ERAP基因多态性与非小细胞肺癌发生发展的相关性研究

发布时间：2017-09-08 19:06

  本文关键词：ERAP基因多态性与非小细胞肺癌发生发展的相关性研究

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【摘要】：背景肺癌是一种严重威胁人类健康的恶性肿瘤,全球肺癌的发病率及死亡率一直呈持续上升趋势。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占所有肺癌的80%以上。内源性抗原肽的加工提呈过程在机体的抗肿瘤免疫应答中发挥着重要作用。内质网氨肽酶(endoplasmic reticulum aminopeptidase, ERAP)是抗原提呈过程中的一个重要蛋白分子：在细胞内质网中,ERAP蛋白将多肽抗原修剪到合适长度,使其能够结合到人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)Ⅰ类分子上,形成HLAI类分子-抗原肽复合物,随后呈递到细胞表面被T细胞识别,产生特定的免疫应答反应。ERAP基因的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)可影响抗原提呈过程,最终导致疾病的发生及转归有所差异。目前对于ERAP1基因的研究主要集中于强直性脊柱炎等自身免疫性疾病,对于ERAP2基因的研究较少。ERAP基因多态性是否会通过影响抗原提呈途径,从而与非小细胞性肺癌的患病风险具有相关性,有待于进一步探讨。本实验对ERAP1、ERAP2基因与非小细胞性肺癌发生发展的相关性进行研究,为进一步研究抗原提呈通路相关基因在机体抗肿瘤免疫中的作用奠定基础。方法以云南地区汉族人群中非小细胞肺癌患者342例、健康对照组324例为研究对象,采用Taq Man探针基因分型方法对ERAP1基因4个SNP位点rs27044、 rs30187、rs26653、rs26618和ERAP2基因2个SNP位点rs2549782. rs2248374进行基因分型,并构建单倍型,研究评估ERAP基因多态性与非小细胞肺癌的发生发展的相关性。结果(1)病例组和对照组ERAP1基因的四个SNP位点.ERAP2基因的两个SNP位点基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,实验所选择的人群具有代表性；(2)ERAP1基因rs27044、rs30187、rs26618和rs26653的基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P0.05)；rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC、 GTTC单倍型频率差异有统计学意义(P0.05)；(3)ERAP2基因rs2248374的等位基因频率差异有统计学意义(P0.05),rs2549782的基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P0.05),rs2248374/rs2549782-AG、GT单倍型频率差异有统计学意义(P0.05)；(4) ERAP1基因的四个SNP位点的基因型和等位基因频率分布在腺癌和鳞癌患者中无统计学意义,在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小细胞肺癌患者中也无统计学意义(P0.05)；(5)ERAP2基因的两个SNP位点的等位基因频率在腺癌和鳞癌患者中有统计学意义(P0.05),在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小细胞肺癌患者中无统计学意义(P0.05)。结论ERAP基因多态性与非小细胞肺癌的发生具有相关性,ERAP1基因rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC单倍型可能增加非小细胞肺癌的患病风险,而GTTC单倍型可能具有保护性作用；ERAP2基因rs2248374/rs2549782-AG单倍型可能增加非小细胞肺癌的患病风险,而GT单倍型可能具有保护性作用；ERAP2基因rs2248374、rs2549782两个位点可能与非小细胞肺癌的病理类型有关。
【关键词】：非小细胞肺癌 内质网氨肽酶基因 单核苷酸多态性 关联研究
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R734.2
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 前言9-13
• 1、肺癌概述9
• 2、抗原提呈通路相关基因及内源性抗原加工提呈的机制9-11
• 3、ERAP基因与非小细胞肺癌11-13
• 实验材料和方法13-19
• (一) 实验材料13-14
• 1、实验对象13
• 2、主要试剂13
• 3、主要仪器13-14
• (二) 实验方法14-19
• 1、临床资料收集14
• 2、血液标本采集14
• 3、DNA的提取及定量14-16
• 4、基因分型16-18
• 5、统计学处理18-19
• 实验结果及分析19-35
• (一) 研究对象的一般资料19
• (二) TaqMan-MGB探针探针基因分型结果19-35
• 1、各SNP位点分型结果19-23
• 2、病例组和对照组ERAP1、ERAP2基因的Hardy-Weinberg平衡检验23-24
• 3、ERAP1基因多态性位点在病例组与对照组中的等位基因频率和基因型频率24
• 4、ERAP1基因在病例组和对照组中4个多态性位点的连锁不平衡分析24-27
• 5、病例组与对照组中ERAP1基因多态性位点单倍型频率统计分析27
• 6、ERAP1基因多态性位点与非小细胞肺癌相关临床参数的关系27-30
• 7、ERAP2基因多态性位点在病例组与对照组中的等位基因频率和基因型频率30
• 8、ERAP2基因在病例组和对照组中2个多态性位点的连锁不平衡分析30-32
• 9、病例组与对照组中ERAP2基因多态性位点单倍型频率统计分析32
• 10、ERAP2基因多态性位点与非小细胞肺癌相关临床参数的关系32-35
• 讨论35-40
• 小结与展望40-41
• 参考文献41-44
• 论文综述44-53
• 参考文献49-53
• 附录53-55
• 致谢55-56
• 研究生简历56-57

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

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本文编号：815778