TCR免疫组库对食管鳞癌免疫治疗的指导研究

发布时间：2017-09-04 05:38

  本文关键词：TCR免疫组库对食管鳞癌免疫治疗的指导研究

  更多相关文章： 高通量测序 T细胞受体 肿瘤异质性 肿瘤浸润淋巴细胞 食管鳞癌

【摘要】：研究背景食管癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,据统计2012年全世界大约有455,800新发病例,因食管癌死亡人数达到400,200。亚洲东部和非洲东南部属于发病率较高地区,我国的发病率约为20/10万。食管癌病理类型主要为鳞癌和腺癌,我国90%以上为食管鳞癌(oesophageal squamous cell carcinoma, ESCC)。由于缺乏有效的治疗手段使食管癌预后较差。应用肿瘤浸润淋巴细胞(tumour infiltrating lymphocytes, TILs)的免疫疗法在一些实体瘤病人中取得持久的疗效,提示我们免疫治疗应用于临床治疗ESCC的可能性。由于对食管癌(TILs)的克隆性、特异性和空间异质性等基本生物学特征所知甚少,因此有必要对T细胞受体(T cell receptor, TCR)与肿瘤抗原相互作用进行深入解析。目的通过对食管鳞癌DNA提取物直接进行T细胞受体β链(T-cell receptor beta-chain, TCRb)深度测序,评估这种方法对肿瘤内T细胞克隆性和空间异质性的透析能力。材料和方法我们的研究纳入7例病理诊断为食管癌的患者,通过手术收集肿瘤组织、癌旁正常组织及外周血标本,每例肿瘤组织按标准选取4-6个区域。组织石蜡切片判断CD3+T细胞的存在情况。通过多重PCR捕获和Illumina Hiseq2000测序平台对TCRb互补决定区3 (complementarity-determining region, CDR3)区进行深度测序并分析。同时我们将Patient 1肿瘤组织4个区域DNA提取物进行复测,评估抽样误差及测序技术引入的误差。结果7例ESCC患者每个样本测序所获得独特的TCRb序列(unique TCR β reads)数量是相似的,平均为99,899(四分位数间距为75,525-155,647)。所有的组织及血液样本中均可检测到大量T细胞克隆扩增,且肿瘤组织与正常组织T细胞克隆扩增性没有明显差异(肿瘤组织和其他组织克隆性分别为0.74和0.75;非配对t检验,P=0.275)。频率最高的前100 TCRb序列(top 100 TCR β sequences)在肿瘤组织、正常组织及外周血中所占比例分别为35.8%、31.4%及31.5%,相互之间没有明显差异(单向方差分析,P=0.402)。每个肿瘤组织中都能检测到的top 100序列(ubiquitous序列)在7例患者中所占比例从13-33%(均值为26%,标准差为0.06),67-87%(均值为74%,标准差为0.06)的T细胞克隆为多样性克隆。结论(1) ESCC患者肿瘤组织内TIL总体具有多样性。(2)肿瘤组织中T细胞克隆可能主要是由肿瘤抗原激活的。(3)TIL在ESCC患者肿瘤组织内分布具有空间异质性。(4) Ubiquitous T细胞克隆可能是由肿瘤特异性抗原激活的。
【关键词】：高通量测序 T细胞受体 肿瘤异质性 肿瘤浸润淋巴细胞 食管鳞癌
【学位授予单位】：山东大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R735.1
【目录】：

• 中文摘要6-8
• 英文摘要8-10
• 符号说明10-12
• 前言12-15
• 材料与方法15-29
• 实验结果29-39
• 讨论39-43
• 结论43-44
• 参考文献44-47
• 致谢47-49
• 攻读硕士期间发表的学术论文49-50
• 学位论文评阅及答辩情况表50

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 董淑晓;訾力;亓健;;原发性胃鳞癌的临床病理特点[J];中国临床医生;2011年11期

2 赵镇清;张熙曾;刘亦庸;;贲门鳞癌[J];中国肿瘤临床;1987年04期

3 王怀娥,任德印,崔允峰;肺炎样鳞癌误诊原因探讨(附5例报告)[J];医学影像学杂志;1994年03期

4 刘建良,周鑫官,张勤;贲门鳞癌的外科治疗[J];江苏医药;1995年08期

5 ;中咽部鳞癌前壁型的治疗[J];国外医学(耳鼻咽喉科学分册);1998年01期

6 ;鳞癌中人类乳头状瘤病毒的表达及P~(53)突变[J];国外医学(耳鼻咽喉科学分册);1999年01期

7 张地君,许速,徐小珂;表皮内鳞癌2例报告[J];皮肤病与性病;1999年01期

8 钱伟明;原发性附睾鳞癌1例[J];诊断病理学杂志;2002年04期

9 崔云龙,李强;胆囊鳞癌6例报告[J];天津医科大学学报;2003年04期

10 刘永祥;龟头部鳞癌误诊一例[J];临床误诊误治;2004年11期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 胡伟汉;徐韬;伍国号;郭朱明;高远红;王芳;蔡修宇;;151例下咽鳞癌的治疗与预后[A];2007第六届全国放射肿瘤学学术年会论文集[C];2007年

2 俞新民;;鳞癌1例[A];2009年浙江省皮肤病学术会议论文汇编[C];2009年

3 高明阳;;头部鳞癌伴嗜酸性粒细胞增多一例[A];2003中国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2003年

4 徐致祥;谭家驹;陈风兰;司建华;韩建英;;农家肥料污染水源诱发大小鼠前胃鳞癌[A];全国肿瘤流行病学和肿瘤病因学学术会议论文集[C];2007年

5 李梅娇;王鹏;符磊;吴伟伟;;伴有多脏器功能损害的老年鳞癌(翻花疮)患者的处理体会[A];2012全国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2012年

6 曾蕾;曾珠;赵琼;;EGFR突变的女性鳞癌臀肌转移1例并文献复习[A];中国肿瘤内科进展 中国肿瘤医师教育（2014）[C];2014年

7 贾军;杨世勇;张志明;;血管内皮生长因子在食管鳞癌中的表达及临床意义[A];2000全国肿瘤学术大会论文集[C];2000年

8 贾志新;;西黄丸配合化疗治疗下咽鳞癌1例[A];西黄丸临床应用研究论文集[C];2009年

9 姜玉章;熊化生;郭伟;胡传贤;金云;钱强;潘汉胤;;具家族史食管鳞癌及癌旁组织基因表达谱的初步研究[A];中国遗传学会功能基因组学研讨会论文集[C];2006年

10 温登瑰;王士杰;张立玮;王小玲;魏丽珍;邹文娣;秦鹏;;食管鳞癌家族性病例比散发病例发生年龄早、双灶同发率高以及预后差的特点提示抑癌基因第一次打击可作为遗传易感性的分子基础[A];中国第九届全国食管癌学术会议论文集[C];2009年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 上海龙华医院肿瘤科 王菊勇 副研究员;胃鳞癌的治疗[N];上海中医药报;2010年

2 记者 王丹 通讯员 高翠峰;食管鳞癌基因组研究告别“盲人摸象”[N];健康报;2014年

3 记者 谭嘉;中国人食管鳞癌重要突变基因被揭示[N];健康报;2014年

4 杨国平;食管鳞癌非手术治疗取得新进展[N];健康报;2014年

5 黄春燕;50岁以上男性易发头皮鳞癌[N];健康时报;2007年

6 吴一福;HSP70异常表达与外阴鳞癌发生发展有关[N];中国医药报;2006年

7 东南大学附属中大医院临床肿瘤中心主任 李苏宜　整理 本报记者程守勤;食管鳞癌化疗释疑[N];健康报;2010年

8 记者 刘传书;我科学家发现食管鳞癌相关基因突变[N];科技日报;2014年

9 记者 白毅;8个重要基因突变与食管鳞癌相关[N];中国医药报;2014年

10 记者 田雅婷;8个与食管鳞癌相关基因突变被发现[N];光明日报;2014年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 范虹;TRPC6通道对食管鳞癌的增殖及放疗增敏作用的研究[D];复旦大学;2013年

2 王娜娜;RACK1在食管鳞癌预后及进展中的作用及与上皮间质转化的相关性研究[D];山东大学;2015年

3 孟慧;miR-330-3p和miR-26b在食管鳞癌中的功能及其调控机制探讨[D];第三军医大学;2015年

4 周韶梅;miR-100在食管鳞癌中的调控作用及机制研究[D];北京工业大学;2015年

5 曾薇;食管鳞癌中Survivin对NF-κB p65调控机制的研究[D];新疆医科大学;2015年

6 杨宏丽;PRKDC、XRCC4多态性与中国安阳地区食管鳞癌发生风险关联性研究[D];山东大学;2015年

7 崔瑶;STAT3对缺氧诱导食管鳞癌上皮间质转化的调控作用[D];郑州大学;2016年

8 杨璇;miR-1207-5p对食管鳞癌发生的影响[D];郑州大学;2016年

9 江亚南;T-LAK细胞来源的蛋白激酶(TOPK)在食管鳞癌增殖中的功能研究[D];郑州大学;2016年

10 宁忠华;系统性炎症和临床病理因素对食管鳞癌的预后影响[D];苏州大学;2016年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 范玉宏;Caveolin-1在食管鳞癌浸润进展中的作用研究[D];河北医科大学;2015年

2 张广钊;抗感染治疗对兔舌VX-2鳞癌炎症组织中MMP9、VEGF表达的影响[D];遵义医学院;2016年

3 周莹;c-met siRNA转染对食管鳞癌细胞生物学特性的影响[D];新疆医科大学;2016年

4 闫坤;扩散峰度成像与宫颈癌病理学特征相关性的初步探索[D];兰州大学;2016年

5 蔡履娟;EGFR、Her-2及c-Fos在食管鳞癌中的表达及意义[D];福建医科大学;2015年

6 韩煌煌;JWA等基因多态性与食管鳞癌发生及预后相关性研究[D];福建医科大学;2015年

7 夏海峰;癌基因RMP在食管鳞癌中的表达及与肿瘤侵袭转移及EMT相关性研究[D];苏州大学;2016年

8 陈增超;TCR免疫组库对食管鳞癌免疫治疗的指导研究[D];山东大学;2016年

9 韩利会;术前全身炎症反应相关指标在食管鳞癌中的临床价值[D];山东大学;2016年

10 贺璐璐;食管鳞癌KYSE150细胞与M_2型巨噬细胞对淋巴管内皮细胞的协同影响[D];郑州大学;2016年

，

本文编号：789695