鞣花酸靶向肝细胞癌信号通路的转录组学分析

发布时间：2024-04-19 01:09

　　鞣花酸是一种新兴的、发挥抗癌活性的纯天然小分子药物。近些年来,鞣花酸抑制癌症的机制和靶点被越来越系统地探究。基于我们近期的研究,鞣花酸可以显著抑制肝癌细胞的增殖和肿瘤生长,促进肝癌细胞的周期阻滞、凋亡以及DNA损伤,却对正常肝细胞造成极小的影响。为了探究这一现象所涉及的细胞内部信号传导的变化,尤其是鞣花酸的处理对肝癌细胞转录组水平的影响。在本研究中,我们对鞣花酸处理的HepG2细胞的转录组测序结果进行了差异表达基因的分析,同时与TCGA-LIHC数据库中的肝细胞癌症样本特征进行一系列分析对比:1.在DESeq差异分析下,对比50μM鞣花酸处理的HepG2细胞和作为对照组的DMSO处理的HepG2细胞的转录组测序结果,我们发现共有6127个显著变化的差异表达基因,其中经过鞣花酸处理后上调的差异表达基因有3385个,下调的差异表达基因有2742个;在TCGA-LIHC数据库中,对比肿瘤组织和癌旁组织的转录组测序数据,共有2179个显著变化的差异表达基因,其中包括在肿瘤中表达较高的差异表达基因1306个,在肿瘤中表达较低的差异表达基因873个。2.因为鞣花酸对肝细胞癌的抑制作用远远大于正常肝...

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１?ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ数据集差异表达基因火山图??在ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ数据集中包含１３０６个显著上调的基因和８７３个显著影下调的基因

ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃａｒｃｉｎｏｍａ?ｆｒｏｍ?ＴＣＧＡ）是?ＴＣＧＡ?中??的肝细胞癌样品数据库，我们从ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ数据库中下载／?３７０个病人的４２０个样本??（３７０个丨沖瘤样本和５０个癌旁组织样本）的ＲＮＡ－ｓｅｑ检测义件和临床数掘文件。通过??Ｒ语言对ＴＣＧＡ－Ｌ....

图２?ＥＡ处理ＨｅｐＧ２细胞ＲＮＡ－ｓｅｑ数据集差异表达基因火山图??在ＥＡ处理ＨｅｐＧ２细胞ＲＮＡ－ｓｅｑ数据集中包含３３８５个显著上调的基因和２７４２个显著影下调的??

?东北林业大学硕士学位论文???ＲＮＡ－ｓｅｑ??（ＥＡ?ｖｅｒｓｕｓ?ＤＭＳＯ）??？?Ｄｏｗｎ??２＿?．?ｉ?．?？?Ｎｏ?ｃｈａｎｇｅ??；；？？．?＊?＊Ｕｐ??？?二．，?ｔ＊．?＊?．??ｍ??—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ??－５?０?５?１０??Ｉｏｇ２ＦＣ??图２?ＥＡ处理....

图６具有相反变化差异表达基因的ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析??图屮所心为依据ＦＤＲ?Ｈ彳低到高排列前２０的ＧＯ?ｔｅｒｍｓ和ＫＥＧＧ?ｔｅｒｍｓ

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图１１在ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ数据集中调控细胞周期和ＤＮＡ复制的２３个基因的多因素Ｃｏｘ分析??依据Ｃｏｘ模型分析结果，通过Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ法绘制生存曲线，病人被分为高风险组和低风险??

?东北林业大学硕士学位论文???ｉｊＩＩＩ??１３－?＇＇?＇?ｈ－?／?／??６?一，?－?／?／??Ｓ?广ｈｒｆ?２?｛／?ＡＵＣ?＝?０．７１８??ｇｌ??％＼ｙ?????？?２?４?６?８?１０?〇．〇?０．２?０．４?０．６?０．８?１．０??Ｔｉｍｅ?（ｙｅａｒｓ）?....

本文编号：3958001