利用TCGA数据和临床数据探讨细胞因子与肺癌预后以及与PD-1/PD-L1抗体疗效的相关性

发布时间：2024-03-23 23:20

　　研究背景和目的:肿瘤微环境中细胞因子与肿瘤的发生发展以及疗效有着密切的关系。本文第1部分利用TCGA大数据分析组织细胞因子表达水平与肺癌发病和预后的相关性。免疫检查点抑制剂PD-1/PD-L1抗体作为免疫治疗的里程碑式药物广泛应用于多种血液及实体肿瘤,但其治疗过程中的延迟反应和假性进展现象在一定程度上限制了其疗效评价的准确性,本文第2部分分析外周血细胞因子与免疫抑制剂疗效的相关性,旨在寻找一种能早期准确预测抗PD-1/PD-L1治疗疗效的生物标志物。研究方法:1.以TCGA肿瘤临床数据为基础,分别获取522个肺腺癌和504个肺鳞癌样本的临床表征与分子特征(年龄、性别、TNM分期、EGFR/KRAS突变等)、生存期数据以及转录组RNA-seq数据。采用cox regression和Log-rank test等方法分析27个细胞因子的转录组表达高低在总体生存期(OS)和无复发生存期(RFS)的生存期差异,并且进一步挖掘这些细胞因子的高低表达在不同的临床特征分组下的生存期差异。2.纳入肺癌、乳腺癌、结直肠癌等45例患者,均经组织学确诊并接受Nivolumab或Pembrolizumab单独治...

【文章页数】：91 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
缩略词表
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 基于临床大数据的细胞因子与肺癌的相关性研究
    1. 数据概况
    2. TCGA肺腺癌与鳞癌转录组差异表达分析
    3. 肺腺癌细胞因子生存分析
        3.1 肺腺癌不同临床特征的生存期分析
        3.2 肺腺癌细胞因子高低表达生存分析
        3.3 肺腺癌不同临床特征分组间细胞因子表达差异分析
        3.4 肺腺癌不同临床特征分组下细胞因子高低表达生存分析
    4. 肺鳞癌细胞因子生存分析
        4.1 肺鳞癌不同临床特征的生存期分析
        4.2 肺鳞癌细胞因子高低表达生存分析
        4.3 肺鳞癌不同临床特征分组间细胞因子表达差异分析
        4.4 肺鳞癌不同临床特征分组下细胞因子高低表达生存分析
    5. 小结
第二部分 细胞因子与免疫抑制剂疗效的相关性分析
    1. 材料与方法
        1.1 研究对象
        1.2 外周血检测项目-27种细胞因子(表2.1)
        1.3 数据分析方法
    2. 入组患者临床数据基线描述
        2.1 患者临床资料一般特征
        2.2 癌种,分期及病理
        2.3 治疗情况和免疫副反应情况
        2.4 疗效评价和无进展生存期
        2.5 各临床特征与疗效和生存的相关性分析
        2.6 癌症病人组初始细胞因子浓度与正常对照组细胞因子浓度差异分析
        2.7 小结
    3. 细胞因子与PFS的相关性分析
        3.1 初始细胞因子的浓度与PFS的相关性分析
        3.2 治疗后早期细胞因子的浓度变化与PFS的相关性分析
        3.3 治疗后10-12周细胞因子的浓度变化与PFS的相关性分析
    4. 细胞因子与疗效的相关性分析
        4.1 初始细胞因子的浓度与疗效相关性分析
        4.2 治疗早期细胞因子的浓度变化与疗效的相关性分析
        4.3 治疗后10-12周细胞因子的浓度变化与疗效的相关性分析
第三部分 讨论
第四部分 结论
参考文献
综述: PD-1/PD-L1抑制剂疗效相关的生物预测标志物的研究进展
    参考文献
攻读学位期间发表文章情况
致谢



本文编号：3936621