细胞增殖、炎性反应等方面。KEGG通路富集分析得到结果为：癌症相关通路、肌动蛋白细胞骨架调节、PIK3-AKT信号通路、内质网中蛋白质加工、神经配体-受体相互作用、Rap1信号通路、Ras信号通路。富集结果（如图3.1.3）显示DECs的亲本基因在以上生物学过程中发挥作用，为认识DECs的潜在功能提供参考。
中国医科大学硕士学位论文22图3.1.3DECs亲本基因功能分析图（a）DECs亲本基因的GeneOntology分析。（b）DECs亲本基因的KEGG途径富集分析。3.2RNA-seq数据和GSE116589联合分析为了进一步确认CRC中潜在的功能性DEC，我们将RNA-seq数据和GSE116589（n=2）进行联合分析。由此，我们发现两组测序数据中存在6个共同上调的DECs（hsa_circ_0030632、hsa_circ_0004887、hsa_circ_0001550、hsa_circ_0001681、hsa_circ_0002970和hsa_circ_0006528）和17个共同下调的
【参考文献】：
期刊论文
[1]嘌呤核苷酸代谢与恶性肿瘤关系的研究进展[J]. 苑小星. 癌症进展. 2019(21)
[2]Circular RNA PIP5K1A promotes colon cancer development through inhibiting mi R-1273a[J]. Qu Zhang,Chi Zhang,Jian-Xin Ma,Hui Ren,Yu Sun,Jiao-Zhen Xu. World Journal of Gastroenterology. 2019(35)
[3]Effect of exercise on colorectal cancer prevention and treatment[J]. Zeynep Oru?,Muhammed Ali Kaplan. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(05)
[4]磷酸戊糖途径——肿瘤治疗的新视角[J]. 何子豪,姚竞月,郭青龙. 世界最新医学信息文摘. 2018(09)
[5]Genomic diversity of colorectal cancer: Changing landscape and emerging targets[J]. Daniel H Ahn,Kristen K Ciombor,Sameh Mikhail,Tanios Bekaii-Saab. World Journal of Gastroenterology. 2016(25)
[6]大肠癌筛查研究进展[J]. 胡水清,张玫. 中国肿瘤. 2012(05)
本文编号：3532589
【文章来源】：中国医科大学辽宁省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
1CRC成对组织中DECs筛选结果
中国医科大学硕士学位论文21图3.1.2DECs特征分析图（a）circRNA种类分布（b）circRNA序列长度分布（c）circRNA的染色体分布。3.1.3DECs亲本基因的功能富集分析由于circRNA在功能上可能与其亲本基因的功能具有相关性，我们对其亲本基因进行了GeneOntology与KEGG富集分析。根据GO-bp结果分析得到，亲本基因对应的生物学功能主要依次富集在细胞分化的调控、组织结构分化、纤毛运动形成、MAPK联级反应的正向调控、G-蛋白偶联受体信号通路、神经元反射发育的正调控、细胞形态调节、促进细胞增殖、炎性反应等方面。KEGG通路富集分析得到结果为：癌症相关通路、肌动蛋白细胞骨架调节、PIK3-AKT信号通路、内质网中蛋白质加工、神经配体-受体相互作用、Rap1信号通路、Ras信号通路。富集结果（如图3.1.3）显示DECs的亲本基因在以上生物学过程中发挥作用，为认识DECs的潜在功能提供参考。
中国医科大学硕士学位论文22图3.1.3DECs亲本基因功能分析图（a）DECs亲本基因的GeneOntology分析。（b）DECs亲本基因的KEGG途径富集分析。3.2RNA-seq数据和GSE116589联合分析为了进一步确认CRC中潜在的功能性DEC，我们将RNA-seq数据和GSE116589（n=2）进行联合分析。由此，我们发现两组测序数据中存在6个共同上调的DECs（hsa_circ_0030632、hsa_circ_0004887、hsa_circ_0001550、hsa_circ_0001681、hsa_circ_0002970和hsa_circ_0006528）和17个共同下调的
【参考文献】：
期刊论文
[1]嘌呤核苷酸代谢与恶性肿瘤关系的研究进展[J]. 苑小星. 癌症进展. 2019(21)
[2]Circular RNA PIP5K1A promotes colon cancer development through inhibiting mi R-1273a[J]. Qu Zhang,Chi Zhang,Jian-Xin Ma,Hui Ren,Yu Sun,Jiao-Zhen Xu. World Journal of Gastroenterology. 2019(35)
[3]Effect of exercise on colorectal cancer prevention and treatment[J]. Zeynep Oru?,Muhammed Ali Kaplan. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(05)
[4]磷酸戊糖途径——肿瘤治疗的新视角[J]. 何子豪,姚竞月,郭青龙. 世界最新医学信息文摘. 2018(09)
[5]Genomic diversity of colorectal cancer: Changing landscape and emerging targets[J]. Daniel H Ahn,Kristen K Ciombor,Sameh Mikhail,Tanios Bekaii-Saab. World Journal of Gastroenterology. 2016(25)
[6]大肠癌筛查研究进展[J]. 胡水清,张玫. 中国肿瘤. 2012(05)
本文编号：3532589
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3532589.html
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