ALDH18A1调控结直肠癌细胞自我更新的分子机制及治疗学意义
发布时间:2021-12-24 16:28
结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)是消化系统常见的恶性肿瘤之一,死亡率居恶性肿瘤第三位。尽管接受手术、放疗和化疗等综合治疗,仍有约20%-45%的CRC患者发生局部复发或远处转移,发生转移的患者5年生存率仅为14%。因此,寻找新的治疗靶点和策略,具有重要的临床意义。代谢异常是包括CRC在内的多种恶性肿瘤的重要特征,多种代谢产物可通过调控肿瘤相关基因的表观遗传学状态和表达来改变肿瘤细胞表型。有研究表明,侵袭及转移是由肿瘤组织中具有强大自我更新能力的一群细胞所介导的。因此,研究特殊代谢状态对CRC细胞自我更新的调控,是寻找CRC转移治疗靶点的重要方向。乙醛脱氢酶家族18成员A1(Aldehyde dehydrogenase family 18 member A1,ALDH18A1),又称为吡咯啉-5-羧酸合成酶(pyrroline-5-carboxylate synthetase,P5CS)是谷氨酸、鸟氨酸和脯氨酸代谢途径中的关键酶,在氨基酸代谢中扮演重要角色。既往发现,ALDH18A1通过调控脯氨酸的合成代谢来促进黑色素瘤细胞的增殖。此外,ALDH18A1在lumin...
【文章来源】:西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:98 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GEO数据库预测结直肠癌组织及对照正常结肠组织中的ALDH18A1mRNA的差异表达水平
第3章ALDH18A1在结直肠癌中的表达及临床意义23图3.2Kaplan-Meier生存曲线分析ALDH18A1与结直肠癌患者总体生存期的关系。(A)基于TCGA数据库绘制的ROC曲线。(B)基于GSE17538数据集绘制的ROC曲线。(C)基于GSE17537数据集绘制的ROC曲线。(D)基于TCGA数据库绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=372)。(E)基于GSE17538数据集绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=232)。(F)基于GSE17537数据集绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=55)。Figure3.2Kaplan-MeiersurvivalcurveanalysisoftherelationshipbetweenALDH18A1andoverallsurvivalofcolorectalcancerpatients.(A)ROCcurvebasedonTCGAdatabase.(B)ROCcurvebasedonGSE17538dataset.(C)ROCcurvebasedonGSE17537dataset.(D)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithdifferentialexpressionofALDH18A1basedonTCGAdatabase(n=372).(E)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17538databset(n=232).(F)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17537dataset(n=55).
采用WesternBlot检测结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384和正常结肠细胞NCM460中ALDH18A1的表达情况,结果发现ALDH18A1在HT29和SW620这两个结直肠癌细胞系中的表达水平较高,在LoVo和7648384这两个结直肠癌细胞系中的表达水平较低(图4.2A)。我们又采用RT-qPCR检测结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384中ALDH18A1的相对表达量,结果发现ALDH18A1在HT29和SW620这两个结直肠癌细胞系中的mRNA表达水平较高,在LoVo和7648384这两个结直肠癌细胞系中的mRNA表达水平较低(图4.2B)。图4.2WesternBlot和RT-qPCR检测结直肠癌细胞系中ALDH18A1的表达水平。(A)WesternBlot检测ALDH18A1蛋白在结直肠癌细胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)和正常结肠细胞NCM460中的表达差异。(B)RT-qPCR检测结直肠癌细胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)中ALDH18A1mRNA的相对表达量,n=3。Figure4.2WesternblotandRT-qPCRwereusedtodetecttheexpressionofALDH18A1incolorectalcancercellline.(A)WesternBlotdetectedthedifferenceofALDH18A1proteinexpressionincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384)andnormalcoloncells(NCM460).(B)RT-qPCRwasusedtodetecttherelativeexpressionofALDH18A1mRNAincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384),n=3.4.3.3敲低ALDH18A1对结直肠癌细胞自我更新基因表达的影响为了明确干预ALDH18A1后结直肠癌细胞的自我更新能力是否发生变化,我们在采用慢病毒shRNA敲低结直肠癌细胞系SW620细胞中ALDH18A1的表达后,通过WesternBlot、RT-qPCR实验验证敲低效率,进一步比较了SoucieEL等(Soucieetal.,2016)和Papa
【参考文献】:
期刊论文
[1]Identification and prediction of novel non-coding and coding RNA-associated competing endogenous RNA networks in colorectal cancer[J]. Yu Liang,Cheng Zhang,Ming-hui Ma,Dong-qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2018(46)
[2]Regulation of MYC gene expression by aberrant Wnt/β-catenin signaling in colorectal cancer[J]. Sherri Rennoll,Gregory Yochum. World Journal of Biological Chemistry. 2015(04)
本文编号:3550819
【文章来源】:西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:98 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GEO数据库预测结直肠癌组织及对照正常结肠组织中的ALDH18A1mRNA的差异表达水平
第3章ALDH18A1在结直肠癌中的表达及临床意义23图3.2Kaplan-Meier生存曲线分析ALDH18A1与结直肠癌患者总体生存期的关系。(A)基于TCGA数据库绘制的ROC曲线。(B)基于GSE17538数据集绘制的ROC曲线。(C)基于GSE17537数据集绘制的ROC曲线。(D)基于TCGA数据库绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=372)。(E)基于GSE17538数据集绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=232)。(F)基于GSE17537数据集绘制的ALDH18A1差异表达的结直肠癌患者总体生存曲线(n=55)。Figure3.2Kaplan-MeiersurvivalcurveanalysisoftherelationshipbetweenALDH18A1andoverallsurvivalofcolorectalcancerpatients.(A)ROCcurvebasedonTCGAdatabase.(B)ROCcurvebasedonGSE17538dataset.(C)ROCcurvebasedonGSE17537dataset.(D)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithdifferentialexpressionofALDH18A1basedonTCGAdatabase(n=372).(E)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17538databset(n=232).(F)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17537dataset(n=55).
采用WesternBlot检测结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384和正常结肠细胞NCM460中ALDH18A1的表达情况,结果发现ALDH18A1在HT29和SW620这两个结直肠癌细胞系中的表达水平较高,在LoVo和7648384这两个结直肠癌细胞系中的表达水平较低(图4.2A)。我们又采用RT-qPCR检测结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384中ALDH18A1的相对表达量,结果发现ALDH18A1在HT29和SW620这两个结直肠癌细胞系中的mRNA表达水平较高,在LoVo和7648384这两个结直肠癌细胞系中的mRNA表达水平较低(图4.2B)。图4.2WesternBlot和RT-qPCR检测结直肠癌细胞系中ALDH18A1的表达水平。(A)WesternBlot检测ALDH18A1蛋白在结直肠癌细胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)和正常结肠细胞NCM460中的表达差异。(B)RT-qPCR检测结直肠癌细胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)中ALDH18A1mRNA的相对表达量,n=3。Figure4.2WesternblotandRT-qPCRwereusedtodetecttheexpressionofALDH18A1incolorectalcancercellline.(A)WesternBlotdetectedthedifferenceofALDH18A1proteinexpressionincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384)andnormalcoloncells(NCM460).(B)RT-qPCRwasusedtodetecttherelativeexpressionofALDH18A1mRNAincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384),n=3.4.3.3敲低ALDH18A1对结直肠癌细胞自我更新基因表达的影响为了明确干预ALDH18A1后结直肠癌细胞的自我更新能力是否发生变化,我们在采用慢病毒shRNA敲低结直肠癌细胞系SW620细胞中ALDH18A1的表达后,通过WesternBlot、RT-qPCR实验验证敲低效率,进一步比较了SoucieEL等(Soucieetal.,2016)和Papa
【参考文献】:
期刊论文
[1]Identification and prediction of novel non-coding and coding RNA-associated competing endogenous RNA networks in colorectal cancer[J]. Yu Liang,Cheng Zhang,Ming-hui Ma,Dong-qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2018(46)
[2]Regulation of MYC gene expression by aberrant Wnt/β-catenin signaling in colorectal cancer[J]. Sherri Rennoll,Gregory Yochum. World Journal of Biological Chemistry. 2015(04)
本文编号:3550819
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