RYBP基因多态性与非小细胞肺癌发生、发展的关系

发布时间：2017-10-09 04:17

  本文关键词：RYBP基因多态性与非小细胞肺癌发生、发展的关系

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【摘要】：目的肺癌是当今世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,其死亡率位居于恶性肿瘤之首。目前非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)占全部肺癌的80%左右,总体的五年生存率较低(大约16%)。除了环境因素,越来越多的研究表明遗传因素在肺癌的易感性和预后中起到了重要作用。非小细胞肺癌的主要治疗手段是通过外科手术治疗辅助以新辅助化疗、放射治疗、辅助化疗、和靶向治疗等多种方式。尽管这些年医学界在非小细胞肺癌的早期诊断、根治术式、辅助化疗、放射化疗和靶向治疗等方面取得了一定的发展,但是非小细胞肺癌的发病率和死亡率依然居高不下,因此,寻找非小细胞肺癌新的诊断与治疗靶点,是一项非常重要且有实验室和临床意义的工作。RYBP是近年新识别的多梳蛋白(Pc G)家族成员,除了参与Pc G抑制复合物1(PRC1)的组成和抑制逆转录功能外,还与细胞凋亡和侵袭有关。截至目前RYBP在肿瘤领域的研究不多而且存在矛盾,作为新的候选抑癌基因,其临床意义有待阐明。在本研究中,我们以Tag SNP结合潜在功能学SNP为选点策略,通过病例-对照研究设计和前瞻性队列研究设计探讨RYBP基因多态性的改变与非小细胞肺癌遗传易感性、预后之间的关联,确定真正有意义的SNP位点,并确定RYBP m RNA和蛋白表达与SNP的关系,再用TCGA数据库进行验证分析,以期为非小细胞肺癌的三级预防提供科学依据,为合理的临床决策和个体化治疗提供线索。方法1.在天津医科大学肿瘤医院分子流行病学研究平台中选取原发性非小细胞肺癌603例,社区来源的按照性别、年龄匹配正常对照661例。采用双盲法,由专业人员进行流行病学调查。2.利用生物信息学技术,筛选出RYBP基因的多态位点,进行连锁不平衡位点预测,应用Taq Man基因分型技术检测SNP位点基因型。通过比较病例组和对照组基因型分布频率的差别,计算各种基因型所致非小细胞肺癌的相对危险度,分析RYBP基因SNP与非小细胞肺癌发病、预后的关系。分别用组织芯片技术和实时定量PCR技术测量蛋白的表达和m RNA的表达情况。3.所有数据采用SPSS统计软件包(Version 19.0,SPSS Inc.,Chicago,IL,USA)和Graphpad Prism 5.0(Graphpad Software Inc,La Jolla,CA)进行统计分析。病例组和对照组的一般人口学特征、主要环境因素、研究对象基因型的比较采用χ2检验。NSCLC危险因素分析分别应用单因素和多因素的非条件Logistic回归分析估计危险度(Odds Ratio,OR),调整OR值(Adjusted Odds Ratio,ORa)及其95%置信区间(95%Confidence Intervals,95%CI)。以Kaplan-Meier方法绘制生存曲线并以Log-rank法检验生存时间之间的差异。单因素和多因素Cox回归计算风险回归比例(Hazard Ratio,HR),调整HR值(Adjusted Hazard Ratio,HRa)及其95%置信区间分析各种因素对非小细胞肺癌预后的影响。全部检验均为双侧检验,检验水准α=0.05,P0.05为差异有统计学意义。结果1、RYBP rs4676875,RYBP rs12631820,RYBP rs2118593,RYBP rs4677152基因多态性与降低非小细胞肺癌发病的危险性有关。2、分层分析发现,rs4676875位点和男性、年龄≤60、年龄60、无吸烟史与无肿瘤家族史的NSCLC发病相关;rs12631820位点和男性、年龄≤60、年龄60、无吸烟史与无肿瘤家族史的NSCLC发病相关;rs2118593位点和男性、女性、年龄≤60、年龄60、无吸烟史、有吸烟史与无肿瘤家族史的NSCLC发病相关;rs4677152和男性、年龄≤60、年龄60、无吸烟史、有肿瘤家族史与无肿瘤家族史的NSCLC发病相关;rs17009699和男性、年龄≤60与无肿瘤家族史的NSCLC发病相关。基因位点-位点联合作用分析表明,与不携带保护型的个体相比,携带高保护基因型的数量多达到3个位点时,NSCLC的患病风险减少了91%(OR=0.09,95%CI:0.03-0.27)。3、RYBP位点rs4676875、rs12631820、rs2118593、rs4677152、rs12956、rs17009699基因多态性与非小细胞肺癌的预后无关(P0.05)。4、分层分析发现,RYBP位点rs4676875与BMI24非小细胞肺癌的预后相关;rs12631820与BMI24非小细胞肺癌的预后相关;rs2118593与临床Ⅰ+Ⅱ期的非小细胞肺癌的预后相关;rs4677152与女性、腺癌的非小细胞肺癌的预后相关。5、在女性组中RYBP rs2118593的基因型与RYBP m RNA的表达相关(P0.05)。RYBP rs2118593的基因型与RYBP基因TMA得分相关(P0.05)。6、TCGA数据库中RYBP在NSCLC中的平均表达水平低于癌旁组织(P0.05)。结论1、RYBP基因多态性与非小细胞肺癌发病相关。2、RYBP基因多态性与非小细胞肺癌预后相关。3、RYBP基因多态性与RYBP m RNA和蛋白表达相关。
【关键词】：非小细胞肺癌 RYBP 单核苷酸多态性 遗传易感性 预后
【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R734.2
【目录】：

• 中文摘要4-7
• Abstract7-12
• 缩略语/符号说明12-14
• 前言14-20
• 研究现状、成果14-18
• 研究目的、方法18-20
• 一、RYBP基因SNP与NSCLC发病的关系20-44
• 1.1 对象和方法20-29
• 1.1.1 研究对象20-22
• 1.1.2 实验方法22-29
• 1.1.3 统计分析29
• 1.2 结果29-40
• 1.2.1 研究对象的基本情况29-30
• 1.2.2 RYBP基因相关位点的SNP与NSCLC易感性的分析30-40
• 1.3 讨论40-43
• 1.3.1 非小细胞肺癌与环境因素的易感性40-41
• 1.3.2 RYBP基因多态性与NSCLC发病的相关性41-42
• 1.3.3 RYBP基因位点-位点联合作用的分析42-43
• 1.4 小结43-44
• 二、RYBP基因SNP与NSCLC预后的关系44-57
• 2.1 对象和方法44-46
• 2.1.1 研究对象44-45
• 2.1.2 实验方法45
• 2.1.3 统计分析45-46
• 2.2 结果46-54
• 2.2.1 研究对象的一般特征描述46-47
• 2.2.2 RYBP基因SNP与NSCLC患者总体生产率的关系47-48
• 2.2.3 相关因素分层分析RYBP基因的SNP与NSCLC预后的关系48-54
• 2.3 讨论54-55
• 2.4 小结55-57
• 三、RYBP表达与SNP关系及其在TCGA中的研究57-66
• 3.1 对象和方法57-58
• 3.1.1 研究对象57
• 3.1.2 实验方法57-58
• 3.1.3 统计分析58
• 3.2 结果58-64
• 3.2.1 RYBP mRNA的表达与SNP的表达58-61
• 3.2.2 RYBP基因TMA得分与SNP的关系61
• 3.2.3 TCGA中RYBP在癌与癌旁的表达及其与NSCLC预后的关系61-63
• 3.2.4 SNP的功能预测63-64
• 3.3 讨论64-65
• 3.4 小结65-66
• 结论66-67
• 参考文献67-76
• 发表论文和参加科研情况说明76-77
• 综述 PcG蛋白复合体与癌症77-96
• 综述参考文献87-96
• 致谢96-97
• 个人简历97

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

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本文编号：998119