云南宣威肺癌相关LncRNAs的初步筛选及表达研究

发布时间：2017-09-08 16:46

  本文关键词：云南宣威肺癌相关LncRNAs的初步筛选及表达研究

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【摘要】：背景和目的：在我国,云南宣威是肺癌的高发区,以非小细胞肺癌为主。有资料显示：在云南宣威,男性肺癌的平均死亡率为98.10/10万,女性肺癌的平均死亡率为83.28/10万。肺癌的发生一般是城市高于农村,而在云南宣威,不吸烟的女性肺癌死亡率也很高,能达到120/10万,且最高的能达到400/10万,是中国其它地区的20倍,居世界之首。造成宣威肺癌高死亡率的主要原因是患者确诊时已处于癌症晚期阶段,肿瘤细胞已发生了侵袭和转移,缺乏有效的治疗措施。因此,对宣威肺癌发生发展机制的研究尤为重要。本课题首先对LncRNAs的结构、功能、机制进行分析,然后应用LncRNAs芯片对云南宣威肺癌组织中差异表达的LncRNAs进行筛选分析,接着应用实时荧光定量PCR技术验证基因芯片筛选的结果,了解其在云南宣威肺癌发生发展中的作用,为进一步深入研究宣威肺癌的发病机制,为早期诊断和治疗提供科学依据。研究方法：1.利用LncRNAs芯片(AGI_LncRNAs+mRNA_4×180k)筛选5对云南宣威肺癌癌组织及癌旁正常组织中表达差异的LncRNAs和mRNA,认为差异水平≥2的是有意义的,筛选出有差异表达的基因；2.利用实时荧光定量PCR (RT-PCR)对筛选出的关键LncRNAs分子的表达进行验证,并探讨其在宣威肺癌组织中的表达水平与癌旁正常组织中的相关性；3.对患者临床病例资料进行统计分析,研究筛选出的关键LncRNAs分子的表达差异水平与患者的性别、年龄、吸烟、淋巴结转移情况、临床分期和组织学类型等相关性。结果：1.以LncRNAs芯片结果为基础,在云南宣威肺癌中获得了1544个异常表达的LncRNAs和1997个mRNA,根据差异倍数≥2和原始信号值≥50,筛选出367个异常表达的LncRNAs,其中表达上调的有133个,表达下调的有234个；筛选出1038个异常表达的LncRNAs,其中表达上调的有269个,表达下调的有769个。2.根据LncRNAs和mRNA共表达分析,再结合相关文献,筛选出6个具有研究价值的LncRNAs分子,其中表达上调的有SGOL1-AS1、SNHG4和PVT1：表达下调的有FENDRR、H19和PWRN1。3.通过实时荧光定量PCR (real-time quantitative PCR, RT-PCR)技术检测筛选出的6个LncRNAs在云南宣威肺癌癌组织及癌旁组织中的表达,结果显示在宣威肺癌组织中SGOL1-AS1、SNHG4、PVT1表达上调,FENDRR、H19、PWRN1表达下调,与芯片结果相符,说明芯片结果可靠。4. SGOL1-AS1、SNHG4、PVT1、FENDRR、H19等与患者临床病理特征无明显相关性,而PWRN1与患者肿块大小有一定的相关性。结论：1.利用LncRNAs芯片发现云南宣威肺癌组织中确实存在大量表达上调或者下调的LncRNAs。2.利用实时荧光定量PCR (RT-PCR)技术对其中的六个LncRNAs进行验证,该结果与基因芯片结果一致,为进一步研究LncRNAs与云南宣威肺癌发生发展机制提供了基础。3.对患者临床病例资料进行统计分析,结果显示6个LncRNAs分子的表达差异水平与患者的性别、年龄、吸烟、淋巴结转移情况、组织学类型无相关性。而PWRN1的表达差异水平与患者肿块大小有关。
【关键词】：云南宣威肺癌 长链非编码RNA 实时荧光定量PCR
【学位授予单位】：昆明医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R734.2
【目录】：

• 缩略词表5-7
• 中文摘要7-9
• 英文摘要9-12
• 前言12-18
• 第一部分18-33
• 1、实验材料19-20
• 2、实验方法20-23
• 3、实验结果23-30
• 4、讨论30-33
• 第二部分33-56
• 1、实验材料33-35
• 2、实验方法35-42
• 3、实验结果42-52
• 4、讨论52-56
• 结论56-57
• 参考文献57-65
• 文献综述65-76
• 参考文献73-76
• 攻读学位期间发表文章情况76-77
• 附件77-79
• 致谢79

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 董志伟;乔友林;李连弟;王国清;张思维;孟祥柱;李纪宾;;中国癌症高发现场报告[J];中国肿瘤;2009年01期

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本文编号：815152